chr7:4965511 4965760 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(44)
TESTES

Sense strand
TCGTAAGATGAGGGGAAAACTGGGGTCCAGTAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATGTTGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGACAAGGGGGTGGGGGTGGGGGCATTAGCGGGGCGGTGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGGCTATACAGA
...........................................((((((.(((..((......))..)))))).)))....................((((....)))).............................................................................................................................................
...........................................44...............................................................109...........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt................................... 26 att 75.00 0.00 6.00 3.00 31.00 4.00 5.00 2.00 1.00 5.00 8.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - 5.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa.................................. 27 aaaa 36.00 0.00 2.00 5.00 10.00 2.00 4.00 - - 5.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat................................... 26 aat 28.00 0.00 2.00 - 13.00 - 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt................................... 26 agt 16.00 0.00 2.00 1.00 - - 6.00 - - 4.00 - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCgctc...................................... 21 gctc 11.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta.................................. 27 atta 10.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTattt.................................. 27 attt 9.00 0.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa.................................. 29 aaaa 8.00 0.00 - 1.00 - 4.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt................................... 28 att 7.00 0.00 - - 3.00 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGGaa....... 30 aa 5.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaga.................................. 27 aaga 5.00 0.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATG................................................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGaa........ 29 aa 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt................................... 28 agt 4.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt................................... 27 att 3.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat................................... 27 aat 3.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATGT.................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCggg.......... 27 ggg 3.00 0.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GAGTATGTTGTGTGAAGTTTGCCTGA................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaata.................................. 27 aata 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgta................ 21 tgta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACccag............. 24 ccag 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatga.................................. 27 atga 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat................................... 28 aat 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGACA................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGACTT...................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCgg........... 26 gg 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGACAA................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TGCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGCT........................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta.................................. 29 atta 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt................................... 26 catt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTTGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGT........................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt.................................. 29 aatt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaa............................. 30 taa 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTtt.............. 23 tt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa............................ 33 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GAGTATGTTGTGTGAAGTTTGCCTG................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTGCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGCT........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGtc........ 29 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgttt.................................. 27 gttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt.................................. 28 aatt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtctt.................................................................... 31 tctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCaagt.......... 27 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtggc.................................................................... 31 tggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGGAGGCAGAGGCAAGCGAAcata........................................................... 25 cata 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAttta............................ 31 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGACa....................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGaa......... 28 aa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgata.................................. 27 gata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCgt........... 26 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt................................... 29 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGaa......... 29 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGTGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGAC.................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggta................................. 28 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgtta................................. 27 gtta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAAGATGAGGGGAAAACTGGGGTC............................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGata............ 26 ata 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAc........... 26 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa............................ 31 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtttc................ 21 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaga............................ 33 taga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgaag................................. 26 gaag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTTGTGTGAAGTTTGCCTGAGag............................................................................................................................................................................. 24 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACTGgggc........... 25 gggc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TGCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGCTT.......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtaaa.................................................................... 30 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGAAAAGCTTACCTTGACAAGGGGGTGG........................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGaaaa...... 28 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATGTTG................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTTGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTG.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCaaa........... 27 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCaat........... 25 aat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgtc....................................... 24 gtc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACTGCCAGGGtatt..... 21 tatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtcac.................................................................... 31 tcac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt................................... 24 catt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCaaaa...................................... 29 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgact................................. 27 gact 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCgagt.......... 27 gagt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGccgc................................... 25 ccgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat................................... 29 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggcg................................. 26 ggcg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCgggc......... 26 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTtaa............. 24 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGctaa................................... 24 ctaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGtaa....... 30 taa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................GAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGgaa.................................... 30 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcggg............. 24 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAcg.......... 27 cg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgttt................................. 28 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGt......... 28 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGcgc........ 29 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GTGAGTTCCAGGACTGCCAGGGCTATc.... 27 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcaga............. 24 caga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGggt........................... 32 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTact................................... 27 act 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGaga........ 29 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgcg....................................... 24 gcg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaat................................... 26 caat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CAGTAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATG................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGA......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGAGGGGAAAACTGGGGTCCAGTAAGAa...................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCTTGACAAGGGGGTGGGGGTGG.................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GGTTGCGCACGCCgg................................................................................................. 15 gg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTaaa...................................... 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtatt.................................................................... 30 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGtttt.................................................................... 31 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCc............ 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaca................................... 26 caca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATGTa................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGACAAG............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................GCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGC............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGACTT...................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAGTTCCAGGACTGCCAGGGCTAaaa... 27 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCgta.......... 27 gta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGAC.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCg............ 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GTGGTTGCGCACGCCggta............................................................................................... 19 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct................ 21 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGGAGGCAGAGGCAAGCGAggtc............................................................ 24 ggtc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCggta...................................... 23 ggta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................CTTACCTTGACAAGGGGGTGGGGGTG................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcgc.................................... 27 cgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgcg.................................. 26 gcg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AAGGGGGTGGGGGTGGGGGCAT............................................................................................................................ 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCGTAAGATGAGGGGAAAACTGGGGTCCAGTAAGACAACAGAGGCCCAGAGTATGTTGTGTGAAGTTTGCCTGAGGTGTGACTTAAAGAAAAGCTTACCTTGACAAGGGGGTGGGGGTGGGGGCATTAGCGGGGCGGTGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGGGCTATACAGA
...........................................((((((.(((..((......))..)))))).)))....................((((....)))).............................................................................................................................................
...........................................44...............................................................109...........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgt........................... 27 gcgt 148.00 0.00 59.00 43.00 - 1.00 1.00 21.00 19.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtt........................... 26 gtt 12.00 0.00 5.00 2.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgta........................... 26 gta 11.00 0.00 3.00 5.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgcgt.......................... 28 gcgt 11.00 0.00 4.00 6.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcat........................... 27 gcat 9.00 0.00 4.00 3.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgt............................ 26 gcgt 7.00 0.00 1.00 2.00 - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcta........................... 27 gcta 7.00 0.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GTGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAaa......................................................................................... 27 aa 6.00 0.00 2.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa........................... 27 gtaa 5.00 0.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgg........................... 27 gcgg 4.00 0.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActa........................... 29 cta 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActaa........................... 30 ctaa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcta............................. 25 gcta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAaaat............................................. 26 aaat 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAGa........... 30 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GTGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAtga......................................................................................... 28 tga 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTACAAAGTGAGTTCCAGGACTGCCAa............ 28 a 2.00 0.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcga........................... 29 cga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgtta............................ 26 gtta 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................AGGCAGAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAaa.................................................. 32 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgtgt......................... 29 gtgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga........................... 26 gga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgctt............................ 26 gctt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta........................... 27 gtta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAGtgg................................................. 26 tgg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcag........................... 27 gcag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CCAGGACTGCCAGGGCTATACAGtt. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAtct......................................................................................... 26 tct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCGCACGCCTTTAATCCCAgaaa......................................................................................... 23 gaaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcgg............................. 25 gcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta........................... 26 gtta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgcgt......................... 29 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgggg........................... 31 gggg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGcga.............................. 26 cga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgg............................ 26 gcgg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgg.......................... 30 gg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GTGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAtgt......................................................................................... 28 tgt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgagt........................... 27 gagt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcat........................... 29 cat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAggc........................... 26 ggc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcagt........................... 30 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACTGCCAGGGCTATACAGga. 26 ga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................AGAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTaaaa..................................................... 27 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcta............................ 26 gcta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GCGAATTTCTGAGTTCGAaca.................................................. 21 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................AGAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAGttt................................................. 30 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa........................... 26 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GGGAGGCAGAGGCAAGCGAATTTCTGcagt......................................................... 30 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgg..................... 30 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtt..................... 32 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgtta.......................... 27 gtta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGTTGCGCACGCCTTTAATCCCAaa......................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGCGCACGCCTTTAATCCCAta......................................................................................... 22 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GAATTTCTGAGTTCGAcccc.................................................. 20 cccc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCGCACGCCTTTAATCCCAGCAtac...................................................................................... 26 tac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat........................... 25 gat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGaaaa....................................... 32 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAcga................................ 24 cga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGac............................ 31 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCGCACGCCTTTAATCCCAgac......................................................................................... 23 gac 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga........................... 30 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtaa..................... 32 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GTTGCGCACGCCTTTAATCCCAaaaa......................................................................................... 26 aaaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAat.................................................. 26 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTGCGCACGCCTTTAATCCCAattt......................................................................................... 25 attt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTGCGCACGCCTTTAATCCCAta......................................................................................... 23 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat........................... 30 gat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GGAGGCAGAGGCAAGCGAATTTCTGtg......................................................... 27 tg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat........................... 26 gat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcatt........................... 30 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCGCACGCCTTTAATCCCAtgt......................................................................................... 23 tgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaaa........................... 26 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAacta.................................................. 21 acta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgtt............................. 24 gtt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgccg.......................... 28 gccg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaat........................... 27 gaat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgga............................ 25 gga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAa.................................................. 25 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgctt........................... 27 gctt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgta.......................... 27 gta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgttt........................... 27 gttt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcaa........................... 26 gcaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtgg........................... 27 gtgg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgtt.......................... 27 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGcttt............................ 29 cttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcaaa........................... 30 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtta..................... 32 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GAGGCAAGCGAATTTCTGAGTTCGAa.................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................CGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCaa.......................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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