chr7:4744551 4744972 +
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
CCCGCCTCTCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAGAGGAGGTGAGTGTGAGGCCTCTGTCCGTCCCGCGTGGCCGCCATCTCGCTCCCACGGCCTCGGTCTCCTGCCTGGGCTTTCTCTCCTTGTACCCAAGCACCATTCGCTGCCCTCATTCCCCACCGGAAGTGGGGCCTCAGCGTCCCTTCCCCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGCCTGCCTCCTTTGCTCACCCTTTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTTTTTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAGCCGCCTGTCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCACACCCCCCCCCCCCCCGGCTTCTCCCCAGCCGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCC
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................((....((((......((((((........)))).))........(((......)))...............))))....))......................................................
.................................................................................................................................................................................................................................................................................274...............................................................................................372................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 25 5 18.00 18.00 - 0.40 - 2.60 0.60 0.20 - 1.40 0.80 - 4.80 - 1.00 0.80 1.00 0.20 2.00 - 0.20 0.20 - - - 0.20 - - 0.60 0.20 - - - - - 0.20 - - 0.20 - - - - - 0.20 0.20 - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 16.00 16.00 - - 6.00 1.00 - 2.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 - - 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCGGCTTCTCCacca.................................................. 17 acca 8.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAGC.................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGC.................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCCATAGGGAGAGGAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 5.00 5.00 - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGG..................................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGCTCGCTTTTTCCCAACGGTGC................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 3.25 3.25 - - - - 1.00 0.75 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACT..... 26 5 3.20 3.20 - - - 0.60 - - - 0.60 0.40 - - - - - 0.20 0.40 - - 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - 0.20 - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 26 5 3.00 3.00 - - - 0.60 - - - 1.20 - - 0.40 - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCG...................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAG..................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTC............ 27 5 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 0.60 - - 1.00 - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTCGCTTTTTCCCAACGGTGCTG................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAGC.................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGTGAGGCCTCTGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGC... 26 5 2.60 2.60 - - - 0.20 - 0.60 - 0.20 0.20 - - - - 0.40 0.40 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTTT................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGC................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGCC................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGCCT.................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGTCTCCGGCCGggg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 15 ggg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTG........................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCCat 26 at 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCC....................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CCGCCATAGGGAGAGGAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGC.................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AGGGAGAGGAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGCC................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCA...................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGC................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGTGGATGGTCGTCtgga........ 20 tgga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGTTAGCTCGGCCTGCCTCCTTTGC....................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTC. 28 5 1.60 1.60 - - - 0.40 - 0.20 - 0.20 - - 0.20 - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 26 5 1.60 1.60 - - - 0.20 - - - 0.40 - - 0.20 - - 0.20 - - 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTG.... 25 5 1.60 1.60 - - - 0.20 - - - 0.40 - - - - - - 0.20 0.20 - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTC............ 29 5 1.60 1.60 - - - 0.20 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGT............. 28 5 1.40 1.40 - - - 0.40 - - - 0.40 - - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCG.......... 21 5 1.20 1.20 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 28 5 1.20 1.20 - - - 0.20 - - - 0.40 - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TGCCTCCTTTGCTCACCCTTTCCTCGG........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCT.................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TCCTTGTACCCAAGCACCATTCGCTGCCC......................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 12.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCCATAGGGAGAGGAGGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CTCCGGCCGCCATAGGGAGAGGAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGTGAGGCCTCTGTCCGTCCC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGC....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTT................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGGAGGTGAGTGTGAGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTC..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CCGTCTCCGGCCGggg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 16 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGTGAGGCCTCTGTCCGTCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CCTTTGCTCACCCTTTCCTCGGCCGT.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CGCCATAGGGAGAGGAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................TTTGCTCACCCTTTCCTCGGCCGTGTA................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCA...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GTGAGGCCTCTGTCCGTCCCGCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................AACGGTGCTGCCGCTTACCCAGCCGCC................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAAAGCTCTTGCTCGCTTTTTCC............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGC.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGtt........ 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCTCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CCTTTGCTCACCCTTTCCTCGGCCGTG................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGg........ 25 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCCcg 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACATCT................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGC... 28 5 1.00 1.00 - 0.60 - - - - - - - - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGCTCACCCTTTCCTCGGCCGTGTA................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTT................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ATAGGGAGAGGAGGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAGa.................................................................................................................... 28 a 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCGGCCGTGTAAAGCTCTTGC....................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCC....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACATCT................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAGt.................................................................................................................... 28 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACC........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGTGTGAGGCCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTCTTTCTGACATCTTTCACACCCCC........................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGGTCGTCCGGAACTGC... 20 5 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGTGAGGCCTCTGTCCGTCCCGCGTGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCCATAGGGAGAGGAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCTCGGCCGTGTAAAGC............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAACGGTGCTGCCGCTTACtcag..................................................................................................................... 26 tcag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CCGTCTCCGGCCGggt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 16 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTCGCTTTTTCCCAACGGTGCTGCCGC............................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCcg..................................................................................................................... 27 cg 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCATAGGGAGAGGAGGTGAGTGTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 25 5 1.00 1.00 - - - 0.20 - - - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGTGCTGCCGCTTACCCAGCCGCCT............................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GCTCACCCTTTCCTCGGCCGTGTAAAGC............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCCATAGGGAGAGGAGGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCCac 26 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCCATAGGGAGAGGAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTTTT............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAACGGTGCTGCCGCTTACCCAG..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGCTCGCTTTTTCCCAACGGTGCTG................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCG...................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGTGCTGCCGCTTACCCAGC.................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTG.... 27 5 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 0.20 - 0.20 - - 0.20 - 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................CCATCTCGCTCCCACGGCCTCGGTCTCC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGGCCGCCATAGGGAGAGGAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 16.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGGAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGGAGGTGAGTGTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGTGTGAGGCCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGTGTGAGGCCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGGAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCGTGTCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCGggc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 ggc 1.00 16.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTTCTCCCCAGCCGCCGCCATGT...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTCTTTCTGACATCTTTCACACCCC......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCATAGGGAGAGGAGGTGAGTGTGAGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CATAGGGAGAGGAGGTGAGTGTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCTCGGCC................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 5 0.80 0.80 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 27 5 0.80 0.80 - - - - - - - 0.20 - - 0.40 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 5 0.80 0.80 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - 0.20 - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 21 5 0.80 0.80 - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 22 5 0.80 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 25 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTG.... 30 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGT............. 26 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTC............... 26 5 0.60 0.60 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCC 27 5 0.60 0.60 - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 19 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCC 25 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGTGGATGGTCGTCCGGAACT..... 23 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCTCTCTTTCCGTCTCCGGCCGCCAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.50 0.50 - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 - - - - - - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCC........... 22 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 24 5 0.40 0.40 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTC. 30 5 0.40 0.40 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACT..... 25 5 0.40 0.40 - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCCGCCATAGGGAGAGGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAC...... 24 5 0.40 0.40 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 26 5 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAACTG.... 20 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 23 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 25 5 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAt...... 27 t 0.40 3.00 - - - - - - - - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCT.. 37 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCC 26 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCC........... 26 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAG........................ 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAGAa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 0.25 3.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGcga........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 cga 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTCCGTCTCCGGCCGCCATAGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 19 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAcc...... 25 cc 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCG.............. 27 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTC. 29 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGGTCGTCCGGAAC...... 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAt....... 26 t 0.20 1.00 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTCGTCCGGAACTGCTC. 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAg....... 26 g 0.20 1.00 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGG................. 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAg...... 25 g 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCG.............. 20 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 32 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 20 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCG.......... 23 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 22 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCC........... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGt... 26 t 0.20 1.60 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACT..... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACT..... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAA....... 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTG.... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGG................. 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAA....... 27 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAa...... 25 a 0.20 0.40 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATGGTCGTCCGGAACTGC... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGtcc. 28 tcc 0.20 1.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 23 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGG......... 35 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTCaa 30 aa 0.20 1.60 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCt........... 30 t 0.20 1.60 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGGATGGTCGTCCGGAACTGa... 26 a 0.20 1.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
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............................CCGGCCGCCATAGGGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGATGGTCGTCCGGAACTGCTC. 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGAAt...... 28 t 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Antisense strand
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.................................................................................................................................................................................................................................................................................274...............................................................................................372................................................
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGA.................... 28 4 194.75 194.75 132.50 19.75 - 1.75 1.75 0.25 15.75 1.75 0.75 11.00 - - - 2.25 0.25 - 0.25 1.25 - - - 2.00 - 1.00 1.75 - - - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCA............................................................................... 27 1 23.00 23.00 - - - 4.00 - - - 6.00 - 8.00 2.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTA........................................................................................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 6.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCA............................................................................... 28 1 10.00 10.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGA.................... 29 4 8.50 8.50 6.25 - - 0.50 - - 0.50 0.50 - - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCA............................................................................... 26 1 8.00 8.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAGCT........................................................................................................................................................................................................ 24 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCA............................................................................... 25 1 7.00 7.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAg.................... 28 g 7.00 0.00 1.00 - - - - - - 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACATC.................................................................................... 26 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGTCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACAT..................................................................................... 29 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCA......................... 23 4 4.25 4.25 2.25 1.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCACA............................................................................. 27 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GCTTTCTCTCCTTGTACCCAAGCACCA................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCCCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTA........................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAa.................... 28 a 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAa.................... 29 a 2.50 0.00 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAgg.................... 29 gg 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTTTCCCAACGGTGCTGCCGCTTA.......................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCCTTCCCCCTTCTAAGTCTCCG................................................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTA........................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCTTTGCTCACCCTTTCCT........................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAt.................... 30 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGG..................... 27 4 1.75 1.75 0.50 0.75 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCA......................... 24 4 1.50 1.50 - 0.50 - - - - 0.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CCTCTCGTGTCTCTCTTTCCGTCT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCGCCATGTCCGCGCATCT............................ 23 4 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCCTCTCGTGTCTCTCTTTCCGTCT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GCCGTGTAAAGCTCTTGCTCGCTTTTT.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGCTTCTTTCTGACATCTTTCAagtg............................................................................... 29 agtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCTTCTTTCTGACATCTTTCACA............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCAGCGTCCCTTCCCCCTTCTAA.......................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAcg........................................................................................................................................................................................................... 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCGCTGCCCTCATTCCCCACCGGAAt......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTCTTTCTGACATCTTTCAagcc............................................................................... 26 agcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTAAAGCTCTTGCTCGCTTTTTCCCA.......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CGCCTCTCGTGTCTCTCTTTCCGTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CCTCAGCGTCCCTTCCCCCTTCTAA.......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTgggg....................... 28 gggg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CGTCCCGCGTGGCcccg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 cccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTA........................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GTCCCTTCCCCCTTCTAAGTCTCCG................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGTCCACGGCCTGCTTCTTTCTGACA...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGCTCACCCTTTCCTCGGCCGTGTA................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAt.................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTCTGACATCTttgc................................................................................... 17 ttgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAg......................... 26 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCCCCTTCTAAGTCTCCGCGGTGTTAt........................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGA.................... 26 4 0.75 0.75 - - - 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAa.................... 30 a 0.75 0.00 - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGC.......................... 22 4 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCG.......... 29 5 0.40 0.40 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTG...................... 26 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCA......................... 26 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGT....................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCATGTCCGCGCATCTGCA......................... 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCGCCATGTCCGCGCATCTGCAGTG...................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCATCTGCAGTGGATGGTCGTCCGGA........ 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGA.................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATGTCCGCGCATCTGCAGTGGAcgc.................... 28 cgc 0.20 0.00 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -