(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(41)
TESTES

Sense strand
CTCCCAGAGAGCTCCGCTCCTTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCCGGGAGTAAGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGGATCAAGTAGTTCCAGGAAACTGTGGGCTGATCCGTGGCTGAGTCTCAGTGGAGCCTTGGGGACCGGTAATCCGTCCCAGAATAGGGGCGCGGCAGTCACGAGGGTGCAGAGCAGGGGTGATACGAGAGTGTTAGAGGTCACCGCAGTAGTCCCCAAGGGTGACTGTCTTCTCACCTCTCTAGGAATCTCTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGGTG
...................................................................(((.((((.((((...(((((((((....))).))))))..((.((.(((..(((..((((.(((((.((((.(((....)))))))......))))).......))))..)))..)))..)).)).((((((....))))))..)))).))))))).....................................................................................
..................................................51...............................................................................................................................................................................228...............................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGC........... 27 1 40.00 40.00 1.00 2.00 4.00 2.00 3.00 - 2.00 5.00 1.00 1.00 3.00 2.00 1.00 - 4.00 1.00 3.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 27 1 27.00 27.00 8.00 7.00 - 5.00 - - 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 30 1 20.00 20.00 - 3.00 - 2.00 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - 4.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGt........ 30 t 14.00 0.00 1.00 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTG...... 25 1 11.00 11.00 1.00 - 8.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 28 1 11.00 11.00 2.00 2.00 - 2.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 11.00 11.00 4.00 2.00 - 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCCG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 4.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCCGG..................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCC.......... 28 1 6.00 6.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 31 1 5.00 5.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 27 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGC........... 28 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGt........ 27 t 5.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGGTTTGGAGCTCGCGGG......................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGG......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAG............ 21 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCTCGCGGGGATCAAGTAGTTCCAGGAAACTGT................................................................................................................................................................................................................. 33 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ACAGGTTTGGAGCTCGCGG.......................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTTGGAGCTCGCGGGGA....................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGGATC..................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGG.. 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAG............ 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACGAGAGTGTTAGAGGTCACCGCAGT..................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTG...... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGGTTTGGAGCTCGCGGGG........................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACGAGAGTGTTAGAGGTCACC.......................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCG......... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................CCAAGAACAAGATGGCCGGGAGaatc.............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aatc 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGGTGt 27 t 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AACTGTGGGCTGATCCG...................................................................................................................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGGAGTAAGTACAGG........................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGC..... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGC..... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................CAGGAAACTGTGGGCTGATCCGTGGC.................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGACTGTCTTCTCACCTCTCTAGt................................................. 24 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTG... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGG.............. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAG............... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGGTTTGGAGCTCGCGG.......................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGa....... 24 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGGCCGGGAGTAAGTACA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCttt....... 31 ttt 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGC..... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGCCTGGGCGAAGGAGCC.......... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCG......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGC..... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCT.... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGc....... 28 c 1.00 27.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGt.. 26 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGA............. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCttt....... 32 ttt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGG........................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCG......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGG.............. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGt........... 27 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCTGATCCGTGGCTGAG.............................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAA................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCa......... 29 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGt........ 31 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGG.................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTG...... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................................GATGGCCGGGAGTAAGTA............................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTG...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAATCTCTGCCTTCCTCAAGAAT........................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................AAGAACAAGATGGCCGGGAGTAAGTACAGGT....................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AAGTAGTTCCAGGAAACTGTGGGCTGAT......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGGAAACTGTGGGCTGATCCGTGGCT................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAA................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ATACGAGAGTGTTAGAGGTCACC.......................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................CTGTGGGCTGATCCGTGGCTGAGTCTC.......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGa........... 27 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACGAGAGTGTTAGAGGTCA............................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CAAGAACAAGATGGCCGGGAGaatc.............................................................................................................................................................................................................................................................. 25 aatc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGG........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ATACGAGAGTGTTAGAGGTCAC........................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGcgt..... 30 cgt 1.00 27.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACGAGAGTGTTAGAGGTCAC........................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGGT. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGCGA................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAt................ 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGGA....................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGGCCGGGAGTAAGTACAGGTTTGG................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAATCTCTGCCTTCCTCAAGAATGC......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGa....... 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGGAGC........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAGGTTTGGAGCTCGCGGG......................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATGCCTGGGCcatg............... 18 catg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGC................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TTGGAGCTCGCGGGGA....................................................................................................................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGGGATCAAGTAGTTCCA.......................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAG............ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGAGTCTCAGTGGAGCCTTGGGGACCGG...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCC.......... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGTTCCAGGAAACTGTGGGCTGA.......................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGT....... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTAAGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGG........................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGG.............. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGGTTTGGAGCTCGCGGGGA....................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGC................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CAGGAAACTGTGGGCTGA.......................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCCCAGAGAGCTCCGCTCCTTGTCGCCGCCAAGAACAAGATGGCCGGGAGTAAGTACAGGTTTGGAGCTCGCGGGGATCAAGTAGTTCCAGGAAACTGTGGGCTGATCCGTGGCTGAGTCTCAGTGGAGCCTTGGGGACCGGTAATCCGTCCCAGAATAGGGGCGCGGCAGTCACGAGGGTGCAGAGCAGGGGTGATACGAGAGTGTTAGAGGTCACCGCAGTAGTCCCCAAGGGTGACTGTCTTCTCACCTCTCTAGGAATCTCTGCCTTCCTCAAGAATGCCTGGGCGAAGGAGCCGGTGCTGGTG
...................................................................(((.((((.((((...(((((((((....))).))))))..((.((.(((..(((..((((.(((((.((((.(((....)))))))......))))).......))))..)))..)))..)).)).((((((....))))))..)))).))))))).....................................................................................
..................................................51...............................................................................................................................................................................228...............................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
...................................................................GCTCGCGGGGATCAAGTAGTTCCAGGA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -