| Gene: Cops7a | ID: uc009dsr.1_intron_6_0_chr6_124914947_r | SPECIES: mm9 |
|
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|
(1) OTHER.ip |
(10) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(38) TESTES |
| GGTGACGGAGCGGCCGCCCCGCCCCGTGCGCTGGGAGACGAGGCTTCCAGGTAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTCCGGGGGTACGACCTGGCCTTGGGCGCAGACCCCGGCCGGTCCCGGGGCTGCCTCTTTAAGGGAGGGGGTGGAGCCGCGAGTCAGGCGCGAGGAGGTGAGGTCACGTGGGGGCGGCCACGTGCACGACTCGCGTCCCGAAGTGGGGGTTCGTCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCTATCTCTCCCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGCACGTGGTGGGGCTTGGGACTGGGCCCGGGATGACGGAGCGGGTGGGCGTGGCAGCCAGGATGGGGCTGGCTTGGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTAGACCTCAGGACCCCACTTACTCACTGCGGATGTGGCGGGGTCCCTCTTGAGCGTGCAGCTCCCGTCCCTTCGAGCTGACCACCCTCGCAGGGTCCAGGGACCTTTAGTTTCACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCATGAGTG .........................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((((((((..(((((((.......)))..))))..))))))))).(((((......))).))..))))))....................................................................................................................................................................................................................................... .........................................................................................................................................................................................................................................................................266..................................................................................351............................................................................................................................................................................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGC..................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGGGGTCCCTCTTGAGCGTGCAG........................................................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAATGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGACCCCACTTACTCACTGCGG........................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................GCAGTCGGTCCGGGGGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCG............... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGGGCCCGGGATGACGG.................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACC.................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CGTGCGCTGGGAGACGAGGCTTCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGCTTGGGACTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................GCGCTGGGAGACGAGa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 16 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGAGCGGGTGGGCGTGGC.................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTTTTAGACCTCAGGA........................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGAGCTGACCACCCTCGCAGGGTCCA..................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGAACTCAATGGGGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGGGCCCGGGATGACGGAG................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGATGGGGCTGGCTTG............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGGGCCCGGGATGACGGA................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................AGGCTTCCAGGTAGCCGTCGGTTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTTCACGTTCCTCTTTCCTTGC.................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGt..................... | 28 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................CACCATGTGCTATCTCTCCCTTCCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................CGGCCACGTGCACGg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGC..................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CCCGAAGTGGGGGTTCGTCGTC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGGGGTCCCTCTTGAGCG................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACTCACTGCGGATGTGGCGGGGg............................................................................................................................................ | 25 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................GAGACGAGGCTTCCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTTCACGTTCCTCTTTCCTTGCAGC................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCCCGGGATGACGGAGCGG............................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACTCACTGCGGATGTGGCGGGGTC........................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTCTTGGAACTCAATGGGGTGCAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCTCAGGACCCCACTTACTCACTGC.......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCAtt.................. | 31 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ..................................................................GTCGGTCCGGGGGTACGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCG...................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAGACCTCAGGACCCCACTTACTCAC............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCC....................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................GCAGTCGGTCCGGGGGTACGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCAATGGGGTGCACGTGGTGt............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GTCAGGCGCGAGGAGGTGAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCCAGAAATCTTGAGGCCAGA............................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCGGtt............ | 29 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGAACTCAATGGGGTGCACG................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTCCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TCCGGGGGTACGACCTGGCCTTGGGCGCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACCCCACTTACTCACTGCGGATG..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACt.................. | 24 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTTTTAGACCTCAGGACC......................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TGCAGTCGGTCCGGGGGTACGACCTG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................TCATCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................CGTCCGGTAGACACCATGTGCTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GCCTTGGGCGCAGACCCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................CGGCCGGTCCCGGGGCcga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | cga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCTGACCACCCTCGCAGGGTCC...................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGGGCCCGGGATGACGGAGt............................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGAACTCAATGGGGTGCACGTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................ACGTGCACGACTCGCGTCCCGAAGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGGAGCGGGTGGGCGTGGCAG................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCG...................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGC..................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGGACTGGGCCCGGGATGACGG.................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................CGGTTGCAGTCGGTCCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGGGCCCGGGA........................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GGTGACGGAGCGGCCGCCCCGCCCCGTGCGCTGGGAGACGAGGCTTCCAGGTAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTCCGGGGGTACGACCTGGCCTTGGGCGCAGACCCCGGCCGGTCCCGGGGCTGCCTCTTTAAGGGAGGGGGTGGAGCCGCGAGTCAGGCGCGAGGAGGTGAGGTCACGTGGGGGCGGCCACGTGCACGACTCGCGTCCCGAAGTGGGGGTTCGTCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCTATCTCTCCCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAATGGGGTGCACGTGGTGGGGCTTGGGACTGGGCCCGGGATGACGGAGCGGGTGGGCGTGGCAGCCAGGATGGGGCTGGCTTGGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTAGACCTCAGGACCCCACTTACTCACTGCGGATGTGGCGGGGTCCCTCTTGAGCGTGCAGCTCCCGTCCCTTCGAGCTGACCACCCTCGCAGGGTCCAGGGACCTTTAGTTTCACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCATGAGTG .........................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((((((((..(((((((.......)))..))))..))))))))).(((((......))).))..))))))....................................................................................................................................................................................................................................... .........................................................................................................................................................................................................................................................................266..................................................................................351............................................................................................................................................................................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 16.00 | 16.00 | 8.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 13.00 | 13.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGGACCTTTAGtttt.......................................................................... | 18 | tttt | 9.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAA.......................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................GTGCTATCTCTCCCTTCCCTGGTTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGTCCCTTCGtga............................................................................................................. | 15 | tga | 4.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................GCCGTCGGTTGCAGTCGGTCCGGGGGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACCCTCGCAGGGTCCAGGGACCTTTA........................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................GTCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................CCCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GTCGTCCGGTAGACACCAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCTCGAGTTGCCTTTTAGACCTCA.............................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAATC....................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGTCCCTTCGtttt............................................................................................................. | 16 | tttt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCA............................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTTTAGTTTCACGTTCCTC............................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCGTCCCTTCGa............................................................................................................. | 15 | a | 2.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCA............................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCA...... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................GGTAGACACCATGTGctg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | ctg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCACCCTCGCAGGGTCCAGGGACCTTTA........................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAt............................................. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTGGTTCATCAGTCTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................CCAGGTAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCCCTTCCCTGGTTCATCAGTCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCTATCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAAT........................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................ATCTCTCCCTTCCCTGGTTCATCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTa....................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGCTATCTCTCCCTTCCCTGGTTCAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAATC....................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................GTCGGTTGCAGTCGGTCCGGGGGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCCCTCGAGTTGCCTTTTAGACCTCA.............................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAA......................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GGCCACGTGCACGACTCGCGTCCCGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTAGACC................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TCGTCGTCCGGTAGACACCATGTGCTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCGCACCTCGGCGCAGCCATGA... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCACGTTCCTCTTTgcaa.......................................................... | 18 | gcaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACTCAAg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAA......................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCGGATGTGGCGGGGTCCCTCTTGA................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGTTTCACGTTCCTCTTTCCTTGCA................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCACGTTCCTCTTTCCTTGCA................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................CAGGTAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTA..................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAa............................................. | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTA..................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGA........................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGGGGTTCGTCGTCGTCCGGTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCCGTCCCTTCGggc............................................................................................................. | 18 | ggc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................GCTATCTCTCCCTTCCCTGGTTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTGGAGGAGCCCTCGAGTTGCCTTTTA..................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTGCAGCTCCAGAAATCTTGAGGCCA.............................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAG............................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTCTTTCCTTGCAGCTCCAGAAA......................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GGTAGCCGTCGGTTGCAGTCGGTCCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCCTGGTTCATCAGTCTTGGAAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCAGAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCA...... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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