| Gene: Rab41 | ID: uc009ctz.1_intron_0_0_chr6_87741688_r | SPECIES: mm9 |
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(2) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(21) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) |
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| ...................................................................................................................................................TCCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCA................ | 29 | 1 | 8.00 | 8.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................CCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCAG............... | 29 | 1 | 7.00 | 7.00 | 4.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCAtt........................................................................... | 29 | tt | 7.00 | 0.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................CCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCAGC.............. | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................TCAGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAACA................... | 30 | 1 | 5.00 | 5.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGC................. | 29 | 1 | 5.00 | 5.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................................................................................................................................................CCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGC................. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................CATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTCCTCAGt..................................... | 29 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................TAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGT............................................ | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGGGTAGAGCACATGCTTAGCACATGCC....................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................CGTGGGTAGAGCACATGCTTAGCACAT............................................................... | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................CCCCAAGTTCAGTCCTCAGCACCAAAAA........................................................................................................................ | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCA................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................TCAGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGA................................................................................................................. | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................AGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAGGAG............................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................TAGAGCACATGCTTAGCACATGCCAG.......................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCAta........................................................................... | 29 | ta | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCAGCTTC........... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................CCCAAGTTCAGTCCTCAGCACCAAAAA........................................................................................................................ | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................AACAGAACAGCAGCTTCTGGGGTGTGTC | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TCAGCACCAAAAACAACAGAGGAGCAGC......................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................................................TCAGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAG................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................TAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTt...................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCcc............................................................................ | 28 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GGGTAGAGCACATGCTTAGCACATGCCA...................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................GCACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTCCTCc.................................................................................................................................. | 30 | c | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................CAGAGGAGCAGCTTTCGAGGG................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................CAACAGAGGAGCAGCTTTCGAGGGa............................................................................................... | 25 | a | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................CACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTC...................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................CCCCAAGTTCAGTCCTCAGCACCAAAA.............................. | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TTAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTC.......................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................AACAGAGGAGCAGCTTTCGAGGGGCAGa........................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CACATGCTTAGCACATGCCAGG.................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCACt........................................................................... | 29 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TCCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCgg............... | 30 | gg | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TTAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTCA......................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TGGGTAGAGCACATGCTTAGCACATGCCAG.......................................................... | 30 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGtt............................................................................. | 27 | tt | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAG............................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCACATGCTTAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAGGAGCAGCTTTCGAGGGGCAGCTCGTGGGTAGAGCACATGCTTAGCACATGCCAGGCCCCAAGTTCAGTCCTCAGCACCAAAAACAACAGAACAGCAGCTTCTGGGGTGTGTC .............................................................................(((((..(((((....(((((....((((.((.((((....)))).)).))))....))))))))))...)))))........................................ ...............................................................64......................................................................................152...................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................TCCTCAGCACCAAAAA........................................................................................................................ | 16 | 19 | 0.63 | 0.63 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.63 |