(7)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(27)
TESTES

Sense strand
AACTACTTCCAATATTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGGAAGAACTTGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGTGAGTCTGACTTTGCAATTCAAACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAGGTCAGCATAGAAATTCCTCTTGTAGCATCCACTCCAGCCAATATTGAGTTATTCAGTGAAAATATAGATGAGTCTGCTTTAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACTTTGAAAAGGAAGAG
..................................................((((((.((.((.((.(((.....))).)).))))..))))))................(((...((((...)))).)))........................................................................................................................
..................................................51................................................................................133...................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGT........................................................................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 2.00 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTG............................................................................................................................................................................ 28 1 6.00 6.00 4.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTG.............................................................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ACACTAGAACTTGAAGCTCAAG................................................................................................................................ 22 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTG.............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGA......................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00
..............TTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGGA................................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGG................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGTG.......................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCAT................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACTT............. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AGCATCCACTCCAGCCAAT.............................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................ATTCAAACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGA.............................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGT............................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGAAACTTCAGTGCATCAGGAAGAACTT......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............TTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGGAt............................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GAAGAACTTGGTAAGGAAGA.............................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTTCAGTGCATCAGGAAGAACTTGGcat.................................................................................................................................................................................................... 29 cat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAG........................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACTTTGCAATTCAAACACTAGAACTT.......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCAGTGCATCAGGAAGAACTTGGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TTAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACTT............. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCAGTGAAAATATAGATGAGTCTGCTT......................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AAGGAGCAGAGGTCAGCATAGAAATTC........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGTG.......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................GCAATTCAAACACTAGAACTTGAAGC..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAGGTC..................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGGAAGAACCCAAACAAGCATT............................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACTTT............ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTCAAACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGC............................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................................TTAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACT.............. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ATCAGGAAGAACTTGGTAAGGAAGAAC............................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAGGT...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGCTCAAGGAGCAGAGGTCAGCAT................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCA................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TTCCTCTTGTAGCATCCAC........................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CATCAGGAAGAACTTGGTAAGGAAGAAC............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGTGAG........................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGT............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CAAACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCA........................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGt......................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCAAGGAGCAGAGGTCAGCATAGAAATT......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGA......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAGG....................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
................................................TGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTa.............................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................AACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGA......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGGAA............................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATATTGGAACAGAAACTTCAGTGCAT..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGTACACCAGTGACTTTGAAAAGGAAGA. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGAACTTGGTAAGGAAGAACCCAAAC...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCAGTGAAAATATAGATGAGTCTGCTT......................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCAGTGAAAATATAGATGAGTCTGCTTT........................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATATTGGAACAGAAACTTCAGTGCATC.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CAGCAGATGTACACCAGTGACT.............. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................CAGTGACTTTGAAAAG...... 16 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AACTACTTCCAATATTGGAACAGAAACTTCAGTGCATCAGGAAGAACTTGGTAAGGAAGAACCCAAACAAGCATTGTGTGAGTCTGACTTTGCAATTCAAACACTAGAACTTGAAGCTCAAGGAGCAGAGGTCAGCATAGAAATTCCTCTTGTAGCATCCACTCCAGCCAATATTGAGTTATTCAGTGAAAATATAGATGAGTCTGCTTTAAACCAGCAGATGTACACCAGTGACTTTGAAAAGGAAGAG
..................................................((((((.((.((.((.(((.....))).)).))))..))))))................(((...((((...)))).)))........................................................................................................................
..................................................51................................................................................133...................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.............................TGCATCAGGAAGAACgtc........................................................................................................................................................................................................... 18 gtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -