| Gene: Dctn1 | ID: uc009cmz.1_intron_12_0_chr6_83140792_f | SPECIES: mm9 | 
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  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (8)  OTHER.mut  | 
  
  
  (6)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (40)  TESTES  | 
  
  
| TGAATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTCTGAGAGCTTGACATCACGCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGGGACCAGCTGGCCCTGCCATGCTGACCTCCTGTGTGCTCTTCCCCACTCTGTGCCATCCAGGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGAC ............................................................((.(((((((.(((.((((.........))))..))).....))))))).))............................................................................................................................................................... ..................................................51............................................................113............................................................................................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. | 26 | 1 | 77.00 | 77.00 | 15.00 | 15.00 | 11.00 | - | 4.00 | 7.00 | 2.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ | 27 | 1 | 32.00 | 32.00 | 2.00 | 5.00 | 1.00 | 9.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAC....... | 27 | 1 | 22.00 | 22.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| .......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTG............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTT................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGt................ | 27 | t | 5.00 | 77.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCA.................. | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAAC........... | 33 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 30 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGaggt................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | aggt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAtg...... | 27 | tg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCT.................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTG.................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGC...................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGC................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACT.................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTC................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................................AGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGGa................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | a | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGAACGCACGGGAG.. | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGaa.......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | aa | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTT................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACG.......... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......AGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGt.............................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGC................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAG................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGagaa................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | agaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......TAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGt.............................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................................................ACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGG..... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCT................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..AATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGT.................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGaag......................................................................................................................................................................................................................... | 31 | aag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTC.................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGA. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............GAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGT....................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGA............... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGt.......................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAG....................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........AGGAGAAAGTGCGGGAG..................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGt............. | 30 | t | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGagt.................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | agt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... | 34 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................TTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGG.............................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................TGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTC................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................ACGGGAGACTGTGGaggg................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | aggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................GGAGACTGTGGGGGACTTGGaa.......................................................................................................................................................................................................................... | 22 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGG.... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGC................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................AAGCCATGAACGAGATGAACGAT.......................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................AACGATGAGCTGCAGGAGAAC........... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGA.................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................AGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTG.................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGG........................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................GCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGG.................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGC...................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................................................CATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................GATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGA........................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAC....... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCT..................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TTACGGGAGACTGTGGGGGACTT.............................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................................AGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACG.......... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGa........................................................................................................................................................................................................................... | 29 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGc............. | 30 | c | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGt............... | 28 | t | 1.00 | 32.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......TAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGtt............................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGATGAACGA........................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................TACGGGAGACTGTGGGGGAC................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................................................ACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................AAGCCATGAACGAGATGAAC............................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................ATGGAGACTGTTTGGAA......................................................................................................................................................................... | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| TGAATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTCTGAGAGCTTGACATCACGCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGGGACCAGCTGGCCCTGCCATGCTGACCTCCTGTGTGCTCTTCCCCACTCTGTGCCATCCAGGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGAC ............................................................((.(((((((.(((.((((.........))))..))).....))))))).))............................................................................................................................................................... ..................................................51............................................................113............................................................................................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | 
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