(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(40)
TESTES

Sense strand
TGAATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTCTGAGAGCTTGACATCACGCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGGGACCAGCTGGCCCTGCCATGCTGACCTCCTGTGTGCTCTTCCCCACTCTGTGCCATCCAGGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGAC
............................................................((.(((((((.(((.((((.........))))..))).....))))))).))...............................................................................................................................................................
..................................................51............................................................113............................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. 26 1 77.00 77.00 15.00 15.00 11.00 - 4.00 7.00 2.00 3.00 1.00 3.00 - 2.00 1.00 - 2.00 - - - 4.00 4.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ 27 1 32.00 32.00 2.00 5.00 1.00 9.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 4.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAC....... 27 1 22.00 22.00 3.00 1.00 3.00 - 2.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - -
.......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTG............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 8.00 8.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTT................................................................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. 27 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGt................ 27 t 5.00 77.00 2.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCA.................. 25 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAAC........... 33 1 4.00 4.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ 26 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... 25 1 4.00 4.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... 26 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGaggt................................................................................................................................................................................................................................. 18 aggt 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAtg...... 27 tg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCT.................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTG.................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGC...................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGC................... 24 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACT.................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTC................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................AGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGGa................................................................................................................................................................................................................................... 16 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGAACGCACGGGAG.. 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGaa.......................................................................................................................................................................................................................... 27 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTT................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACG.......... 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGt.............................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGC................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAG................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGagaa................................................................................................................................................................................................................................. 18 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGt.............................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................................................................................................................ACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGG..... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCT................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..AATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGT.................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGaag......................................................................................................................................................................................................................... 31 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTC.................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGA. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGT....................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAG................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGA............... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAG.............. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGt.......................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAG....................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGAGAAAGTGCGGGAG..................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGt............. 30 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGagt.................................................................................................................................................................................................................................. 17 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGG.............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTC................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACGGGAGACTGTGGaggg................................................................................................................................................................................................................................. 18 aggg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GGAGACTGTGGGGGACTTGGaa.......................................................................................................................................................................................................................... 22 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGG.... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GAACGAGATGAACGATGAGCTGC................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGCCATGAACGAGATGAACGAT.......................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAA............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGC...................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AACGATGAGCTGCAGGAGAAC........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGA.................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTG.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGG........................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGG.................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGC...................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................CATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA............... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................GATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGA........................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGG................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................GAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCAC....... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................ACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCT..................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTACGGGAGACTGTGGGGGACTT.............................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGCAGGAGAACGCACG...... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................AGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACG.......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGa........................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGc............. 30 c 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................................................................................................................................................................ATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGC......... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGt............... 28 t 1.00 32.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGtt............................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GGAAGCCATGAACGAGATGAACGA........................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TACGGGAGACTGTGGGGGAC................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGA............. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................ACGATGAGCTGCAGGAGAACGCA........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGCCATGAACGAGATGAAC............................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATGGAGACTGTTTGGAA......................................................................................................................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGAATCTAGAGGAGAAAGTGCGGGAGTTACGGGAGACTGTGGGGGACTTGGTAAGAAGAGAGCAGACCCCCGACTTCTCACCCTGATGGAGACTGTTTGGAAGGGGTCTTCTGAGAGCTTGACATCACGCCCTGTCCTTTGAGCAGGGACTGTGGTAAGGGGACCAGCTGGCCCTGCCATGCTGACCTCCTGTGTGCTCTTCCCCACTCTGTGCCATCCAGGAAGCCATGAACGAGATGAACGATGAGCTGCAGGAGAACGCACGGGAGAC
............................................................((.(((((((.(((.((((.........))))..))).....))))))).))...............................................................................................................................................................
..................................................51............................................................113............................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)