(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(33)
TESTES

Sense strand
TTCTGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGTAAGCCCAAGCCCTGAGCCTCTTCCCGACAGAAGCCTCCTCTGGAGCCGCTCAGGACCACGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATTTCCAACAACTCATTACCCTTGTGTGTTTCCCCAGGAACCTGGGAACCCGGACCAGTTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA
...............................................................................................................(((((((((.......)))).)))))....(((.(((.......))).))).........................................................
.........................................................................................................106............................................................169................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAA... 25 1 22.00 22.00 - 8.00 4.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAA.. 26 1 20.00 20.00 1.00 5.00 8.00 1.00 - - - - 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGTA.............................................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 2.00 - - - 4.00 - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATT.................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCAC............................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAG............................................................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - 2.00 - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATTT................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - 1.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACA.... 24 1 6.00 6.00 - 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAAC............................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGA.......................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAAC............................................................................................................................................................................ 25 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA 25 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGT....................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGaacc.................................................................................................................................................................... 30 aacc 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAA... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAGGAGCAGTTCCACAACGAAGTAAGC................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGaac..................................................................................................................................................................... 27 aac 3.00 0.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGaacc.................................................................................................................................................................... 28 aacc 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACG........................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAG. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAt. 27 t 2.00 20.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCA................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGa....................................................................................................................................................................... 27 a 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAA......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAACAACTCATTACCCTTGTGTGTT......................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAt.. 26 t 2.00 22.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAt.. 27 t 2.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACA.... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGAC..... 23 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TTCCAACAACTCATTACCCTTGTGTGT.......................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................ACAGAAGCCTCCTCTGGAGC......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGAGCCTCTTCCCGACAGAAGCCTCCT................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGCCCGTTTGTGTAGAGG.......................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GGCGCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGT.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................CCACGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCAT..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGGAGC....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGGAGCCGCTCAGGACCACGAAGTG...................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATTTt.................................................................................. 27 t 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACAACGAAGTAAGCCCAAGCCCTGA........................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACG........................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAA.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTCCCGACAGAAGCCTCCTCTGGAGCCGC...................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGGAGCCGCTCAGGACCACGAAGTGA..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTGTGTAGAGGAGCAGT.................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....CACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAG........................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCC.......................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAG. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...........................................................................................................CCACGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCC....................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACt........................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGGAGC....................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCC................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGGAGCCGCTCAGGACCACGAAGT....................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CCGGCGCCCGTTTGTGTA.............................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTTAGGTTCATCGTGGGACAAA.. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCAtgt............................................................................................................................................................................. 29 tgt 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGG.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACA.............................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATTTa.................................................................................. 27 a 1.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACA.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGTAAG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGaa...................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GTTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACA.... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTC.................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAAGCCCTGAGCCTttgg................................................................................................................................................ 18 ttgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................TTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAA............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CCATTTCCAACAACTCATTACCCTT................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAcaac..................................................................................................................................................................... 27 caac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ACCAGTTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGt...... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAG........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGTAAGC................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....CACACACCGGCGCCCGTTT................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGA............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAG........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCTGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGT............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAACAACTCATTACCCTTGTGTGT.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACA.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAGGAGCAGTTCCACAACGAAGaacc.................................................................................................................................................................... 26 aacc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAAt............................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCC....................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGTTCATCGTGGGACAAA.. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................................TCCACAACGAAGTAAGCCCAAGCCCTG......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCAC............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TACCCTTGTGTGTTTCCCCAGGAACCTGG.......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAcgt....................................................................................................................................................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAA............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGa....................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCC................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAG............................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGAC..... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................ACAACTCATTACCCTTGTGTGTT......................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGGA......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TAGAGGAGCAGTTCCACAACGA.......................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TCTTCCCGACAGAAGCCTCCTCTGGAGCC........................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAG. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCC................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCCCAAGCCCTGAGCCTCTTCCCGA............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCCCGACAGAAGCCTCCTCTGGAGCCG....................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CCAACAACTCATTACCCTTGTGTGTT......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTTAGGTTCATCGTGGGtcga... 25 tcga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTGTAGAGGAGCAGTTC.................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCA................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTCTGCACACACCGGCGCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACAACGAAGTAAGCCCAAGCCCTGAGCCTCTTCCCGACAGAAGCCTCCTCTGGAGCCGCTCAGGACCACGAAGTGAGGTCCTTTCCCTCCATTTCCAACAACTCATTACCCTTGTGTGTTTCCCCAGGAACCTGGGAACCCGGACCAGTTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAAAGA
...............................................................................................................(((((((((.......)))).)))))....(((.(((.......))).))).........................................................
.........................................................................................................106............................................................169................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
................GCCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCA................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................TCCCTCCATTTCCAACAACTCATTA..................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCCCTCCATTTCCAACAACTCATTACC................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AACCCGGACCAGTTCCTTTTAGGTTCA.............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCCATTTCCAACAACTCATTACCC.................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................CCTTTCCCTCCATTTCCAACAACTCA........................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................CCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCACA.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCGTTTGTGTAGAGGAGCAGTTCCA................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CCAGTTCCTTTTAGGTTCATCGTGGGACAA... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................................................CCCTCCATTTCCAACAACTCATTA..................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................................................................................................................GTCCTTTCCCTCCATTTCCAACAACTCA........................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -