(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(38)
TESTES

Sense strand
AAAGTTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCTGTATGTTTGGGTGTGAATACTAGGGAATACCAGTATCAATACATTCTAATTTATATTGCTACCTAATGCCGGGAAATTAAATGCTTATCTTTTGGATTTAAAGGTTATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 29 1 27.00 27.00 10.00 10.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................GAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 20 1 9.00 9.00 - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 18 1 7.00 7.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCTGT....................................................................................................................................................... 31 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 28 1 6.00 6.00 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGG........................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCT......................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGC.......................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAA................... 27 1 5.00 5.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGC........ 28 1 5.00 5.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ATGCGGGATCCTGCAAGCAA........................... 20 1 5.00 5.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCT....... 28 1 5.00 5.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCT............................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGG......... 27 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 30 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGC........ 27 1 4.00 4.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTG.......... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................AGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 17 2 3.50 3.50 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCA.................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................................................................................................................................................AGAGGATTTGGCTTTGTAA. 19 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATT............ 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAA. 23 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTG.... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGA................. 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GTTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAG..................................................................................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTT..... 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGGATTTGGCTTTGTAA. 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCT....... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTT........... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................ATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGG..................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTATGCGGGATCCTGCAAGC............................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTT..... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGA............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGA.............. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTA.. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCT....... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGtt........ 28 tt 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTaa..... 30 aa 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGGATTTGGCTTTGTAACta 20 ta 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 16 4 1.00 1.00 - - - - - 0.25 - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CGGGATCCTGCAAGCAAA.......................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGG......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATCAAGAGGATTTGGCTTTGT... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAAGATCAAGAGGATTTGGCTTT..... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCTG........................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTT........... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................AATGCTTATCTTTTGGATTTAAAG.................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAG.................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCaa........................................................................................................................................................ 29 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TCTGAAAGTCTGGCgct....................................................................................................................................................... 17 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGG............... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......TGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGA........................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAA....................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGC........ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAA. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAt....................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATCAAGAGGATTTGGCT....... 17 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGCCGGGAAATTAAATGCTTATCT............................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AAAAGATCAAGAGGATTTGGC........ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTA.. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AAGCAAAAGATCAAGAGGATTT........... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTT...... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGa........................................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GATCAAGAGGATTTGGCTTT..... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGC........ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTG............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGt......... 27 t 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCA.................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................ATCTTTTGGATTTAAAG.................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATCAAGAGGATTTGGCTTT..... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGTGTGAATACTAGGGAATACCAGTATCAAT................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCTGga...................................................................................................................................................... 32 ga 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGTt................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGA................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAA. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GAGAAACTACTATGAGCAATGGGGA........................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTACGTTAACTCTGAAAG................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGG......... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGT... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATC..................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGAT...................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAA...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCT....... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CAAGCAAAAGATCAAGAGGATTT........... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGTt................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGA............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTG...................................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGT... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCGGGATCCTGCAAGCA............................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGt........ 28 t 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGAGGATTTGGCTTTGTAAt 20 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GGAAAGCTCACAGACTGTGTGG..................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...................................................................................................................................................................................................CTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTT........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGAT...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGT.................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGAGGATTTGGCTTTGTAAC 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTA.. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................................................................................................................................................................................AGGATTTGGCTTTGTAAC 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGG......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................ATGGGGAAAGCTCACAGACTGTG........................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAAGAGGATTTGGCTTT..... 17 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGAGGATTTGGCTTTGTA.. 18 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ATGGGGAAAGCTCACAGACT........................................................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGATCAAGAGGATTTGG......... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................ATCTTTTGGATTTAA.................................................... 15 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CTTTTGGATTTAAAG.................................................. 15 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAAGTTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACTGTGTGGTACGTACGTTAACTCTGAAAGTCTGGCTGTATGTTTGGGTGTGAATACTAGGGAATACCAGTATCAATACATTCTAATTTATATTGCTACCTAATGCCGGGAAATTAAATGCTTATCTTTTGGATTTAAAGGTTATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
................................................TACGTACGTTAtct.......................................................................................................................................................................... 14 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -