(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(4)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
ATGTGCAGTAGGGAGTGGCGCGAGTCCACGGCTTCCTGCTGAAGAACATGGTGCGTTTGGGGGGGTTGTCTTGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTAAAGTTGTGCCTGAGGTTCAGCCAGGGGATGATGTAGCTAGGAATCTTGCCACTTGTAGTGCAAGGGAAGAAAGACACATGAAGGATAATTATAAAGCTCGTACTGAGGTAGCCAGGGAGGGAAGCTCT
......................................................................................................................((((..(((((.(((..((.....)).))).))))).....)))).......................................................................................
...................................................................................................................116.............................................................180....................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
.......................................................................TGTGCTTCCTGGACATGGA................................................................................................................................................................ 19 1 7.00 7.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAAAGCTCGTACTGAGGTAGCCAGG............ 25 1 5.00 5.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GAGTCCGTGCTGTTCCCTC............................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTCTTGTGCTTCCTGGA...................................................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAAAGCTCGTACTGAGGTAGCCAGGG........... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTAGCTAGGAATCTTGCCACTT.......................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGCTGAAGAACATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAAGTTGTGCCTGAGGTTCAGCCAG........................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TCCTGGACATGGAGTCCGTG......................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AGAACATGGTGCGTTTGG.............................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGAGTCCGTGCTGTTCCCTCAGAGT.......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGC........................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GGCTTCCTGCTGAAGAACATG........................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AACCTAAAGTTGTGCCTGAGG................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGAGTCCGTGCTGTTCCCTCAGA............................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGggc........................................................................................................................................................ 27 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................AGTCCACGGCTTCCTGCTGAAG.............................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TTCCTGGACATGGAGTCCGTGCT....................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTGCAGTAGGGAGTGGC....................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATGGAGTCCGTGCTGTTCCCT................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CAGGGGATGATGTAGCTAG........................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CTTCCTGCTGAAGAACATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGCTGAAGAACATGGTGC.................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CTGGACATGGAGTCCGTGCTG...................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGa........................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCTGAAGAACATGGTGCGTTTGGGG............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGAACATGGTGCGTTTGG.............................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CGGCTTCCTGCTGAAGAACATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAATTATAAAGCTCGTACTGAGGTAGC................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TAGGAATCTTGCCACTTGTAGTGCAAG................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GCTGAAGAACATGGTGCGTTTG............................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TCCTGCTGAAGAACATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCTGCTGAAGAACATGGTGCGTTTG............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGCGTTTGGGGGGGTTGTCTTGTG............................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAATTATAAAGCTCGTACTGAGatgc................. 26 atgc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GCGTTTGGGGGGGTTGTCTTGTG............................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCTTGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGT.......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AATTATAAAGCTCGTACTGAGGTAGC................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................CTGCTGAAGAACATGGTGCGTTTGG.............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CTGGACATGGAGTCCGTGC........................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................TTGTGCTTCCTGGACATG.................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGCGTTTGGGGGGGTTGTCTTGT................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AGGATAATTATAAAGCTCGTACTGAGGT................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCTGAAGAACATGGTGCGTTTGGG............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AGTGCAAGGGAAGAAAGACACATGA............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATGGTGCGTTTGGGGGGG......................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATGGAGTCCGTGCTGTTCC.................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAGGGAGGGAAGCT.. 18 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGC........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CTCGTACTGAGGTAGCCAGGGA.......... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATGGTGCGTTTGGGGGGGTTG...................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GGCTTCCTGCTGAAGAACATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CGGCTTCCTGCTGAAGAACATGGctgg................................................................................................................................................................................................... 27 ctgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................................................TGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGC........................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TAGTGCAAGGGAAGAAAGACACATGAA.............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................................................................................GAGTCCGTGCTGTTCCCT................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GAACATGGTGCGTTTGGGG............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AGTGCAAGGGAAGAAAGACACATGAAG............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................CGAGTCCACGGCTTCCTGCTGA................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGCTGAAGAACATGGTGCG................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................CTGCTGAAGAACATGGTGCGTTTG............................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCTTCCTGGACATGGAGT.............................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTCCTGCTGAAGAACATG........................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
.................................................................TTGTCTTGTGCTTCCTGG....................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AACATGGTGCGTTTGG.............................................................................................................................................................................................. 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCTTCCTGGACATGGA................................................................................................................................................................ 16 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ATGTGCAGTAGGGAGTGGCGCGAGTCCACGGCTTCCTGCTGAAGAACATGGTGCGTTTGGGGGGGTTGTCTTGTGCTTCCTGGACATGGAGTCCGTGCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTAAAGTTGTGCCTGAGGTTCAGCCAGGGGATGATGTAGCTAGGAATCTTGCCACTTGTAGTGCAAGGGAAGAAAGACACATGAAGGATAATTATAAAGCTCGTACTGAGGTAGCCAGGGAGGGAAGCTCT
......................................................................................................................((((..(((((.(((..((.....)).))).))))).....)))).......................................................................................
...................................................................................................................116.............................................................180....................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
................................................................................................GCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTA................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTA................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTGCCTGAGGTTCAGCCA......................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTA................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTAA............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GCTGTTCCCTCAGAGTTCCAAACCTAAA.............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -