(9)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(41)
TESTES

Sense strand
GGGGGATGGGCCAGGTCAGTACATTAGTTCATAGAAATGCCGTGTAGTGCATAGTCCTTATGAGTATTGTGTGCAAGCTCCACATGCCACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTTGTATTGTGTTTAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGAATTTCCGTTTGTTGATTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCTGCTCTTCTCCAGGT
..............................................(((((((((.((....)).)))))))))..((((.(((.(((........(((((....)))))))).)))...(((((....)))))..................))))..............................................................................................
..............................................47...........................................................................................................156............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGC................. 26 1 65.00 65.00 20.00 23.00 5.00 - 5.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATT.................................................................................................. 27 1 43.00 43.00 21.00 12.00 7.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCG................ 27 1 27.00 27.00 10.00 6.00 1.00 - 6.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGC............... 28 1 14.00 14.00 4.00 5.00 - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGG.................. 25 1 9.00 9.00 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGA....................... 26 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGC..................... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGC............... 27 1 6.00 6.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTG................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 - - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCAT................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAG................... 30 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAAC.................................... 31 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATA..................................................................................... 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTCCTTATGAGTATTGTGTGCAAGC............................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACA................................... 30 1 4.00 4.00 - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCT.............. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAA............................... 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAG................... 28 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGAAT................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCTt............. 29 t 2.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGt.................. 31 t 2.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAAC.................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGC......................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................ATCATTGAGCTGTCAGATA..................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................................TTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTGA........................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGAATT............................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCA.................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGt.................................................................................. 30 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGC................. 24 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGC................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTGAA.......................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTGtt.......................... 31 tt 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCTG............. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACGATCGGAACAGTAACT............................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCG................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGC..................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGG.................. 31 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACt................................... 30 t 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGCCACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTT....................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGt.................................................................................. 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TTTAAGAACACGCAGAGAGAAtt........................................................................................................ 23 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TAGCTCAAGTTGAGGCTTGTATTGTa............................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGA....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGTAACGATCGGAACAGTAACTGAAG......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCACATGCCACCCACTGTTAGCTCAAGat.............................................................................................................................................. 29 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGA...................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCA.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................................CAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCA......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACT............................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGC................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTGA................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTCCAGGTAACGATCGGAACAGT................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................ATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGC................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGA....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGG.................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCG........................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTaa................................................................................................ 29 aa 1.00 43.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTCCTTATGAGTATTGTGTGCAAGCTC.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCaa............... 28 aa 1.00 65.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTG............................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCG................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................................................................................................................................................ACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCTGC............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGCCACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGG.......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAG...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCT.............. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCt................ 27 t 1.00 65.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GTAACGATCGGAACAGTAACTGAAGG........................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGAT...................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAta........................................................................................................... 18 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTa................................................................................................. 28 a 1.00 43.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTT....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CGTGTAGTGCATAGTCCTTATGAGTATT...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACt................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................ATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGG.................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGATTTAAATCCTTTTCCAGG................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................AGGCGCTGCTCTTCTCCAGGT 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................CATTAGTTCATAGAAATGCCGTGTAGTGCAT...................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CATTAGTTCATAGAAATGCCGTGTA............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................ACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTT....................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTT....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTAACGATCGGAACAGTAACTGAAGG........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACA................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AAATATCATTGAGCTGTCAGATATGAATTT.............................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGA...................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TAGAAATGCCGTGTAGTGCATAGTC.................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGAGTATTGTGTGCAAGCTCCACATG.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATA..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGt............... 28 t 1.00 27.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGag................ 31 ag 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGG....................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCGGAACAGTAACTGAAGGAGCA.................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCA.................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TAGAAATGCCGTGTAGTGCATAGTCCTT............................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CCACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGC......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTTGTATTG................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATATCA.................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAAGAACACGCAGAGAGAAATAT...................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGA.................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTCCTTATGAGTATTGTGTGCAAactc.......................................................................................................................................................................... 29 actc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTGAGCa............................................................................................. 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATA..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATG................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTTCATAGAAATGCCGTGTAGTG......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................AATATCATTGAGCTGTCA......................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGGGGATGGGCCAGGTCAGTACATTAGTTCATAGAAATGCCGTGTAGTGCATAGTCCTTATGAGTATTGTGTGCAAGCTCCACATGCCACCCACTGTTAGCTCAAGTTGAGGCTTGTATTGTGTTTAAGAACACGCAGAGAGAAATATCATTGAGCTGTCAGATATGAATTTCCGTTTGTTGATTTAAATCCTTTTCCAGGTAACGATCGGAACAGTAACTGAAGGAGCAGGCGCTGCTCTTCTCCAGGT
..............................................(((((((((.((....)).)))))))))..((((.(((.(((........(((((....)))))))).)))...(((((....)))))..................))))..............................................................................................
..............................................47...........................................................................................................156............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
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Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
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25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
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6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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testes_rep2. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...................................................................................................................................CAGAGAGAAATATCaacc..................................................................................................... 18 aacc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -