chr5:147766710 147766993 +
(9)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(43)
TESTES

Sense strand
TGAGGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTGGGGCCAGCACTCGGCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATACCCCATCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTGTGACTCCCATCAGGGGCTCATCTGTTGGAGTGGATCCCCGTTGTGTAATGGGCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGCAGCTTGGCCTCTCGCCTCAGTGGGTA
......................................................(((((((.((((((((((..(((......))).)))))...))))).))).))))...(((((((((....(((......)))....)).))))))).....................................................................................................................................
..................................................51.....................................................................................................154................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAA........................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 4.00 4.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGG.......................................................................................................................................... 25 1 12.00 12.00 - - - - - - 1.00 1.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 10.00 10.00 1.00 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAG........................................................................................................................................... 24 1 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTGT...................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 1.00 2.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCA............................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 3.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGA.................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - 2.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAA........................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTGTG..................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTA....................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGC.......................... 29 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGAC............................ 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACG........................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAA...................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAt........................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 7.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................AGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGC.......................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTG....................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATG................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGC.............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................TGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTGt........................................................................................................................................................................................................................ 29 t 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGT........................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTGGGG...................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGA............................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................GAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCA................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTA....................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTGG........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAA................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACAGTGTCGTGCACGATCCC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGg.............................................................................................................................................................................................................................. 28 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTGTGt.................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAG..................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................AGAGCCCCTCGGGAGAGACGCAGCT...................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............TGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAG................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATCCCCGTTGTGTAATGGGCAACTC............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGggt...................................................................................................................................... 26 ggt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTC............................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGCAGCTT..................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAA........................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................AGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTG................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGc........................................................................................................................................ 27 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGCAGC....................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................ACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................AAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGC.......................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGC................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAG........................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................................................................TCTGTTGGAGTGGATCCCCGTTGT........................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGt...................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAA........................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TCAGGGGCTCATCTGTTGGAGTGGATC................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAAGAAGAGGATGAAGCTCAcagt........................................................................................................................................................................................................................................ 24 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................TGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTG......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTGCACGATCCCGggt.............................................................................................................................................................................................................................................................. 16 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCT.............................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAt...................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGG......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAttt........................................................................................................................................................................................................................................ 27 ttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTA....................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTA....................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAG............................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAG......................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTA....................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCT.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCATCTGTTGGAGTGGATCCCCGTTG............................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGT........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGA.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGAGGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAGCTGCTGGGGCCAGCACTCGGCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATACCCCATCCTGCGTGTCTGTGCCTGCTGAGGGTGTGACTCCCATCAGGGGCTCATCTGTTGGAGTGGATCCCCGTTGTGTAATGGGCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAGGTAAGAGCCCCTCGGGAGAGACGCAGCTTGGCCTCTCGCCTCAGTGGGTA
......................................................(((((((.((((((((((..(((......))).)))))...))))).))).))))...(((((((((....(((......)))....)).))))))).....................................................................................................................................
..................................................51.....................................................................................................154................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.....................................................................................GAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCA.......................................................................................................................................................................... 29 1 54.00 54.00 23.00 19.00 2.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCA.......................................................................................................................................................................... 27 1 17.00 17.00 8.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCA.......................................................................................................................................................................... 28 1 15.00 15.00 1.00 5.00 - 3.00 4.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 11.00 11.00 - - - - - - - - - 3.00 2.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 7.00 7.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................GGCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCA................................................................................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GAGGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGggaa............................................................................................................................................. 19 ggaa 5.00 0.00 - - - - - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCA................................................................................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CGGCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCAt................................................................................................................................................................................ 31 t 3.00 0.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCAGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTG..................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATA........................................................................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGGCGTCTGTCCATCCGCATACCCCA................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAGG................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCT............................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GGGCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCA........................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCAa.......................................................................................................................................................................... 29 a 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGCGTGTCTGTGCCTGC............................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................CGGCTGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCA................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGAA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCA.......................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCAt.......................................................................................................................................................................... 32 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................GCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCAa.......................................................................................................................................................................... 27 a 2.00 0.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGA........................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CTGTGCCTGCTGAGGGTGTGACTCCCA.............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAG.................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGggag............................................................................................................................................. 19 ggag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ACGATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCA............................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTG..................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATAC....................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GATCCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCA............................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAG....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATA........................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCT...................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAA...................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ATCAGGGGCTCATCTaaat................................................................................................................ 19 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............................................................................................TTGGCGTCTGTCCATCCGCATACCCCA................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCATCCGCATACCCCATCCTGCG............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGGCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTgt............................................................. 27 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATA........................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CATCAGGGGCTCATCTGTTGGAGTGGA..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCGACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCACT......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GAGGCACAGTGTCGTGCACGATCCCGACA.............................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GGAGTGGATCCCCGTTGTGTAATGGGCA................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAGGTA............................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GCGTCTGTCCATCCGCATACCCCATC................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCA.......................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GCTTGGCGTCTGTCCATCCGCATACCC..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCACTC........................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGAgga............................................................................................................................................ 19 gga 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAAGAAGAGGATGAAGCTCAAAGTAAG..................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGgaat............................................................................................................................................. 19 gaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................GCCTGCTGAGGGTGTGACTCCCA.............................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................................................................................................................................................................GTTGTGTAATGGGCAACTCAGTTGTCTG.................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGA.................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGAggca............................................................................................................................................ 20 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTCTGTCCATCCGCATACCCCATCCT............................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGAggt............................................................................................................................................ 19 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAG....................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CAGTTGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAA................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGTCTGTGCCTGCTGgtaa............................................................................................................................................. 19 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGCGTGTCTGTGCCTGCTGatta............................................................................................................................................. 23 atta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................ATACCCCATCCTGCGTGTCTGTGCCTG................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CAACTCAGTTGTCTGTCTTCCT............................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAGGCCTGCTTGGCGTCTGTCCATCCGCAat.......................................................................................................................................................................... 32 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................AGAGCCCCTCGGGcgt.................................. 16 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTGCGTGTCTGTGCCTGCTGttaa............................................................................................................................................. 24 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AGGATGAAGCTCAAAGTAAGTGGCAG............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGTCTGTCTTCCTCACTCCTGAAGGTA............................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGGCAACTCAGTTGTCTGTCTTCCTCAgt........................................................... 29 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGTGTCGTGCACGATCCCGACAAGAAGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -