chr5:145902180 145902429 +
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(53)
TESTES

Sense strand
CAGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTACTCTCAATACCCAAAGGTATTGTGCATTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTTTCTCTGTCTTTCTCTCTTGCCTTCTCTATTTCTCTCTCTCTCCCTCTTACTGTCTGTCTTCCTTCCTCTTTCTTCCTTTCTTTT
...............................................(((((...(((.....))).(((((........)))))...))))).............................................................................................................................................................
...........................................44.........................................................103.................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 29 1 659.00 659.00 138.00 163.00 130.00 84.00 79.00 10.00 5.00 13.00 1.00 5.00 3.00 4.00 1.00 2.00 6.00 - 2.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTT............................................................................................................................................................................... 27 1 288.00 288.00 46.00 65.00 68.00 19.00 29.00 5.00 8.00 1.00 11.00 - 12.00 1.00 - 4.00 3.00 - - 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 30 1 142.00 142.00 63.00 11.00 15.00 15.00 17.00 2.00 - 1.00 - 4.00 - 1.00 - 3.00 - - 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 26 1 82.00 82.00 8.00 23.00 19.00 3.00 6.00 1.00 - - 5.00 - 7.00 1.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 28 1 58.00 58.00 3.00 3.00 4.00 1.00 1.00 10.00 7.00 11.00 1.00 8.00 - 5.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTT.............................................................................................................................................................................. 28 1 42.00 42.00 6.00 13.00 5.00 - 2.00 1.00 2.00 2.00 1.00 3.00 - 4.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCC........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 40.00 40.00 17.00 7.00 5.00 3.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCC............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 38.00 38.00 5.00 10.00 6.00 3.00 5.00 1.00 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 32.00 32.00 11.00 4.00 9.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGA............................................................................................................................................................................................. 28 1 20.00 20.00 - - - - - 4.00 3.00 3.00 - 5.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAC...................................................................................................................................................................................... 27 1 20.00 20.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 - - 2.00 - - 3.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACA................................................................................................................................................................................... 27 1 19.00 19.00 2.00 1.00 - - - 3.00 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 18.00 18.00 - - - - - 4.00 2.00 5.00 - 2.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCC........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 17.00 17.00 6.00 1.00 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTT............................................................................................................................................................................... 31 1 17.00 17.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 25 1 16.00 16.00 3.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACT........................................................................................................................................................................ 27 1 15.00 15.00 2.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 13.00 13.00 5.00 2.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTT....................................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 4.00 2.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAAC......................................................................................................................................................................... 30 1 12.00 12.00 6.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGT............................................................................................................................................................................ 30 1 11.00 11.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACAC.................................................................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 - - - - - 2.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTA................................................................................................................................................. 28 1 9.00 9.00 1.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCC............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 1.00 - 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 1.00 1.00 2.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 9.00 9.00 3.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTT...................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 2.00 1.00 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAAC......................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 2.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTT.................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.AGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTC.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTA................................................................................................................................................. 30 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCC............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 2.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTT............................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 1.00 1.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTT................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGT...................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAG......................................................................................................................................................................................... 21 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTa............................................................................................................................................................................... 27 a 5.00 82.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCC........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTT.................................................................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGt................................................................................................................................................................................. 29 t 4.00 58.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTT.................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAC...................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAC...................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTG............................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTt............................................................................................................................................................................. 29 t 3.00 42.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTAC........................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTT.............................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................ATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAAC......................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGTC.................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTt........................................................................................................................................................................... 31 t 2.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTTATATTACTCTCAATACCCAAAGatc......................................................................................................................... 28 atc 2.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAAC......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGA........................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCat............................................................................................................................................................................... 27 at 2.00 16.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCa................................................................................................................................................................................ 26 a 2.00 16.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTT.................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTT..................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTC.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TTATATTACTCTCAATACCCAAAGatc......................................................................................................................... 27 atc 2.00 0.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTAC........................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCt.......................................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 17.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTT..................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTTA................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCC............................................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCaa............................................................................................................................................................................... 31 aa 2.00 659.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TATATTACTCTCAATACCCAAAGatc......................................................................................................................... 26 atc 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................ATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACT........................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCC............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAA.......................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTACTC......................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGA............................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTG............................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAA....................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGAATAGTTGGTAAATCTGGACAA.......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTT.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACAtagc................................................................................................................................................................................. 29 tagc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCt........................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 38.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGT............................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................TCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTAAATC................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTc.............................................................................................................................................................................. 28 c 1.00 288.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTACT.......................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTT.................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGa................................................................................................................................................................................. 29 a 1.00 58.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GCTTTGTAACTGTGAAGACCAAGAAT......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACAC.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTT.................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAG......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGt.............................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGt....................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCct............................................................................................................................................................................... 27 ct 1.00 16.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AAAGTGATCTCCCCCAGAGTCACAGt............................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................ATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACAC.................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CAAGAATTTTTTTTATATTACTCTCAA..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATAGTTGGTAAATCTGGACAAGcaga..................................................................................................................................................................................... 26 caga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GAAAAGTGATCTCCCCCA......................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCA......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACA..................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTAT................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTAT................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAac................................................................................................................................................................................. 29 ac 1.00 19.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAA.......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CAGCTTTGTAACTGTGAAGACCAAGA........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAACTGTGAAGACCAAGAAT......................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TTTTATATTACTCTCAATACCCAAAGatc......................................................................................................................... 29 atc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCACAGAATAGTTGGTAAATC................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTG....................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCAAGAATTTTTTTTATATTACTCTCAATA................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGATCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTT......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAa........................................................................................................................................................................................................................ 31 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGTG..................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAAGAAAAGTGATCTCtt............................................................................................................................................................................................................................ 18 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCC............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACt................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGT............................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTT.................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTG............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGt....................................................................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATAT.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGA.................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAA.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAAT......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTT...................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAC...................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAggaa....................................................................................................................................................................................... 26 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAtt................................................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 19.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAG........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGTC.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCat.......................................................................................................................................................................................................................... 30 at 1.00 38.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTA..................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTA................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTTTTTATATTACTCTCAATACCCAAAG............................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAAGGTATTGTGCATTCCTT............................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGA........................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................GGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTT............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGT..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCC............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGT..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAA.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AATAGTTGGTAAATCTGGACAAGcag...................................................................................................................................................................................... 26 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCA......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCt......................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 32.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAG.................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAta....................................................................................................................................................................................................................... 27 ta 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGTGAAGAC................................................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATT............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATT........................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTtt.................................................................................................................................................................................................... 30 tt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAA.................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CAGCTTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATT........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCC............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ACAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGA........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCac........................................................................................................................................................................................................................... 28 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACT........................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACg................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 10.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTA........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGTCACAGAAT............................................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTacc............................................................................................................................................................................................................................ 27 acc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAtctt............................................................................................................................................................................... 27 tctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTT................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTT.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCa................................................................................................................................................................................ 30 a 1.00 659.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGTGAA................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAA....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTT...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAtct................................................................................................................................................................................ 28 tct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTT.................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTT.............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CACAGAATAGTTGGTAAATCTGGACA........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCat............................................................................................................................................................................... 31 at 1.00 659.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAAC......................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAA.......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACAC.................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGACAAGAACACAGCTTTGTAACT........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCt............................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAG......................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACggc................................................................................................................................................................................. 29 ggc 1.00 10.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAa...................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGTGttc................................................................................................................................................................................................................................ 24 ttc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGA............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGACTGCAGAAGAAAAGT.................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTACTC......................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCcgga............................................................................................................................................................................................. 28 cgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAAC...................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................TGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTg............................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 82.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGAAGACCAAGAATTTTTTTTATAT.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGC................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGACTGCAGAAGAAAAGT.................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
.........................................................TGGACAAGAACACAGCT................................................................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGAAGACTGCAGAAGAAAAGTGATCTCCCCCAGAGTCACAGAATAGTTGGTAAATCTGGACAAGAACACAGCTTTGTAACTGTGAAGACCAAGAATTTTTTTTATATTACTCTCAATACCCAAAGGTATTGTGCATTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTTTCTCTGTCTTTCTCTCTTGCCTTCTCTATTTCTCTCTCTCTCCCTCTTACTGTCTGTCTTCCTTCCTCTTTCTTCCTTTCTTTT
...............................................(((((...(((.....))).(((((........)))))...))))).............................................................................................................................................................
...........................................44.........................................................103.................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)