(5)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(4)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
AGACGAGGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTAGTGGAGGGAAGGGAAGTGTGTGAACCACACATGCTCAGTCAAGGGCATGCCTCTGATTGGCTCGATCTCCCTCCGGAAGAGGGCTTTTATTCTGGGGTCCACAGATGTGTTGCTTGCCTTTCCCGAATGAGGCTTGGACGGACATCTACACCCTCCACCCACATCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGGGTGC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................................................TGAGGCTTGGACGGACATCTACACCC............................................ 26 1 13.00 13.00 7.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00
........................................................................................................TCTGATTGGCTCGATCTCCCTCCG.......................................................................................................................... 24 1 5.00 5.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGAGGCTTGGACGGACATCTACACC............................................. 25 1 5.00 5.00 2.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGAGGCTTGGACGGACATCTACACCCTC.......................................... 28 1 5.00 5.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGG.... 28 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................ACGAGTTGCTTATtgtt.... 17 tgtt 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................GAATGAGGCTTGGACGGACATCTAC................................................ 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGGGT.. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCCCGAATGAGGCTTGGACGGACATCT.................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCTGGGGTCCACAGATGTGTTGC.................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTttt....... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGCTGCCGTCCAAGATCAACCGcgca......................................................................................................................................................................................................... 26 cgca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATTGGCTCGATCTCCCTCCGGAA....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCTGGGGTCCACAGATGTGTTGCTTGC................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATTGGCTCGATCTCCCTCCGGAAa...................................................................................................................... 26 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGCCTTTCCCGAATGAGGCTTGGACGG........................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGAGGCTTGGACGGACATCTACAac............................................. 25 ac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATTGGCTCGATCTCCCTCCGaaag...................................................................................................................... 26 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATC....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGG.... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTATTCTGGGGTCCACAGATGTGT....................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATTGGCTCGATCTCCCTCCGGAAGAGGGCT................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGGGGTCCACAGATGTGTTGCTTGCC............................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCCACCCACATCTCAAGGAGCCAACGA................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCAAGATCAACCGTGCAGGTAGTGGAGG.............................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTCCCGAATGAGGCTTGGACGGACATC................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGAGGCTTGGACGGACATCTACAacc............................................ 26 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................................................TTGCCTTTCCCGAATGAGGCTTGGACG......................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCAAGATCAACCGTGCAGGTAGTG.................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGGAGGGAAGGGAAGTGTGTGAAC............................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGACGAGGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTAGTGGAGGGAAGGGAAGTGTGTGAACCACACATGCTCAGTCAAGGGCATGCCTCTGATTGGCTCGATCTCCCTCCGGAAGAGGGCTTTTATTCTGGGGTCCACAGATGTGTTGCTTGCCTTTCCCGAATGAGGCTTGGACGGACATCTACACCCTCCACCCACATCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGGGTGC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
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10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
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Testes Data. (testes)
SRR014234(GSM319958)
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SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
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mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509277(GSM509277)
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GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...........................GCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 1.00 - 7.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAACCACACATGCgtgg................................................................................................................................................................... 18 gtgg 8.00 0.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - -
..........................TGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGT............................................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGA.................................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CATCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTA......... 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAG..... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GAAGTGTGTGAACCACACATGCTCAGTCAA........................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CGAATGAGGCTTGGACGGACATCTA................................................. 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................AAGTGTGTGAACCACACATGCTCAGTCA............................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GAAGTGTGTGAACCACACATGCTCAGTCA............................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTAGT................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - -
......GGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCA....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CACATCTCAAGGAGCCAACGAGTTGCTTA......... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CAAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGG.... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCTTTTATTCTGGGGTCCACAGATGTGT....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................ACATGCTCAGTCAttga............................................................................................................................................................ 17 ttga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCA....................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AAGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGGGTG. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGTAa..................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AGGAGCCAACGAGTTGCTTATCAGGGT.. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................ACCCACATCTCAAGGAGCCAACGAGTTGC............ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GATGTGTTGCTTGCCTTTCCCGAATGA................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CTACACCCTCCACCCACATCTCA............................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGTGTGAACCACACATGCTCAGTCAA........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................ATTGGCTCGATCTCC............................................................................................................................... 15 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTCCCGAATGAGGCTTGGACGGACATCTAC................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CATGCTCAGTCAAGGGCATGCCTCTGA............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGA.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GTCCAAGATCAACCGTGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ATCTACACCCTCCACCCACATCTCA............................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GAAGAGGGCTTTTATTCTGGGGTCCACA.............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -