chr5:136437787 136438119 -
(8)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(32)
TESTES

Sense strand
GGCTTTCCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAATGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGTATCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCCAGTCTCCTACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAGAATTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTCCCCACCATGACAACCATCTCTTTTTTTATGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAACTGGGACTCCAAGTCCAGCAGGCTGGTTCTGAGACCACC
.....................................................................................................(((((.......((((..(((((((((((...........))..))))))))))))).......)))))..((((..((((((((.......))))))))..))))..............................................................................................................................
.....................................................................................................102......................................................................................................207............................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 11.00 11.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - 2.00 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAAC............................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 1.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - - 2.00 - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 1.00 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTT.............................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGG.................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 1.00 - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGG............................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCT....................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTC......................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGGAGAATTGATCTGGTTCTAGGGA......................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTC...................................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAGA............................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TATGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGGA........................................ 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCCAGTC................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTT.................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACA............................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGTGTACAAAGTCTGGCAGGACACTGT............................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAG............................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCC........................................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAG..................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGT................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTCCCCACC......................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAAAGTCTGGCAGGACACTGTCAAT........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGT.......................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAG..................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TTTATGCCCCTGCTGAGCC.................................................... 19 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGTTGGCAGGTCTTTGAG..................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCAGAGATACCAATGAAAACAGGTGTGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGTGTACAAAGTCTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAAAGTCTGGCAGGACACTGTCAA............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTT................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAAAGTCTGGCAGGACACTGTCAtt........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGG......................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGG................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GGAGAATTGATCTGGTTCTAGGGAGC....................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGG............................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTC............................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTCC.............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGA....................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGGAGAATTGATCTGGTTCTAGGG.......................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCT................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TAGACCTAGGGGGTCCTCCAGTCTCC.............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGG........................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCC..................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTTTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTC......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTG........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTT........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AATGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTG........................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGT.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..............................................................................................................TGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCCAG................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AATGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCT............................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCT................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGTGTACAAAGTCTGGCAGGACACTGT............................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTa............................................................................................................................................................... 26 a 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTCCAAGTCCAGCAGGCTGGTTC.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGG................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTTTTTTTATGCCCCTGCTGAGCCA................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTT................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTGGGAAGGTTGGGAGAATTGATCTG................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGG................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTCCCC............................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TCCTACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGG.................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TTATGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAG............................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TACCAATGAAAACAGGTGTGTACAAAGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGGT................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGG............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CAACTTGGGAAGGTTGGGAGAATTG........................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAAC............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGTCTGGCAGGACACTGTCAATCCCTT...................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TATGTTCCCCACCATGACAACCATCTC........................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAGt............................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTG........................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGA...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAG..................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGAACTGGGACTCCAAGTCCAGCgg.................. 27 gg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGAC................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TACCAATGAAAACAGGTGTGTACAAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCTAGG.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGa...................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGG.................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAAC...................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGGACAC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGGAAGGTTGGGAGAATTGATCTGGT................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGT................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCCAGGCCCAGAGGAACTGGGACTCa............................. 29 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TTTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCT....................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TATCTCCACCTTTACTTGATGCCTAtaa................................................................................................................................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCAGAGATACCAATGAAAACAGGTGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACTGGGACTCCAAGTCCAGCAGGCTGGT............ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGa................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGt................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTCAGAGATACCAATGAAAACAGGTGTGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCttt...................................................................................................................................................................................................... 30 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCT................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAATGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................AAGGTTGGGAGAATTGATCTGGTTCTAGG........................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GAATTGATCTGGTTCTAGGGAGCATA.................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TACAACTTGGGAAGGTTGGGAGAATT......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................GAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGGAAGGTTGGGAGAATTGATCTG................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGTGTACAAAGTCTGGCAGGACACTG................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGG......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTC...................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCCAGCAGGCTGGTTCTGA....... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCCAGGCCCAGAGGAACTGGGAC................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTGACTTTTCAGAGATACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTCAATCCCTTGTTCCCGTATCTC......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCcgtc......................................................................................................................................................... 27 cgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TATCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGACC.................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAGAAT.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGG............................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTtgc......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAACTG.................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AATGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAA...................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTa......................................................................................................................................................... 27 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATG.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................ATTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATG.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTCAATCCCTTGTTCCCGTATCTCCAC...................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGAAAACAGGTGTGTACAA................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGAACTGGGACTCCAAGTCCAGCAG.................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAA....................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAACTGGGA................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTC............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TTTATGCCCCTGCTGAGCCAG.................................................. 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGT................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTGTTCCCGTATCTCCACCTTTACTTGAT........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCCA.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTCTGTACAACTTGGGAAGG.................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGg................................................................................................. 26 g 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCCAGGCCCAGAGG......................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGCTTTCCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAATGAAAACAGGTGTGTACAAAGTCTGGCAGGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGTATCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCTAGGGGGTCCTCCAGTCTCCTACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTTGGGAGAATTGATCTGGTTCTAGGGAGCATATGTTCCCCACCATGACAACCATCTCTTTTTTTATGCCCCTGCTGAGCCAGGCCCAGAGGAACTGGGACTCCAAGTCCAGCAGGCTGGTTCTGAGACCACC
.....................................................................................................(((((.......((((..(((((((((((...........))..))))))))))))).......)))))..((((..((((((((.......))))))))..))))..............................................................................................................................
.....................................................................................................102......................................................................................................207............................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
.............................................................................................................................................................AGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 29 1 18.00 18.00 14.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 5.00 3.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTC..................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTT...................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - 3.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................TGTTCCCCACCATGACAACCATCTCTTT........................................................................ 28 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAATGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTT....................................................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCT.................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 32 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTT...................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTT....................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTC..................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTT...................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAA.............................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TCCTCCAGTCTCCTACCTTAGGTTGGCA............................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GGGAGAATTGATCTGGTTCTAGGGAGCA...................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GGGGTCCTCCAGTCTCCTACCTTAGGT.................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTT............................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................GCATATGTTCCCCACCATGACAACCAT.............................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGa................................................................................................................................................... 31 a 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTC..................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGTA............................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCAGGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTAgga................................................................................................................................................. 28 gga 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTGTCTTTCTGTACAACTTGGGAAGGTT.................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GGTCCTCCAGTCTCCTACCTTAGG..................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................GAGCATATGTTCCCCACCATGACAACCAT.............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTG................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................CACCATGACAACCATCTCTTTTTTTA................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCACCATGACAACCATCTCT.......................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TATGTTCCCCACCATGACAACCAT.............................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTC..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCTTTCCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAAaa.............................................................................................................................................. 31 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTTCTGTCTTTCTGTACAACTT........................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................GCATATGTTCCCCACCATGACAACCATCT............................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGG......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCCAGAGGAACTGGGACTCCAAGTCCA...................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAA.............................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................................................................................................................................................................AGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAACTT........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTt...................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACTTTTCAGAGATACCAATGAAAACAGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCttgc..................................................................................................................................................... 29 ttgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TATGTTCCCCACCATGACAACCATCTC........................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAA.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACA............................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCGTATCTCCACCTTTACTTGATGCCTA...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGa................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTCCACCTTTACTTGATGCCTAGACCTA................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAA.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTACAAc.............................................................................................................................................. 29 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCTTTGACTTTTCAGAGATACCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGAAGGTTGGGAGAATTGATCTGGTT................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTC..................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGTATC........................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTT............................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ACCTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTT............................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CAGGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACTAGCCTTTGACTTTTCAGAGATA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............TAGCCTTTGACTTTTCAGAGATACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................GGCAGGACACTGTCAATCCCTTGTTCCCG............................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTT...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AAAGTCTGGCAGGACACTGTCAATCCCa........................................................................................................................................................................................................................................................ 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCCACCATGACAACCATCTCTTTTTTTA................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TCAATCCCTTGTTCCCGTATCTCCA....................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCT.................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TCAATCCCTTGTTCCCGTAT............................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCTTTCCCAAAACTAGCCTTTGACTTTTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGTTCCCGTATCTCCACCTTTACTTGAT........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CTTTCTGTCTTTCTGTACAACTTGGG........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTTAGGTTGGCAGGTCTTTGAGGTTCTT............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTT....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGTCTGGCAGGACACTGTCAATCCC........................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGGGTCCTCCAGTCTCCTACCTTAtt....................................................................................................................................................................................... 26 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGGTTCTTTCTGTCTTTCT.................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGTA................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CCTCCAGTCTCCTACCTTAGGTTGGCA............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ATATGTTCCCCACCATGACAACCATtct.............................................................................. 28 tct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCAGGTCTTTGAGGTTCTTTCTGTCTTTCTGa................................................................................................................................................... 32 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AGGTGTGTACAAAGcccg............................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 cccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................................................TCCCTTGTTCCCGTATCTCCACCTTTA................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGTGTACAAAGTCTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGGTTCTTTCTGTCTTTCTGT.................................................................................................................................................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCCAAGTCCAGCagaa.................... 19 agaa 0.32 0.00 0.05 - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 0.11
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCCAAGTCCAGCaga.................... 18 aga 0.11 0.00 - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCCAAGTCCAGC.................... 15 19 0.11 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -