chr5:136437029 136437278 -
(7)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(32)
TESTES

Sense strand
AACTTGTCCAGCATTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATGCATGATATGTTCACACATGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCATGATCCCATGGGCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCGTAGAA
.....................................................(((((.((....))..(((...(((...........)))....)))...)))))...............................................................................................................................................
..................................................51..........................................................111.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 26 1 202.00 202.00 68.00 39.00 16.00 7.00 17.00 8.00 4.00 - 1.00 4.00 9.00 7.00 8.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAC................................................................................................................................................ 25 1 110.00 110.00 69.00 3.00 7.00 2.00 3.00 4.00 2.00 5.00 5.00 2.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGG........... 27 1 107.00 107.00 11.00 30.00 - 28.00 - 11.00 4.00 3.00 - - 2.00 5.00 5.00 - - - 1.00 1.00 - - 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 28 1 97.00 97.00 38.00 19.00 12.00 9.00 2.00 2.00 - - - 7.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAC................................................................................................................................................ 27 1 88.00 88.00 46.00 9.00 5.00 1.00 1.00 1.00 2.00 3.00 1.00 1.00 5.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 3.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 30 1 78.00 78.00 3.00 34.00 4.00 2.00 - - 14.00 - 13.00 6.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAC............................................................................................................................................. 28 1 68.00 68.00 44.00 - 6.00 4.00 2.00 - 3.00 1.00 - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGG.................................................................................................................................................. 25 1 67.00 67.00 23.00 10.00 5.00 7.00 14.00 5.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGG.......... 28 1 60.00 60.00 5.00 32.00 2.00 4.00 - 6.00 7.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGA................................................................................................................................................. 26 1 58.00 58.00 13.00 15.00 5.00 - 4.00 6.00 4.00 2.00 - 1.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 26 1 57.00 57.00 13.00 17.00 4.00 - 3.00 - 2.00 2.00 11.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGA................................................................................................................................................. 24 1 46.00 46.00 16.00 - 5.00 2.00 15.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 2.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAA.............................................................................................................................................. 27 1 46.00 46.00 14.00 2.00 7.00 2.00 4.00 1.00 - - - 7.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - 3.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGC.............................................................................................................. 28 1 39.00 39.00 2.00 26.00 3.00 3.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGG......... 29 1 32.00 32.00 4.00 - 1.00 6.00 - 2.00 1.00 - 5.00 2.00 - - 9.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGG....................................................................................................................................... 26 3 19.67 19.67 4.33 - 0.33 1.33 - 4.00 3.33 - 1.67 3.33 - - - - - 0.67 - - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCG..... 26 1 14.00 14.00 - 11.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAA.............................................................................................................................................. 29 1 14.00 14.00 8.00 - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGG.................................................................................................................................................. 23 1 12.00 12.00 5.00 - 3.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGC...... 26 1 11.00 11.00 1.00 6.00 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAG............ 26 1 11.00 11.00 1.00 - 1.00 1.00 - 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACC............................................................................................................................................ 29 1 11.00 11.00 7.00 - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TATCTCCAACACAGGGCACCTCCGTC...................................... 26 1 11.00 11.00 - 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATG............................................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 - - 1.00 - - - - 2.00 - - 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGC...... 28 1 11.00 11.00 4.00 - - - - 1.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGC................................................................................................................................... 27 1 10.00 10.00 - - - - 6.00 - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGT...................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGT.............................................................................................................................................................. 29 1 8.00 8.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGC...... 25 1 8.00 8.00 - - 3.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGA................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAC............................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 2.00 - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGG.................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAC............................................................................................................................................. 30 1 6.00 6.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................TGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCATC.......................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - - - 1.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTG..................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGA................................................................................................................................................. 25 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGG........... 29 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGT......................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGA............. 25 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACa............................................................................................................................................ 29 a 5.00 68.00 1.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAGTGGAACACACCGATGTGA............. 27 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCTG.................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TATCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCT..................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGC................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCCGTCTGGCTAGTGGAACACACCGA.................. 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGa...................................................................................................................................... 27 a 4.00 19.67 0.33 - - - 1.67 0.67 1.00 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGa........ 30 a 4.00 32.00 1.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAA................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCG....... 24 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGTGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGC.............................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGT........................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTG.......................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTG.......................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAG................................................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAG............................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGC...... 32 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAG..................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATG............................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................ACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGG.................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGG................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAa................................................................................................................................................ 25 a 3.00 46.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAC................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTa..................................................................................................................................... 26 a 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGT.............................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATGCATGATATGTTCACACATGTGAAGGC.................................................................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTG........................................................................................................................................ 25 4 2.50 2.50 - - - - - 1.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - -
................................................TGATATGTTCACACATGTGAAGGCAAAAC............................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCC................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATG............................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACC............................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGG....................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCC............................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACAC.................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTG.......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATGC........................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAG................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATGC........................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................TGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGTa............................................................................................................................................................. 28 a 2.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGACCCAGGCCTTATCTCCAACACAGGGC............................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................AACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTC....................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGa.................................................................................................................................... 26 a 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAa............................................................................................................................................. 28 a 2.00 46.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAACACACCGATGTGAGGGG......... 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTG..................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAG................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTa..................................................................................................................................... 28 a 2.00 9.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTCCAGCATTATTTATTGGTGTCT............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATGCATGATATGTTCACACAT.......................................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGa.......... 28 a 2.00 107.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGG.................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................GATGTGAGGGGCGCGTAGA. 19 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGTGTACCCGTGTATATGCATGATA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAt.............................................................................................................................................. 27 t 2.00 202.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGa.................................................................................................................................... 29 a 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCC............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAC............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGG....................................................................................................................................... 25 4 1.75 1.75 0.25 - - - - 0.50 0.75 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGaa..................................................................................................................................... 28 aa 1.33 19.67 0.33 - - 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGG....................................................................................................................................... 24 4 1.25 1.25 0.50 - - 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCGT.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........GCATTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGT................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGa................................................................................................................................... 28 a 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATATGTTCACACATGTGAAGGCAAAA.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCAT........................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGtt................................................................................................................................... 30 tt 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACt............................................................................................................................................... 28 t 1.00 88.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATAT............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTC....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCTGGC.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGA.................. 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TATCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCTG.................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAaaa.............................................................................................................................................. 27 aaa 1.00 46.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGT........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGT......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATG................ 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCT........................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTC................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................AACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGT...................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAA....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............TATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGa.............................................................................................................. 28 a 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGcc....................................................................................................................................................... 26 cc 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAg................................................................................................................................................ 27 g 1.00 58.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGATCCCATGGGCTCTTCTGACCCAGG................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAg................................................................................................................................................ 25 g 1.00 46.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACt............................................................................................................................................... 26 t 1.00 110.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGT............... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAa................................................................................................................................................ 27 a 1.00 58.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGtt....... 30 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGT................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAt.............................................................................................................................................. 29 t 1.00 97.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................TGTATATGCATGATATGTTCACACAT.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGTG............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGcaca............................................................................................................................................... 29 caca 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGTCTGGCTAGTGGAACACACCGATG................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGCCCTCAACTGTAGAGCCATCTCTTGa.................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAtt............................................................................................................................................... 28 tt 1.00 58.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAt................................................................................................................................................ 27 t 1.00 58.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGGAA.......................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CATGATATGTTCACACAT.......................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGGAATGTGAAGGTCAGA.................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AACACACCGATGTGAGGGGC........ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAC................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCC............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGG.................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAA................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTcta.............................................................................................................................................................................................................. 26 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGa........ 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAACTG.................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTa........................................................................................................................................ 30 a 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATt............................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GTGAGGGGCGCGTAGA. 16 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACC............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATtc........................................................................................................................................................................................................... 27 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................TGTCTGTGTACCCGTGTATATGCA.......................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGCAtta............................................................................................................................... 31 tta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATA.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGT................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCT........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAAa...................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTTCACACATGTGAAGGCAAAACAGga......................................................................................................................................................................... 28 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGACCCAGGCCTTATCTCCAACACAG.................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATATGTTCACACATGTGAAGGCAAA............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GTGAGGGGCGCGTAat. 16 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTa........................................................................................................................................ 33 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGa...... 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCa................................................................................................ 27 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAa............................................................................................................................................. 30 a 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTCCAGCATTATTTATTGGTGTCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGTGGAACACACCGATGTGAGGG.......... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAACT..................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGa...... 25 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAACACACCGATGTGAGG........... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AAACAGTATGAAGGAATGTGAAGG......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTcgtg..................................................................................................................................... 26 cgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................GTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGC................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATGCATGATATGTTCACACATGTGAAGGC.................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGcg................................................................................................................................................... 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAG................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATt............................................................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTG.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCGTAa.. 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCGTAGA. 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCA............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CTAGTGGAACACACCGATGTGAGt........... 24 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAGTGGAACACACCGATG................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTC....................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGgg..................................................................................................................................... 25 gg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGG............................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGt......... 29 t 1.00 60.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCT........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGt................................................................................................................................................. 26 t 1.00 67.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATtca.......................................................................................................................................................................................................... 28 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACC............................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGt................................................................................................................................................. 27 t 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCA.............................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAaa............................................................................................................................................... 26 aa 1.00 46.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTCAGAGGAC................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGt.................................................................................................................................... 29 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCT..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CTGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGG......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................AGAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTGC............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GGAATGTGAAGGTCAGAGGACAAtttg.......................................................................................................................................... 27 tttg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGA............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGc......... 29 c 1.00 60.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATGCATGATATGTTCACACATGTGAAGG................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAgaac............................................................................................................................................. 28 gaac 1.00 46.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCAGAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTGC............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATA.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGt................................................................................................................................................. 24 t 1.00 12.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACA............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAAT................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAGTGGAACACACCGATGT............... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCATG............................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATA.............................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGC........ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCC............................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CTAGTGGAACACACCGATGTGAGGG.......... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGGAATGTGAAGGTCAGAGGA................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CACACCGATGTGAGGGGCGCGTAGAA 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAc.............................................................................................................................................. 27 c 1.00 202.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGC................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGAAGGCAAAACAGTATGAAGGA.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTG.............. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGG.......... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAAC...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CAAAACAGTATGAAGGAATGTGAAGG......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTG........................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTG.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGAAt.......................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAG................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATG............................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAta............................................................................................................................................... 26 ta 1.00 46.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGcc................................................................................................................................................ 25 cc 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGt.......... 28 t 1.00 107.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGG.................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................AGAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCT.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGAA........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGAta............................................................................................................................................... 28 ta 1.00 58.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTa.......................................................................................................................................... 31 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTaaa...................................................................................................................................... 27 aaa 0.80 0.80 0.20 - - - - 0.20 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGT......................................................................................................................................... 24 5 0.80 0.80 0.40 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGa......................................................................................................................................... 24 a 0.75 0.38 - - 0.12 0.38 - 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGa...................................................................................................................................... 25 a 0.75 1.25 - - - - - 0.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................ACACACCGATGTGAGG........... 16 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCTCAACTGTAGAGCCA............................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTGGCAAGTGCCCTCAA....................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
............................................................................................GAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGT...................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTG.......................................................................................................................................... 23 8 0.38 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGaatt................................................................................................................................... 30 aatt 0.33 19.67 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGaaaa.................................................................................................................................... 29 aaaa 0.25 2.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAAGGAATGTGAAGGT........................................................................................................................................................ 17 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGtag..................................................................................................................................... 28 tag 0.25 2.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGaaa....................................................................................................................................... 26 aaa 0.12 0.38 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGGAATGTGAAGGTC....................................................................................................................................................... 15 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AACTTGTCCAGCATTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTATATGCATGATATGTTCACACATGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATGTGAAGGTCAGAGGACAACCTGTGGTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCATGATCCCATGGGCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGGAACACACCGATGTGAGGGGCGCGTAGAA
.....................................................(((((.((....))..(((...(((...........)))....)))...)))))...............................................................................................................................................
..................................................51..........................................................111.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.......................................................................................................................................................................GCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAA....................................................... 28 1 16.00 16.00 2.00 9.00 - 1.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAA....................................................... 26 1 8.00 8.00 2.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCA........................................................ 25 1 7.00 7.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAC...................................................... 27 1 6.00 6.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCA........................................................ 27 1 6.00 6.00 - 2.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACAC.................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAC...................................................... 29 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAt....................................................... 28 t 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGCCATCTCTTGGGTCCCA.............................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAa....................................................... 29 a 3.00 0.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GTGTACCCGTGTATATGCATGATATGTTCA............................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACAC.................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACACA................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAa........................................................ 24 a 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ACCCGTGTATATGCATGATATGTTCA............................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACa...................................................... 26 a 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CCATGGGCTCTTCTGACCCAGGCCTTA.............................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCGTGTATATGCATGATATGTTCACACA........................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGG............................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGGAACA........................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACACA................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CTGACCCAGGCCTTATCTCCAAC...................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ACCCGTGTATATGCATGATATGTTC................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACAC.................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAC...................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCCGTGTATATGCATGATATGTTCA............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACA..................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGGA........................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTATTTATTGGTGTCTGTGTACCCGTGTA................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCCGTGTATATGCATGATATGTT................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAAC...................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATG............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACACATGTGAAGGCAAAACAGTATG....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTTGTCCAGCATTATTTATTGGTGTCTG............................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACa...................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................CATGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAA................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCA........................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AACACAGGGCACCTCCGTCTGGCTA................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................AACTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCA.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATGGGCTCTTCTGACCCAGGCCTTATCT........................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAACa...................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGCCATCTCTTGGGTCCCATGATCCCATG.................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAA....................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGTGAAGGCAAAACAGTATGAAGGAATG............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCA........................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GTGTCTGTGTACCCGTGTATATGCATGATA..................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTACCCGTGTATATGCATGATATGTTCA............................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCCAGGCCTTATCTCCAACACAt................................................... 24 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GTGGCAAGTGCCCTCAACTGTAGAGCCA............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCCAGGCCTTATCTCCAACACAG.................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................ACCCAGGCCTTATCTCCAACACAG.................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GTCCAGCATTATTTATTGGTGTCTGTGTA........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................ACACAGGGCACCTCCGTCTGGCTAGTGG............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGACCCAGGCCTTATCTCCAACACAat................................................... 27 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CTGTAGAGCCATCTCTTGGGTCCCA.............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCCAA....................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CTCTTCTGACCCAGGCCTTATCTCC......................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -