(6)
OTHER.mut
(2)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(21)
TESTES

Sense strand
TCTTCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACCTAGCTCCCATCTGCTCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGAGCTCATCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGTTGAGCTGAGGCAGGGGGATTACCCATGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGCTGCAGGCTCGGGGCTTCCTCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAGCCCAGA
..........................................................................................................................((((....))))...((((((...(((.....))).((((.(((.....)))........)))).)))))).........................................................
....................................................................................................................117................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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small RNA cloning by length. (piwi testes)
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MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
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testes_rep3. (testes)
...............................................................................................................................................................................TGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGC................................................. 26 1 29.00 29.00 - 15.00 - 3.00 6.00 - - 1.00 - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................TGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGT.................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAGC..... 26 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAAG................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCAGGGGGATTACCCATGACTG..................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCAGAGGAGCTAAGAAGACAGGCCT................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGTT................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCATTGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGT......................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGT.................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GCTTCCTCCAGGTGCAGGGCGTGGATGG......... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGa................................................. 26 a 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................TAAGAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACCT................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TACCCATGACTGATGCCACCTTttc........................................................ 25 ttc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - -
...........................AAGAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACCT................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGCT................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TACCCATGACTGATGCCACCTTCTCTCC..................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................TCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAA................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGt................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AAGGGTCCAGTTGAGCTGAGGCAGGGGG................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCCAAGGAAGGGTCCAGTTGAGCTG............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGCAGGCTCGGGGCTTCCTCCAGG......................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGGAAGGGTCCAGTTGAGCTGAGGCA........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCATTGATCCCAAGATCCAAGGAAGG........................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGATGCCACCTTCTCTCCagc.................................................. 25 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGT.................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGAAG......................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAA....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAGCC.... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGA........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..TTCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGAtt......................................................................................................................................................................................................................... 31 tt 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCAGTTGAGCTGAGGCAGGGGGA.................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATCCAAGGAAGGGTCCAGTTGAGCTGAaa.......................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCAGGGGGATTACCCATGAatg..................................................................... 26 atg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AGGAGCTAAGAAGACAGGCCTAAGCCTC.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGCTGCAGGCTCGGGGCTTCCTCC............................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCCTCCAGGTGCAGGGCGTGGATGG......... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAG...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGATGCCACCTTCTCTCCCAGCTGaaa............................................ 27 aaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAGCCCAtt 31 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGGGGATTACCCcccg........................................................................ 16 cccg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGCTGAGGCAGGGGGATTACCCATGAa....................................................................... 29 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GAAGGGTCCAGTTGAGCTGAGGCA........................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGA........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGCTGAGGCAGGGGGATTAC.............................................................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCAGAGGAGCTAAGAAGACAGGCCTt................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGCAGGCTCGGGGCTTCCTCCAGGTca...................... 27 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGAGCTC..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGACCAAGAGCTCATCCTCTACCTCAAGC..................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TACCCATGACTGATGCCACCTTCTCTC...................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAGAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACC.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGATGCCACCTTCTCTCCCAGCTGCA............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGGTGCAGGGCGTGGATGGAA....... 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGGCGTGGATGGAAGCCCAGA 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GTTCTTGACCAAGAGCTCATCCTCTACC........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAG...... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................................................................................TGATGCCACCTTCTCTCCCAGCTG............................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTTCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACCTAGCTCCCATCTGCTCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGAGCTCATCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCAGTTGAGCTGAGGCAGGGGGATTACCCATGACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGCTGCAGGCTCGGGGCTTCCTCCAGGTGCAGGGCGTGGATGGAAGCCCAGA
..........................................................................................................................((((....))))...((((((...(((.....))).((((.(((.....)))........)))).)))))).........................................................
....................................................................................................................117................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
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small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
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testes_rep3. (testes)
......................................................................................................TCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCAA........................................................................................................................ 28 1 12.00 12.00 - - 10.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
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..................................................................GCTCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAA........................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCTGCTCCAATTCCCTCCCAGTTC................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCA............................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - -
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.....................................................................CCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGA......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GATCCCAAGATCCAAgg................................................................................................................. 17 gg 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAA................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
............................................................CATCTGCTCCAATTCCCTCCCAGTTCTa.................................................................................................................................................................. 28 a 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GAGCTGAGGCAGGGGGATTACCCATGACTG..................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GCTCATTGATCCCAAGATCCAAGGAA............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GATCCCAAGATCCAAggg................................................................................................................. 18 ggg 2.00 0.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGA......................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCTCCCAGTTCTTGACCAAGAGCTCA.................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCA......................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................................................GCCACCTTCTCTCCCAGCTGCA............................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CATCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCC........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CTCAGCCTCCAGAGGAGac................................................................................................................................................................................................................................. 19 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................CACACCTAGCTCCCATCTGCTCCAA................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
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...........................................................................CCCTCCCAGTTCTTGACCAAGAG........................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAA............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCTCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCAA................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CTACCTCAAGCTCATTGATCCCAAGA...................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................................................................................................................GACTGATGCCACCTTCTCTCCCAGCT................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGGGGATTACCCATGACTGATGCCACCTTC.......................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GCTCATTGATCCCAAGATCCAAGGAAG............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AAGAGCTCATCCTCTACCTCAAGCTCA.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CCACCTCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGA........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CAGTTCTTGACCAAGAGCTCATCCTCt............................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................GACCAAGAGCTCATCCTCTACCTCAtt........................................................................................................................................ 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TACCTCAAGCTCATTGATCCCAAGATCCA.................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCCACACCTAGCTCCCATCTGCTCCAAa................................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTGACCAAGAGCTCATCCTCTACCT.......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................GCCTAAGCCTCCACACCTAGCTCCCATC......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................CACACCTAGCTCCCATCTGCTCCA.................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................................................................................................GATCCCAAGATCCAAGGAAGGGTCCA...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................CCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCAAG....................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TACCTCAAGCTCATTGATCCCAAGATC.................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCA............................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCCTCTACCTCAAGCTCATTGATCCCAAG....................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GGCTCGGGGCTTCCTCCAGGTGCA..................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCTTGACCAAGAGCTCATCCTCTACCT.......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
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...................................................................CTCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAA........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
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.............................................................................................................................................................AGGCAGGGGGATTACCCATGACTGATGC................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCCCTCCCAGTTCTTGACCAA........................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CCCTCCCAGTTCTTGACCAA........................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCAGCCTCCAGAGGAGCTAAGAAGACA...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AATTCCCTCCCAGTTCTTGACCAAGA......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAAGACAGGCCTAAGCCTCCACACCTA.................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCTCCAATTCCCTCCCAGTTCTTGA............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................CCAAGAGCTCATCCTCTACCTCAAGC..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATCTGCTCCAATTCCCTCCCAGTTCT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -