chr5:135409143 135409392 +
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(40)
TESTES

Sense strand
GTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTACCGAGCCCCACGCCTTGCTGTGGATTGTCT
..........................................................................................................................((((((...........)))))).(((.(((.((((...........)))).))).))).....................................................................
.........................................................................................................106.............................................................................186..............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 24 ttt 12.00 0.00 - - - - - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................TAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAAC............................................................................................................... 29 1 10.00 10.00 - - 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGC.................................................................... 28 1 9.00 9.00 - - - 1.00 1.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGC.................................................................................................................... 32 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGC.................................................................................................................... 31 1 7.00 7.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTG...................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACA................................................................................................. 28 1 6.00 6.00 - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGG................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 6.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt........................................................................................................................................................................................................................ 25 tttt 6.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAACT.............................................................................................................. 30 1 5.00 5.00 - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGC.................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACACA................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCAC.................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACA................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAAC........................................................................................................................ 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACAC.................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACA................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGG..................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAGGT............................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGA................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttc......................................................................................................................................................................................................................... 26 ttc 3.00 0.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTC.................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt........................................................................................................................................................................................................................ 26 tttt 3.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCTCGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAGC..................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CTCGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAGC..................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGG...................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGG..................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTGCT............................................................ 35 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TAAACACTATGTTGGGCTAAGTGCTA........................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt......................................................................................................................................................................................................................... 26 tttt 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTagaa............................................................................................................................................................................................................. 36 agaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAA................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCAAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGG................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttta........................................................................................................................................................................................................................ 27 ttta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCT..................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAG............................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTGCTA........................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt.......................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCT................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 28 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTGC............................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGGAT............................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGT............................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAGG.............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCTA.................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt........................................................................................................................................................................................................................ 27 tttt 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAA................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCA................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATCTCCTCAGGATGTGGCTGCTT..................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTGGCTGCTTTGAAGTACCGAGC........................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AGGTGAGTCGTCTAAACAC.............................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................ACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAG.................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGG................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................ACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAGG.............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGGAT............................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATCTCCTCAGGATGTGGCTGCT...................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CACAAGCTCAAACTGGCAGAACTTGGGC......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GAGGATCTGAACTCTAAAACACACAAG............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................ACTATGTTGGGCTAAGTGC............................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGC.............................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GAAGTACCGAGCCCCACGCCTT.............. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCA................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTAa............................. 25 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAAC.............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAAtt.............................................................................................................. 30 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CAAGGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGa..................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAA......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTAC............................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TAAACACTATGTTGGGCTA.................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 29 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCC.................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtatt........................................................................................................................................................................................................................ 27 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtttt...................................................................................................................................................................................................................... 30 tttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGG..................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCC...................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTACCGA.......................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtata...................................................................................................................................................................................................................... 28 tata 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAGCTCGG................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................TTACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAtt.............................................................................................................................................. 27 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGcgt......................................................................................................................................................................................................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................AAGTGCTATCTCCTCAGGATGTGGCT......................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttt....................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAAC........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGAAGTACCGAGCCCCACGCCTTGC............ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TATACAGAGAAACCCTGTCTCGtttt......................................................................................................................................................................................................... 26 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAACT.............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt......................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACAGCCAGGGCTATACAGAGttt....................................................................................................................................................................................................................... 23 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................TCTGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATC................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATCTGAACTCTAAAACACACAAGCTC............................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CCGAGCCCCACGCCTTGC............ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAA.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............ACAGCCAGGGCTATACAGAGttat...................................................................................................................................................................................................................... 24 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................GAGGATCTGAACTCTAAAACACACAA................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCTTCTGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATC................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGAAGTACCGAGCCCCACGCCTTGCT........... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGCAGAACTTGGGCACCCCACAA................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTacgc.................................................................... 28 acgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCt................................................................................................................... 30 t 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTTGAAGTACCGAGCCCCACG.................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................CAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAG............................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGA................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGctt......................................................................................................................................................................................................................... 24 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtgta...................................................................................................................................................................................................................... 27 tgta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt......................................................................................................................................................................................................................... 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGTGC............................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAA................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACA................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt.......................................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GTCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTG.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCTCGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAG...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATGTTGGGCTAAGaaa............................................................. 17 aaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTC.................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTA.............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtta......................................................................................................................................................................................................................... 29 tta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtca....................................................................................................................................................................................................................... 28 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGCAGAACTTGGGCACCCCAC.................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCT................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AGACACCTCAAGCTCGGGTCTTCTGTT....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGtag......................................................................................................................................................................................................................... 24 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTACCG........................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtagt......................................................................................................................................................................................................................... 28 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAt............................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAGCCAGGGCTATACAGAcca........................................................................................................................................................................................................................ 21 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ACCCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACACT............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGAGGATCTGAACTCTAAAACACACAAGC.............................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtaat........................................................................................................................................................................................................................ 28 taat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CAAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGG................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAA............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGGAGGATCTGAACTCTAAAACACACAAGCTC............................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGGGGTCCTAGGAGGATCTGAACTCTA.......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGATGTGGCTGCTTTGAAGTACCGAGCC....................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACT....................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATCTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGA.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCGGGTCTTCTGTTACTGGG................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCTCAGGATGTGGCTGCTTTttag................................ 25 ttag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTta.................................. 25 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttat...................................................................................................................................................................................................................... 27 ttat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCac.................................................................................................................................................................................................................. 34 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATACAGAGAAACCCTGTCTCGttat......................................................................................................................................................................................................... 25 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................TAGGAGGATCTGAACT............................................................................................................................................. 16 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAGTAAGACACCTCAAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCAGAACTTGGGCACCCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTACCGAGCCCCACGCCTTGCTGTGGATTGTCT
..........................................................................................................................((((((...........)))))).(((.(((.((((...........)))).))).))).....................................................................
.........................................................................................................106.............................................................................186..............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...................................................................GCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTA........................................................................................................................................................... 28 1 30.00 30.00 14.00 3.00 - 1.00 - 3.00 - - 2.00 - 1.00 - 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAaaa.......................................................................................................................................................................................................... 30 aaa 6.00 0.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaa............................................................................................................................................................................................................................ 28 gaa 4.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CACACAAGCTCAAACTGGCA................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAAAACACACAAGCTCAAACTGGCA................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ACCCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACACT............................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAACTCTA.......................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAaga.......................................................................................................................................................................................................... 30 aga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTA........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................ACTCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCA................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAgatt............................................................................................................................................................................................................................. 28 gatt 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTAG.......................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTA........................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................AGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTA........................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GAGCCCCACGCCTTGCTGTGGATTGTCT 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCTAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACAC.................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................CCCACGCCTTGCTGTGGATTGTCT 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACACTATt........................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GGGCACCCCACAAGGTGAGTCGTCTAAACA............................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................ATGTGGCTGCTTTGatta................................... 18 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAt................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................AGTCGTCTAAACACTATGTTGGGCTA.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGGGGTCCTAGGAGGATCTGAACTCT........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGGAGGATCTGAACTCTAAAACACAC.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TACCGAGCCCCACGCCTTGCTGTGGAT..... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtcta............................................................................................................................................................................................................................ 28 tcta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................CCCCACGCCTTGCTGTGGAT..... 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaaa............................................................................................................................................................................................................................ 29 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCTATCTCCTCAGGATGTGGCTGCTT..................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTCCTAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACAC.................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCAGGATGTGGCTGCacg....................................... 18 acg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GGACAGCCAGGGCTATACAGgggt............................................................................................................................................................................................................................ 24 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................TCTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCA................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTAGG......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCTTCTGTTACTGGGGTCCTA........................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAgggg......................................................................................................................................................................................................................... 27 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................................................GAGCCCCACGCCTTGCTGTGGATTGTC. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAaga.......................................................................................................................................................................................................... 31 aga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GGACAGCCAGGGCTATACAGgaac............................................................................................................................................................................................................................ 24 gaac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgca....................................................................................................................................................................................................................... 28 gca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AACACACAAGCTCAAACTGGCAGAACT.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGGAGGATCTGAACTCTAAAACACACA................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgaa....................................................................................................................................................................................................................... 28 gaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CTCCTCAGGATGTGGCTGCTTTGAAGTAC............................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTCCAGGACAGCCAGGGCTATAgaa............................................................................................................................................................................................................................... 25 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AAGCTCAAACTGGCAGAACT.............................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CGGGTCTTCTGTTACTGGGGTCCTAGGA........................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CACCTCAAGCTCGGGTCTTCTGTTACTGGG................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................ACACACAAGCTCAAACTGGCActtc................................................................................................................... 25 cttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGGAGGATCTGAACTCTAAAACACAC.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CTAAAACACACAAGCTCAAACTGGCA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATGTTGGGCTAAGTGCTATCTCCTCAG.................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................AGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAGTA.................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCTGAACTCTAAAAC...................................................................................................................................... 15 17 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -