(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(36)
TESTES

Sense strand
CAGGAAAGTGTGGTGGCTGACCAGATCAGTCAGTTGAGCCGAGAGTGGGGGTAGGTATTGCCTGGGGGGTGGGGAAGAGGGCTATTGGGCACTTCCCCCTTTGACTTGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGCTTTGCAGAGCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGCTGTCCT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGa................................................. 25 a 29.00 26.00 - 1.00 - - 4.00 4.00 1.00 4.00 - 8.00 - 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAG.................................................. 24 1 26.00 26.00 - 15.00 - - - - 4.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGC.............. 27 1 24.00 24.00 5.00 - 5.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGa................................................. 24 a 15.00 9.00 - - - 3.00 - 2.00 3.00 2.00 - - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCT............. 28 1 10.00 10.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 3.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGaa................................................ 25 aa 9.00 9.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAG.................................................. 23 1 9.00 9.00 - 2.00 - 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCT............. 26 1 8.00 8.00 2.00 - - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGG............... 26 1 7.00 7.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - -
...................ACCAGATCAGTCAGTTGAGCCGAGAGTGGGG.................................................................................................................................. 31 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGaa................................................ 26 aa 5.00 26.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTG............ 27 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGC...... 26 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTG....... 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGA........... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGC...... 27 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGC.............. 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGat................................................ 26 at 3.00 26.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCT............. 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGag................................................ 25 ag 2.00 9.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGG............... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGC...... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGC......... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGC.............. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................AACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGtt.......... 29 tt 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................ACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAa.......... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTG............ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTG....... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGg................................................. 25 g 1.00 26.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTA................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGg........... 30 g 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................TGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGA........... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGC......... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGaag............................................... 26 aag 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGt................................................. 24 t 1.00 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTt............ 27 t 1.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCcag.................................................. 24 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................................................................................TGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCT........ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GTTGAGCCGAGAGTGGGG.................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTA................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCT........ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGATCAGTCAGTTGAGCCGAGAGTGG.................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTTCTCTCTAGCTTTacgc.......................................... 19 acgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................................................................................GTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTG....... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGag................................................ 26 ag 1.00 26.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAG.......... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGCTGT... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAACTGGTTCTGTACTTGAAGG.................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGCTG.... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTG............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGA........... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTTTCTCTCTAGCTTTGCAG.......................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTG............ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGCTG.... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................CCAGATCAGTCAGTTGAGCCGAGAGT...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGat................................................ 25 at 1.00 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTGAGCCGAGAGTGGGG.................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GAAGGTGGCTGAGCTGCT..... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTACTTGAAGGTGGCTGA........... 18 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGGAAAGTGTGGTGGCTGACCAGATCAGTCAGTTGAGCCGAGAGTGGGGGTAGGTATTGCCTGGGGGGTGGGGAAGAGGGCTATTGGGCACTTCCCCCTTTGACTTGGGGCTGACCTGTTTCTCTCTAGCTTTGCAGAGCAACTGGTTCTGTACTTGAAGGTGGCTGAGCTGCTGTCCT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)