chr5:110719467 110720027 +
(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(43)
TESTES

Sense strand
AGGGAAAAATTGCAAAGTTAGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGACTTGGTAAGTATCCCCAGGCCTTCCAGAAGCAGATGAGACAGACAGTATTGGATGAGGTAGAAGGTCAGGTCATTTACTGGGTTGTGGGGCAGCCTGGAGGATGAGGGGTGGTAGTTGCTCCCAAAGCTATCTAAGGAACTTTGGTAGTATTACAGGTACCACATGCAAAAGTAAGCTAGGTGCTTTGACTTGTACGTGTTTACTTAGCAGTCTTTTTTCTTTTTTTAATTTATTTATTTTATTTATTTGAGTACACAATCACTGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTACTTATCCGTCTTTACCCTCCTGTTCCACATTAACCCTTCAGCTTGTCCTTTTACTTTACAGCCAAATCACTTGGTGGGCTTGAAGCGGAGTTACATCAAGCTGTCCTTCCA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAA............................................................................................................................................................ 52 4 27.50 27.50 - - 27.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggct.................................................................................................................................................... 30 ggct 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGa.................................................................................................................................................................................... 30 a 3.00 0.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCagca........................................................................................................................................... 32 agca 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaa...................................................................................................................................................................... 26 aa 3.00 0.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CATTTACTGGGTTGTGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAttt......................................................................................................................................................... 30 ttt 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaa........................................................................................................................................................ 24 caa 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................ATGTGCCCAAAGAAGATCTGGACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTtagt...................................................................................................................................................................... 26 tagt 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaga....................................................................................................................................................... 25 caga 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAtaaa........................................................................................................................................................ 31 taaa 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGaga............................................................................................................................................. 30 aga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgtta.................................................................................................................................................... 29 gtta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgtaa.................................................................................................................................................... 30 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAtttt........................................................................................................................................................ 31 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaa...................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaaa..................................................................................................................................................................... 28 aaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGTTAGAGAATGTGCCCAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGACTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgca..................................................................................................................................................... 27 gca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTATCCCCcccc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 cccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGcgct....................................................................................................................................................... 31 cgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTata......................................................................................................................................................................................................... 19 ata 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaca..................................................................................................................................................................... 28 aca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaa...................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCActaa................................................................................................................................................................................................................... 29 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTGGTGGGCTTGAAGCGGAGTTt.................. 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcgtc....................................................................................................................................................... 25 cgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaa...................................................................................................................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTaaa....................................................................................................................................................................... 25 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAtga................................................................................................................... 28 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTgta.................................................................................................................................................. 29 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGAtc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tc 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgcaa.................................................................................................................................................... 28 gcaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaaa..................................................................................................................................................................... 27 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGgaaa.................................................................................................................................................. 30 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGCGGAGTTACATCAAGCTGTCCTT... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCAaa..................................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGAAGATCTGGACTTGGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTGGGAATTGAACTCAGGACgaa................................................................................................................................................................. 26 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGAAGAGGGCATCAGATCTaaa...................................................................................................................................................................................................................... 25 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGTGGGCTTGAAGCGGA...................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGCAAAGTTAGAGAATGTGCCCAAAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGTTAGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGct......................................................................................................................................................... 30 ct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAaca..................................................................................................................................................................... 27 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAttta........................................................................................................................................................ 31 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTga....................................................................................................................... 32 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGtgtg.................................................................................................................................................................................................... 24 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTtaaa...................................................................................................................................................................... 26 taaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GTGCCCAAAGAAGATCTGGACTTGc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAaa.............................................................................................................................................................................................................. 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AATGTGCCCAAAGAAGATCTGGACTTGc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGGGGTGGTAGTTGCTtagt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........TGCAAAGTTAGAGAATGTGCCCAAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGGAATTGAACTCAGGACgtcc................................................................................................................................................................ 25 gtcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTACAGATGGTTGTcaga..................................................................................................................................................................................................... 21 caga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTGGGAATTGAACTCAGGACgtaa................................................................................................................................................................ 27 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggtg.................................................................................................................................................... 28 ggtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGcgct.................................................................................................................................................................................................... 29 cgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCga...................................................................................................................................................................................................................... 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCATGTGATTGCTGGGAATTGAAga.......................................................................................................................................................................... 27 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAcgc.......................................................................................................................................................... 29 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggct.................................................................................................................................................... 29 ggct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GAGACAGACAGTATTGGATGAGGTAGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTaga......................................................................................................................................................................................................... 24 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAAGTATCCCCgc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 15 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCcta............................................................................................................................................ 26 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGATGGTTGTGAACCACCtc............................................................................................................................................................................................... 23 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgaga.................................................................................................................................................... 28 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGATTGCTGGGAATTGAACTgaaa...................................................................................................................................................................... 26 gaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGATGGTTGTGAAaaaa.................................................................................................................................................................................................. 19 aaaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaa........................................................................................................................................................ 25 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGGAGGATGAGGGGTGGTAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggta.................................................................................................................................................... 29 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCggca................................................................................................................... 31 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGAAGATCTGGACTTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 5 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCATC............................................................................................................................................................................................................................... 29 12 0.17 0.17 - - - - 0.08 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGG................................................................................................................................................................................... 30 18 0.11 0.11 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGC.................................................................................................................................................................................................................................. 26 19 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.05 - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCAT................................................................................................................................................................................................................................ 28 13 0.08 0.08 - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGGAATT............................................................................................................................................................................... 30 13 0.08 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCATa............................................................................................................................................................................................................................... 29 a 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCA................................................................................................................................................................................................................................. 28 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGC.................................................................................................................................................................................................................................. 27 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGG.................................................................................................................................................................................... 30 19 0.05 0.05 - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGta.................................................................................................................................................................................. 32 ta 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGGGAAAAATTGCAAAGTTAGAGAATGTGCCCAAAGAAGATCTGGACTTGGTAAGTATCCCCAGGCCTTCCAGAAGCAGATGAGACAGACAGTATTGGATGAGGTAGAAGGTCAGGTCATTTACTGGGTTGTGGGGCAGCCTGGAGGATGAGGGGTGGTAGTTGCTCCCAAAGCTATCTAAGGAACTTTGGTAGTATTACAGGTACCACATGCAAAAGTAAGCTAGGTGCTTTGACTTGTACGTGTTTACTTAGCAGTCTTTTTTCTTTTTTTAATTTATTTATTTTATTTATTTGAGTACACAATCACTGACTTTAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAACCACCATGTGATTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTACTTATCCGTCTTTACCCTCCTGTTCCACATTAACCCTTCAGCTTGTCCTTTTACTTTACAGCCAAATCACTTGGTGGGCTTGAAGCGGAGTTACATCAAGCTGTCCTTCCA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaaa.................................................................................................................................................................................................................. 27 aaa 16.00 0.00 8.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaaaa................................................................................................................................................................................................................ 27 aaaa 10.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 1.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaaa................................................................................................................................................................................................................ 26 aaa 8.00 0.00 - - - - 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaaaa.................................................................................................................................................................................................................. 28 aaaa 6.00 0.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAaaaa.................................................................................................................................................................................................................. 27 aaaa 5.00 0.00 - 2.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAgt................................................................................................................................................................................................................ 27 gt 4.00 0.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACaaa................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 4.00 0.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgca.................................................................................................................................................................................................................. 26 gca 4.00 0.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAata.................................................................................................................................................................................................................. 26 ata 4.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGaa................................................................................................................................................ 30 aa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAaa.................................................................................................................................................................................................................. 23 aa 3.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAagag................................................................................................................................................................................................................ 30 agag 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaa................................................................................................................................................................................................................ 25 aa 3.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAgaaa.................................................................................................................................................................................................................. 25 gaaa 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaat.................................................................................................................................................................................................................. 27 aat 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgtt.................................................................................................................................................................................................................. 26 gtt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaaa.................................................................................................................................................................................................................... 25 aaa 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaga.................................................................................................................................................................................................................... 25 aga 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAat.................................................................................................................................................................................................................. 25 at 2.00 0.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTcgt................................................................................................................ 26 cgt 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTcga................................................................................................................ 26 cga 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCtt................................................................................................................. 28 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAgatt.................................................................................................................................................................................................................. 25 gatt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCCaaaa................................................................................................................. 22 aaaa 2.00 0.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgga.................................................................................................................................................................................................................. 26 gga 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAgtta.................................................................................................................................................................................................................. 25 gtta 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaaat................................................................................................................................................................................................................ 27 aaat 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAt.................................................................................................................................. 33 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaaat.................................................................................................................................................................................................................... 26 aaat 2.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCaaaa.................................................................................................................. 21 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGATCTCATTACccta................................................................................................................................................................................................................... 19 ccta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAat................................................................................................................................................................................................................ 27 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgcga.................................................................................................................................................................................................................. 27 gcga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCAcgct....................................................................................................................................................................................................................... 28 cgct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACag................................................................................................................................................................................................................... 25 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCATCAGATCTCATTACAggc.................................................................................................................................................................................................................. 25 ggc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACCCTCCTGTTCCACtaac................................................................................... 21 taac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAggt.................................................................................................................................................................................................................. 26 ggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAcgg................................................................................................................................................... 27 cgg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGCTGGGAATTGAACTCAGGaat...................................................................................................................................................................... 25 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCatta..................................................................................................................................... 26 atta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCatt............................................................................................................................................. 30 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAgtta.................................................................................................................................. 27 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCac................................................................................................................. 27 ac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCaaaa........................................................................................................................................................................................................................ 22 aaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAcacc............................................................................................................................................................ 24 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTAgga.................................................................................................................................................................................................................... 22 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaat.................................................................................................................................................................................................................... 25 aat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAtta.................................................................................................................................................................................................................. 29 tta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAtt.................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAagat.................................................................................................................................................................................................................. 27 agat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAaaa.................................................................................................................................................................................................................. 24 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAgga.................................................................................................................................................................................................................... 25 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTACTt............................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAtcat............................................................................................................................................................. 30 tcat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCATCAGATCTCATTACAGctca................................................................................................................................................................................................................. 27 ctca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAGGGCATCAGATCTCATTAga.................................................................................................................................................................................................................... 25 ga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCttt.................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaaaa.................................................................................................................................................................................................................... 26 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgaca.................................................................................................................................................................................................................. 27 gaca 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAaaat................................................................................................................................................... 29 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGaaa................................................................................................................................................................................................................. 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGttt................................................................................................................................................ 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTtt................................................................................................................ 29 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAgggg.................................................................................................................................................................................................................... 26 gggg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGatt...................................................................................................................................................... 27 att 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAGGGCATCAGATCTCATTAgt.................................................................................................................................................................................................................... 25 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTaat................................................................................................................ 29 aat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCgat.................................................................................................................... 31 gat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAgtaa.................................................................................................................................................................................................................. 25 gtaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaag................................................................................................................................................................................................................ 26 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCCTaaaa................................................................................................................ 23 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAaac................................................................................................................................................................................................................ 28 aac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAgaca............................................................................................................................................................ 29 gaca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACgcaa................................................................................................................................................................................................................... 26 gcaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGaca................................................................................................................................... 27 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACaa................................................................................................................................................................................................................... 22 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCATCAGATCTCATTACAGActta................................................................................................................................................................................................................ 28 ctta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAata................................................................................................................................................................................................................ 26 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTAgcaa.................................................................................................................................................................................................................... 25 gcaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAcaaa.......................................................................................................................................... 30 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAaaa.................................................................................................................................. 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAttat............................................................................................................................................................. 30 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAaatt................................................................................................................................................................................................................ 27 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAttta............................................................................................................................................................ 24 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAGAatg................................................................................................................................................................................................................ 26 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCcgga................................................................................................................. 26 cgga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgt.................................................................................................................................................................................................................. 25 gt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTAggta.................................................................................................................................................................................................................... 25 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTaat................................................................................................................ 32 aat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTaaaa................................................................................................................ 30 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaata.................................................................................................................................................................................................................. 28 aata 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAttt............................................................................................................................................................. 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCtt.................................................................................................................... 26 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAaag.................................................................................................................................................................................................................. 26 aag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAgttt....................................................................................................................................................... 26 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTcgaa................................................................................................................ 27 cgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaagc.................................................................................................................................................................................................................. 28 aagc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCatt................................................................................................................. 28 att 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAta................................................................................................................................................................................................................ 28 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAattt.................................................................................................................................................................................................................. 28 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGAaaa................................................................................................................................................................................................................ 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGagc................................................................................................................................... 27 agc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCaaag.................................................................................................................. 21 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTAaac.................................................................................................................................................................................................................... 25 aac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTAgaaa.................................................................................................................................................................................................................... 25 gaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCAta....................................................................................................................................................................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAttt............................................................................................................................................................ 30 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCATCAGATCTCATTACAaga.................................................................................................................................................................................................................. 24 aga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaca.................................................................................................................................................................................................................. 27 aca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGaa................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCCATCTCTCCAGCCCCTtgt................................................................................................................ 24 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgata.................................................................................................................................................................................................................. 27 gata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGaaaa......................................................................................................................................................... 31 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAtatt............................................................................................................................................................ 31 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTAaa............................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAgttt.................................................................................................................................................................................................................. 27 gttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaga.................................................................................................................................................................................................................. 27 aga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaaag.................................................................................................................................................................................................................. 28 aaag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTAgga.................................................................................................................................................................................................................... 24 gga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGGGCATCAGATCTCATTACAaaat.................................................................................................................................................................................................................. 28 aaat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCATCAGATCTCATTACAatat.................................................................................................................................................................................................................. 27 atat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAtca.......................................................................................................................................... 27 tca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAttt............................................................................................................................................................. 29 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -