(10)
OTHER.mut
(4)
OVARY
(10)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(52)
TESTES

Sense strand
TGGGCATGGAGTGCTCTGAGCTCTTTGCTGTTTCCGCTAGTGGCTGCATATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTTCCTAAAGGAGATGCGGCAGCCACAGGCCTCAGCCCCTGGCACACGATTTAAAATACAATCTTTTTTCAGGAATTGTGTTCTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGAAGATG
.............................................((((((((..........(((.((((.((.(((((.....))))).)).)))).....)))..........))))))))..............................................................................................................................
............................................45..............................................................................125...........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATTA..................................................................................................................................................... 52 1 551.00 551.00 - - - 395.00 - - - 156.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 22 1 166.00 166.00 31.00 27.00 53.00 - 31.00 9.00 - - - 4.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 32 1 164.00 164.00 25.00 4.00 11.00 - 16.00 26.00 23.00 - 15.00 11.00 10.00 7.00 3.00 - 6.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 21 1 160.00 160.00 22.00 39.00 52.00 - 25.00 6.00 4.00 - - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 20 1 148.00 148.00 33.00 29.00 51.00 - 15.00 9.00 - - 4.00 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................TTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 29 1 147.00 147.00 49.00 1.00 18.00 - 36.00 14.00 3.00 - 8.00 4.00 3.00 6.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 28 1 114.00 114.00 36.00 2.00 7.00 - 9.00 22.00 3.00 - 10.00 3.00 7.00 7.00 1.00 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 23 1 104.00 104.00 27.00 10.00 26.00 - 19.00 7.00 1.00 - 1.00 4.00 1.00 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 18 1 101.00 101.00 21.00 29.00 10.00 - 10.00 10.00 2.00 - - 3.00 - - 1.00 10.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 19 1 95.00 95.00 20.00 22.00 30.00 - 5.00 12.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 26 1 88.00 88.00 29.00 6.00 13.00 - 18.00 9.00 1.00 - 4.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 25 1 72.00 72.00 16.00 2.00 1.00 - 21.00 13.00 3.00 - 3.00 4.00 1.00 - - 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 24 1 67.00 67.00 22.00 12.00 6.00 - 13.00 5.00 4.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 30 1 65.00 65.00 6.00 13.00 19.00 - - 6.00 4.00 - 4.00 3.00 4.00 - - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 17 1 61.00 61.00 3.00 20.00 20.00 - - 9.00 6.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 27 1 54.00 54.00 17.00 2.00 - - 3.00 9.00 3.00 - 3.00 8.00 4.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 30 1 53.00 53.00 9.00 1.00 3.00 - 3.00 4.00 12.00 - 4.00 6.00 2.00 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCT....................................................................................................................................................................................... 18 1 52.00 52.00 2.00 3.00 - - - 3.00 21.00 - 5.00 1.00 3.00 3.00 6.00 - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 17 1 50.00 50.00 9.00 8.00 18.00 - 10.00 - 1.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTT...................................................................................................................................................................................... 19 1 41.00 41.00 - 1.00 - - - 1.00 22.00 - 1.00 2.00 2.00 - 4.00 2.00 - - - - 4.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 34 1 40.00 40.00 13.00 - - - 9.00 9.00 - - 4.00 - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 19 1 39.00 39.00 5.00 16.00 13.00 - - - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 20 1 38.00 38.00 3.00 24.00 4.00 - - - - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 21 1 38.00 38.00 14.00 6.00 6.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 7.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 26 1 37.00 37.00 9.00 2.00 12.00 - 1.00 1.00 5.00 - - 2.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 18 1 36.00 36.00 10.00 4.00 19.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTG.............................................................................................................................................................................. 27 1 36.00 36.00 3.00 2.00 - - 12.00 - 3.00 - - 2.00 4.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 27 1 33.00 33.00 8.00 2.00 9.00 - 2.00 4.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGC................................................................................................................................................................................ 25 1 32.00 32.00 - 7.00 - - - - 7.00 - - 1.00 7.00 - 5.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 25 1 31.00 31.00 1.00 11.00 4.00 - - 2.00 3.00 - 2.00 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 26 1 28.00 28.00 - 16.00 6.00 - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 28 1 28.00 28.00 7.00 - 13.00 - 3.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 22 1 26.00 26.00 1.00 22.00 - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 20 1 25.00 25.00 7.00 7.00 2.00 - 3.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 31 1 25.00 25.00 5.00 - - - - 2.00 10.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 21 1 25.00 25.00 1.00 14.00 3.00 - 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 25 1 24.00 24.00 15.00 2.00 3.00 - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 16 2 24.00 24.00 1.50 4.00 - - - - 0.50 - - 3.50 - - 4.50 8.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 22 1 22.00 22.00 8.00 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 18 1 22.00 22.00 3.00 14.00 - - - 2.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 19 1 21.00 21.00 7.00 5.00 7.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGT............................................................................................................................................................................. 28 1 20.00 20.00 - 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - 2.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................TTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 27 1 20.00 20.00 2.00 10.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 29 1 20.00 20.00 7.00 - 2.00 - - 1.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATTAT.................................................................................................................................................... 52 1 20.00 20.00 - - - - - - - 20.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 24 1 19.00 19.00 4.00 5.00 2.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 17 2 18.50 18.50 1.00 10.50 2.00 - 3.00 - 0.50 - 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 29 1 18.00 18.00 1.00 - 1.00 - 3.00 4.00 3.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTC..................................................................................................................................................................................... 20 1 16.00 16.00 2.00 - - - - - 4.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 32 1 16.00 16.00 1.00 6.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATTATTG.................................................................................................................................................. 52 1 16.00 16.00 - - - - - - - 16.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTC........................................................................................................................................................................... 30 1 16.00 16.00 1.00 - - - 8.00 - 2.00 - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTG................................................................................................................................................................................. 24 1 15.00 15.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 12.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 29 1 14.00 14.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 4.00 - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 23 1 14.00 14.00 2.00 - 7.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 15 2 14.00 14.00 - - - - - - 3.00 - - 4.00 - - 5.00 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCAC......................................................................................................................................................................... 32 1 14.00 14.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 33 1 13.00 13.00 1.00 - - - 3.00 1.00 2.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 23 1 13.00 13.00 - 4.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCAC................................................................................................................................................................................... 22 1 13.00 13.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 28 1 12.00 12.00 1.00 3.00 - - - 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 33 1 11.00 11.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 33 1 11.00 11.00 3.00 1.00 3.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 16 1 10.00 10.00 - 3.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 18 1 9.00 9.00 - 3.00 - - - 2.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACT......................................................................................................................................................................................... 16 1 9.00 9.00 2.00 - - - - - 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCT............................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 31 1 9.00 9.00 - - 4.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 31 1 9.00 9.00 - - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTT............................................................................................................................................................................ 29 1 8.00 8.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACT.................................................................................................................................................................................. 23 1 8.00 8.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 35 1 7.00 7.00 3.00 - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGa............................................................................................................................................................................. 28 a 7.00 36.00 - - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCA.................................................................................................................................................................................... 21 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGGAAGAGATGCGTGACGTTGGAAGA.. 26 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 21 1 7.00 7.00 - 1.00 - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 31 1 7.00 7.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 20 1 7.00 7.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 16 3 6.67 6.67 - 4.00 - - - - 0.67 - - - - - 0.67 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 34 1 6.00 6.00 1.00 - 2.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 30 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGA................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGA........................................................................................................................................................ 18 1 5.00 5.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 34 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 22 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TATCCGATGATTAAACTCT....................................................................................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 36 1 5.00 5.00 - - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 24 1 5.00 5.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 40 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CTGCTGTTCACATACTGAGCC............................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 19 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 17 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTA.......................................................................................................................................... 33 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTC........................................................................................................................................................................................ 17 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 22 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 23 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGATGCCTGGAAGAGATGCGTGACGT......... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAG................................................................................................................................................ 20 1 4.00 4.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTCACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 41 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCTGTTCACATACTGAGCCG.............................................................................................................................................................. 21 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTT....................................................................................................................... 32 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CTGCTGTTCACATACTGAGCCGTT............................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAAC............................................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTCTTCACTGCTGTTCACA........................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTCACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 42 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 40 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCA.......................................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGA...................................................................................................................................... 16 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TATCCGATGATTAAACTCTT...................................................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 41 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACT........................................................................................................................................... 32 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGT.............. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGA................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 15 4 2.25 2.25 - 0.25 - - - - 0.25 - - 0.50 - - 0.50 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTA..................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAAC............................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTGTTCACATACTGAGCC............................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCTGTTCACATACTGAGCC............................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTG.................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCACTGCTGTTCACATACTGA.................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGT............................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 38 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAAaa........................................................................................................................................... 31 aa 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TCCGATGATTAAACTCTTCACTGCT............................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGA........................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCTGTTCACATACTGAGCCGTT............................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 39 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGA...................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATT................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGA..... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TTCTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGT.............. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGG...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTATTGA................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AAGAGATGCGTGACGTTGGAAGATG 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACA........................................................................................................................................................................ 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCG.............................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATa...................................................................................................................................................... 20 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGTG............. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................TATCCGATGATTAAACTCTTCA.................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTa..................................................................................................................................................................................... 20 a 2.00 41.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGT.............. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATT................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTa....................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTTCTCGGTGATGCCTGGAAGAGAT.................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATG....................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCtt.............. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGGATATGCAAGaa......................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGA...................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGTGTTCTCGGTGATGCCTGGAA....................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATT...................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGggga................................................................................................................................... 32 ggga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................ACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTG......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACT........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGA................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 15 4 1.00 1.00 - 0.75 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAAtgca......................................................................................................................................... 20 tgca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATga................................................................................................................................ 32 ga 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGAGCCGTTGTGATTATTGAG................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGa............................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAa.................................................................................................................................. 30 a 1.00 14.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 16 3 1.00 1.00 - 0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGAAGAGATGCGTGAC........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGA...................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................ACTGCTGTTCACATACTGAGCC............................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATG....................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................ACTGCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAG................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTAT.................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAGGAGATGCGGCAGCCACAGGCCcc......................................................................................... 26 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGAAG... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GCTGTTCACATACTGAGC................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TCCGATGATTAAACTCTTCA.................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAA............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CTGCTGTTCACATACTGAGCCG.............................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TTCACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAAa............................................................................................................................................ 31 a 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGa................................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGaaga............................................................................................................................................................................. 28 aaga 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATg................................................................................................................................. 29 g 1.00 28.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCG............... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGATGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTT........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTt.................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................CACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACT........................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGTGACG.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAa................................................................................................................................................ 25 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTATTG.................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTGTGTTCTCGGTGATGCCTGGAAGA..................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAG................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTtct............................................................................................................................................................................... 26 tct 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGGAACTAATGAGGATATGC.............................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................CCGATGATTAAACTCTT...................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGAATTGTGTTCTCGGTGATGCCTGGA........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTGATTATTGAGGAACTAATGAGGgta................................................................................................................................. 27 gta 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAAC............................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TCCTAAAGGAGATGCGGCAGCCACAGG............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAGG.................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTCACTGCTGTTCACATACTGA.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTG.................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTAT.................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTT........................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGa.................................................................................................................................... 29 a 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGaaa.................................................................................................................................. 31 aaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTGAGCCGTTGTGATT...................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATT................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGGATAT................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACT........................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAtctc........................................................................................................................................................................................ 17 tctc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATG....................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCACTGCTGTTCACATACTGAGCCG.............................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTGATTATTGAGGAACTA.......................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGA.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTA.......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGATGCCTGGAAGAGATGCGTGAC........... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 36 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTG.................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAA............................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTA.......................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATA................................................................................................................................. 40 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGA..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGAGCCGTTGTGATTATTGA................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACAT....................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAcga................................................................................................................................... 30 cga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TATCCGATGATTAAACTCTTCACTGC................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTa...................................................................................................................................................................................... 19 a 1.00 52.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATAC..................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGcata................................................................................................................................. 18 cata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAGGAACTAATGAGGATATGCAAGC.......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATTATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTT........................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGGATATGCAAGCTTT....................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTtgt............................................................................................................................................................................ 28 tgt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGAATTGTGTTCTCGGTGATGCCTGG......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TCCGATGATTAAACTCTTCAC................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGT.............. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTT....................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................CCGATGATTAAACTCT....................................................................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGaa................................................................................................................................... 29 aa 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGAT.................................................................................................................................. 37 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAaaa................................................................................................................................... 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACAT....................................................................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GATTAAACTCTTCACTGC................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTA..................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGAA.... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................CACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGG............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CTCTTTGCTGTTTCCacca................................................................................................................................................................................................................... 19 acca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTg..................................................................................................................................................................................... 20 g 1.00 41.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TATCCGATGATTAAACTCTTCACTG................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGATGCCTGGAAGAGATGCGTGAC........... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................AGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGtata................................................................................................................................. 34 tata 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACT........................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CGATGATTAAACTCTTC..................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATT...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CACTGCTGTTCACATACTGAGCC............................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGaaa............................................................................................................................................. 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGATTATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTT....................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGATTATTGAGGAACTAATGAGGATATGC.............................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGT............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAACTCTTCACTGCTGTTCACA........................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAA............................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTT....................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GATTATTGAGGAACTAATGAGGtt.................................................................................................................................. 24 tt 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATA...................................................................................................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGGAACTAATGAGGA................................................................................................................................... 15 7 0.71 0.71 - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTGAGGAACTAATGAG..................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGGGCATGGAGTGCTCTGAGCTCTTTGCTGTTTCCGCTAGTGGCTGCATATCCGATGATTAAACTCTTCACTGCTGTTCACATACTGAGCCGTTGTGATTATTGAGGAACTAATGAGGATATGCAAGCTTTCCTAAAGGAGATGCGGCAGCCACAGGCCTCAGCCCCTGGCACACGATTTAAAATACAATCTTTTTTCAGGAATTGTGTTCTCGGTGATGCCTGGAAGAGATGCGTGACGTTGGAAGATG
.............................................((((((((..........(((.((((.((.(((((.....))))).)).)))).....)))..........))))))))..............................................................................................................................
............................................45..............................................................................125...........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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small RNA cloning by length. (piwi testes)
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16.5 dpc MILI. (mili testes)
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MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
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18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
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10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
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SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
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SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
.................................................................ACTGCTGTTCACATAtgaa...................................................................................................................................................................... 19 tgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACTGCTGTTCACATtta....................................................................................................................................................................... 17 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -