chr5:75577085 75577596 +
(1)
OTHER.ip 		(8)
OTHER.mut 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(46)
TESTES

Sense strand
GGGGCCACATTTGAACATTGTGAACTTGCTGGGAGCCTGCACCAAGTCAGGTAGGCGCCTTGTTCTGGGGTTCCTGGGAGTTTCTGGGAATCCTCTTTGTTGTGGAAACTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTATAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCAAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGCCCGGCTTATTGCAGGAACTTTTGAACCAGTCTCAGGCACAGATTGCCCTCTCTGCACCCCCAAACATGCCTCCTGAGGATAAAGCTCATACGTGGAGCTCACTGGGTCCCCCGACTTTTTGGAAGTTCATGGGTTCAGAGAAAGAATGGCTTCTTTCTGTTCTCCATTTTTATACTGGACTGTTTGGTACCCACAGGTCCCATTTACATCATCACAGAATACTGCTTCTATGGGGATTTGGTCAAC


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcgt 148.00 0.00 59.00 - 43.00 19.00 21.00 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ATAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCAAGAAATCCACCTGCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 52 1 103.00 103.00 - 103.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ca 25.00 0.00 - - - - - - - - - 4.00 6.00 - - - 7.00 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ttt 20.00 0.00 1.00 - 4.00 4.00 3.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttt 12.00 0.00 4.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtt 12.00 0.00 5.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gcgt 11.00 0.00 4.00 - 6.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gta 11.00 0.00 3.00 - 5.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 10.00 0.00 4.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcat 9.00 0.00 4.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGaca.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aca 7.00 0.00 - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGta..................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ta 7.00 0.00 3.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tat 7.00 0.00 2.00 - 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gcgt 7.00 0.00 1.00 - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcta 7.00 0.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTATACTGGACTGTTTGGTACC....................................................... 22 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ttt 5.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 taaa 5.00 0.00 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtaa 5.00 0.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGCat.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 at 4.00 0.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcgg 4.00 0.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAcaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 caa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 tttt 3.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTGTAGACCAGGCTGGCCTTtaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 taaa 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gcta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tttt 2.00 0.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGatt.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 att 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACacca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 acca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtca................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACagt........................................................................................................................................................................................................................................................ 25 agt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 taaa 2.00 0.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtta 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATTGTGAACTTGCTGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTGAACATTGTGAACTTGCTGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTctt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ctt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATACTGCTTCTATGGGGA.......... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ttat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGtgt.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ttat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTTCGAGACAGGGTTTCTTTGTGcaga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 caga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAcaaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gcta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTATACTGGACTGTTTGGTACCCACAG.................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGTag..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CATTGTGAACTTGCTGGGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAACATTGTGAACTTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTatt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TATAACTCACTTTGTAGACCAGGttgt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATTGTGAACTTGCTGGGAGCCTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................GAACTTTTGAACCAGTCTCAGGCACAGA............................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgaaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTaaga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GCTGGGATTAAAGGCATGCACCACtgaa....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tgaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAttta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 ttta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................ATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAaga.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTTCGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GATTAAAGGCATGCACCACCACGata.................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ata 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTGCTTCTATGGGGATTTGGTCA.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGCTGGGAGCCTGCACCAAGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTcgac.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 cgac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgctt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gctt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTGTAGACCAGGCTGGCCTTttag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 ttag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGcca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGTGAACTTGCTGGGAGCCTGCA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGCatgt.................................................................................................................................................................................................................................................. 31 atgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................TGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTTaga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtcg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgat...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTTTGTGTAGCCCTGGCaaa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACaatc....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aatc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGTAGACCAGGCTGGCCTTGAAattt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGACTTTTTGGAAGgga...................................................................................................................... 19 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
................ATTGTGAACTTGCTGGGAGCCTGCACC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTaaaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAcg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CACCTGCCTCTGCCTCCCGcgtc.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 cgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGTaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACATTTGAACATTGTGAACTTGCTGGGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTttta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtatt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gtgt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgctt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gctt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTcta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgtta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTtttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGcag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACatt........................................................................................................................................................................................................................................................ 25 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGgga.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAAaacc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 aacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTTGAACATTGTGAACTTGCTGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCggc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ggc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTATACTGGACTGTTTGGTACCCACAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgagt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gagt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCgcc....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gcc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgtgg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATTGTGAACTTGCTGGGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTATAACTCACTTTGTAGACCAGtct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgtaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgcgg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGAACTTGCTGGGAGCCTGCACCAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACaaaa....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aaaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTaaaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACagtt....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 agtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAtttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgat..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCGAGACAGGGTTTCTTatt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgcaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTGCTTCTATGGGGATTTGGTt... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TTCGAGACAGGGTTTCTTTGTGctgt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ctgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgaat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gaat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTGTAGACCAGGCTGGCCTTtaag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 taag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTATACTGGACTGTTTGGTACC....................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCgtta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGCatc................................................................................................................................................................................................................................................... 30 atc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGgtc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gtc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGaat.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgccg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gccg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGgggg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCgga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTATACTGGACTGTTTGG........................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTATAACTCACTTTGTAGACCAGGCTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TATAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGGCTGTCCTATAACTCACTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTGGACTGTTTGGT.......................................................... 15 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ATAACTCACTTTGTAGACCAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGGGCCACATTTGAACATTGTGAACTTGCTGGGAGCCTGCACCAAGTCAGGTAGGCGCCTTGTTCTGGGGTTCCTGGGAGTTTCTGGGAATCCTCTTTGTTGTGGAAACTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTATAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACCAAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCACCACCACGCCCGGCTTATTGCAGGAACTTTTGAACCAGTCTCAGGCACAGATTGCCCTCTCTGCACCCCCAAACATGCCTCCTGAGGATAAAGCTCATACGTGGAGCTCACTGGGTCCCCCGACTTTTTGGAAGTTCATGGGTTCAGAGAAAGAATGGCTTCTTTCTGTTCTCCATTTTTATACTGGACTGTTTGGTACCCACAGGTCCCATTTACATCATCACAGAATACTGCTTCTATGGGGATTTGGTCAAC


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTgatt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 gatt 4.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTgaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 gaa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAttt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ttt 3.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tc 3.00 0.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtaga......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 taga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................CGAGTGCTGGGATTAAAGGCAta................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGAtaa............................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 taa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgt....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cgt 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTgct.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 gct 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GAGTTTCTGGGAATCCTat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 at 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cgc 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TCCCGAGTGCTGGGATTAAcc........................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtta......................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTgac.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 gac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTTTTCGAta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTgag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 gag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAcacc......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cacc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTTTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTATA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAcgta......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cgta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtaac....................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 taac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGtaaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAActaa....................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ctaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACAGGTCCCATTTACATCATCACA.............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtaaa........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 taaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTActgc......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATtaga........................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 taga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACCTGCCTCTGCCTCCCGAtta..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 tta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTTTCTGGGAATCCTtat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................ACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGtttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 tttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTGTCCTATAACTCACTTTGTAtcag..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tcag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................GCACCACCACGCCCGGcggg.................................................................................................................................................................................................................................................. 20 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTTTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTAta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcact....................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcggg....................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................................................................................................................................CCTGGCTGTCCTATAACTCACTTTGTAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CCAAGAAATCCACCTGCCTCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................................................................................................................................CCTGGCTGTCCTATAACTCACTTTGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGGCTGTCCTATAACTCACTTTGTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CCTATAACTCACTTTGTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 19 0.05 0.05 - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -