chr5:65782182 65782664 -
(9)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(42)
TESTES

Sense strand
CAAGAACGTGATGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGCCCCATCTACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCCGGGAATCTGAACCCATCCTCTGTTTGGGGACCCCGGCGGCATGGAGCCGATGCCCCAAGGCTTTGTCCCGACTGTCCCCCAGCACGACGTGCGTCCTTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAGTGGCGTTCGGGCTTTCAGGCCCATCTCGGTCGTAGCCCTTCCGCCATGGCGCACCGAGCCGGGCTTCCTTACTCTTCTCCGGGGCCCCCGGTCCAGTCCTTGTCCCGGACACACCTGGGTCCTTGTTGCCGGCTTTCGTAGCTGGCGATTCCCGTTGGGAGCGGAACGCTGCCGGGTCTCGGGTGTAGAGCGTCCCCCGCCCCAGCCGTCTCACCCGGGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATGGTG
....................................................(((((..(((((..(((((...)))))...))))).....)))))...((((((....((((........))))...))))))(((((((((((((..(((((...((((...))))......))))))))).)))).)))))................................................................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51......................................................................................................................................................203......................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 28 8 12.50 12.50 3.38 0.75 1.12 - 0.25 1.88 0.50 1.25 0.12 0.38 - 0.12 1.12 0.38 0.25 0.25 - - 0.12 0.12 - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 9.00 9.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GCGTCCTTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGAGCTTAGGGAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 7.00 7.00 - 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGGATGAAGACCATTCTCAGC............................... 27 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGAGCTTAGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGTGGACATTCCAGAGAATGGTG 27 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGATGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGGTGTAGAGCGTCCCCCGCCCCAGCC............................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGACC........................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGGAGCTTAGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........TGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGCCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGTTTCAGGATGAAGACCATTCT................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GTGGCGTTCGGGCTTTCAGGCCCATC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGGAGCTTAGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGGAGCTTAGGGACCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGGAGCTTAGGGACCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTTGTCCCGACTGTCCCCCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCGAGGTGAGGAGCTTAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCC........... 27 8 1.75 1.75 - - 0.12 - 0.25 - - - - 0.12 - 0.12 - - - 0.12 - - 0.12 - - - 0.50 - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCC........... 28 8 1.62 1.62 0.62 - - - 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTG................... 29 8 1.38 1.38 - - 0.25 - - - 0.12 - - 0.38 - 0.12 - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 26 9 1.33 1.33 0.78 - 0.11 - 0.11 - 0.22 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACA............... 18 9 1.11 1.11 - - - - - 0.11 - 0.56 - - - - 0.11 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGT.................... 28 12 1.08 1.08 - - 0.17 - - - 0.08 - - 0.08 - 0.08 - - 0.08 0.08 0.08 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - -
...............................................................................................................................................................................GGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCGAGGTGAGGAGCTTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CCGGGTGCCCCGGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 15 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGGGTGTCTGTGTTTCAGGATGA............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GATGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGCCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCCG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGTCCCGGACtgt.......................................................................................................................................................................... 15 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGTTTCAGGATGAAGACCATTC.................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCGAGGTGAGGAGCTTAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AACGTGATGACGAAAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGGGTGTCTGTGTTTCAG.................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ATCTACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGGAAGTGGCGTTCGGGCTTTCAGGCCCATC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTTTCAGGATGAAGACCATTCTCA................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCTTAGGGACCGGGTGCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCGGGTCTCGGGTGTAGAGCGTC......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATGtcgt 30 tcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTGCGAGGTGAGGAGCTTAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GTTCGGGCTTTCAGGCCCATCTCGGTCGTAGC....................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCGGAACGCTGCCGG............................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................GGGTGCCCCGGGAATCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCCGGGAAa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCCTTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAGTGGCG...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ATCTACTGCGAGGTGAGGAGCTTAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGACCATTC.................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................CCGACTGTCCCCCAGCACGACGTGCGTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCACCCGGGTGTCTGTGTTTCAGG................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAGCGGAACGCTGCCGGGTCTCGG..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTaa........... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGATGACGAAAGACGTTCTCTCTTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CTGAACCCATCCTCTGTTTGGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCCTTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACGCTGCCGGGTCTCGGGTGTAGAGC............................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGCGAGGTGAGGAGCTTAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGct............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCaaga........ 28 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGGGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGAC......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCAGGATGAAGACCATTCTCAGCAAT............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCCATCTACTGCGAGGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTCCCGTTGGGAGCGGAACGCTGC............................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................AAGTGGCGTTCGGGCTTTCAGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGCCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAGTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................ACGACGTGCGTCCTTGGGACTTGGTGGCG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATGGT. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGA................. 17 9 0.89 0.89 - 0.33 - - - 0.44 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 30 8 0.88 0.88 - - 0.25 - - 0.50 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGG.................. 29 8 0.88 0.88 - 0.38 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 27 9 0.56 0.56 - 0.11 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATT............. 20 9 0.56 0.56 - - - - - - - 0.33 - 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGAGCTTAGGGACCGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGACA............... 19 9 0.44 0.44 - - - - - 0.33 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATCAGACTGTGGACATTCCA.......... 21 9 0.44 0.44 0.33 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGA................. 19 8 0.38 0.38 - - - - - 0.12 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTC............ 27 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAG......... 27 8 0.38 0.38 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCA.......... 29 8 0.38 0.38 - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGG.................. 30 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGAC................ 27 8 0.38 0.38 - 0.25 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAG....... 29 8 0.38 0.38 - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 23 9 0.33 0.33 - - 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGAC................ 17 9 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGA................. 18 9 0.33 0.33 - - - - - 0.11 - - - 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGAGCTTAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATTCTCAGCAATCAGACTGTGG.................. 23 9 0.33 0.33 - 0.22 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGACATTCCAGAGAATG... 19 9 0.33 0.33 - - - - - 0.11 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGGGACCCCGGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 21 10 0.30 0.30 - 0.10 - - - 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTCC........... 19 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGAC................ 32 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTC............ 26 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGa.................. 30 a 0.25 1.38 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTG................... 28 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 30 8 0.25 0.25 - - - - - 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTG..................... 27 12 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCA.......... 26 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGAC....................... 25 13 0.23 0.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.15 - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAG......... 26 9 0.22 0.22 - - - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAG....... 27 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 22 9 0.22 0.22 - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTTTGCCCCATCTACTGCGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 9 0.22 0.22 - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGTGGACATTCCAGAGAATG... 25 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGAC................ 18 9 0.22 0.22 - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 25 9 0.22 0.22 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 22 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTCCA.......... 20 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 24 9 0.22 0.22 - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 24 9 0.22 0.22 - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 26 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGTGGACATTCCAG......... 19 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGATGAAGACCATTCTCAGCAATCAGA........................ 28 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGTGGACATTCCAGA........ 20 10 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGTGGACATTCCA.......... 17 11 0.18 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACT...................... 26 13 0.15 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGACA............... 30 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGA................. 31 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGAC................ 31 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGA................. 27 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGc........ 28 c 0.12 0.38 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACA............... 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGA........ 31 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATT............. 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAG......... 30 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGAC................ 26 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTGGAC................ 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 32 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATG... 33 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAG......... 28 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATTCTCAGCAATCAGACT...................... 20 17 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGACAT.............. 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCAGCAATCAGACTGTG................... 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATG... 32 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGAt................ 19 t 0.11 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGTGGACATTCCAGAG....... 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATT............. 22 9 0.11 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAG....... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 21 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTCCAGAG....... 23 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCATTCTCAGCAATCAGACTGTG................... 24 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGc........ 27 c 0.11 0.22 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAG....... 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATTCaaga........ 25 aaga 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATTCCAGAGAATG... 20 9 0.11 0.11 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAATCAGACTGTGGACATTCC........... 24 9 0.11 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CTCTTTGCCCCATCTACTGCGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGG.................. 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATTC............ 21 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATCAGACTGTGGACATTC............ 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATCAGACTGTGGACATTC............ 20 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATCAGACTGTGGACATT............. 19 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATT............. 17 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGT.................... 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGACTGTGGACATTC............ 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGTGGACATTCC........... 17 11 0.09 0.09 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGATGAAGACCATTCTCA................................. 19 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATCAGACTGTGGACA............... 17 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTGTGGACATT............. 16 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATTCCAGAGAA..... 16 11 0.09 0.09 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGggg.................. 30 ggg 0.08 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACCATTCTCAGCAATCA.......................... 22 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAGACCATTCTCAGCAATCAG......................... 24 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTTGCCCCATCTACTGCGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGACCATTCTCAGCAATCAGA........................ 22 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAATCAGACTGTG................... 15 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGACCATTCTCAGCAAT............................ 18 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - -

Antisense strand
CAAGAACGTGATGACGAAAGACGTTCTCTCTTTGCCCCATCTACTGCGAGGTGAGGAGCTTAGGGACCGGGTGCCCCGGGAATCTGAACCCATCCTCTGTTTGGGGACCCCGGCGGCATGGAGCCGATGCCCCAAGGCTTTGTCCCGACTGTCCCCCAGCACGACGTGCGTCCTTGGGACTTGGTGGCGCGAGCTGGAAGTGGCGTTCGGGCTTTCAGGCCCATCTCGGTCGTAGCCCTTCCGCCATGGCGCACCGAGCCGGGCTTCCTTACTCTTCTCCGGGGCCCCCGGTCCAGTCCTTGTCCCGGACACACCTGGGTCCTTGTTGCCGGCTTTCGTAGCTGGCGATTCCCGTTGGGAGCGGAACGCTGCCGGGTCTCGGGTGTAGAGCGTCCCCCGCCCCAGCCGTCTCACCCGGGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGACCATTCTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGAATGGTG
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..................................................51......................................................................................................................................................203......................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGGTGTCTGTGTTTCAGGATGAAGACCA....................................... 30 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TCCTCTGTTTGGGGAagt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 agt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTGCCGGCTTTCGTAGCTGGCGATTCCCG................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAGGGACCGGGTGCgagc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCAGGATGAAGACCATTCTCAGCAATCA.......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCGGAACGCTGCCGGGTCTCGGGTGTA................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCCCAGCACGACGTGCGTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CCATCTACTGCGAGGTGAGGAGCTTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CGAGCCGGGCTTCctgt........................................................................................................................................................................................................................ 17 ctgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CGGGAATCTGAACCctcc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGCAATCAGACTGTGGACATTCCA.......... 27 8 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAATCAGACTGTGGACATTCCAGAGA...... 27 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -