chr5:36806964 36807213 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(43)
TESTES

Sense strand
GGAGGTCGCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGTCCTGTCTAGGTATGTGCAGCTTCTTCCTTCCTCCCCCCGGCTCCCGCAAATCTCGAGACAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCGGATCTCTTGAGTTCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGAGCTACACAGAGAAATTTTGTCTCGTAAAACAAACCAAACCAAACCAACCA
.................................................................................................(((.((.....))))).((((((((.((((.((.((.((((..((......))..))))..)).)).))))))))))))..........................................................................
......................................................................................87.........................................................................................178......................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGctca............................................................................ 23 ctca 26.00 0.00 - - - - 15.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................TACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCGG......................................................................................................... 25 1 20.00 20.00 - - - - - 1.00 - - 9.00 - - 4.00 - - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGctat............................................................................ 23 ctat 11.00 0.00 - - - - 4.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGcta............................................................................. 22 cta 8.00 0.00 - - - - 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 25 1 7.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGctta............................................................................ 23 ctta 6.00 0.00 - - - - 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TCTCGAGACAGAACGCTTCGTCCGTG..................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00
........................................................................................................................TACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCGGA........................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAt................................................... 26 t 6.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGGACTACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGC........................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGCT........................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGCGGATCTCTTGAGTTCTAGGC....................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCTACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCtgt................................................... 28 tgt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCGGATC...................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGTagtt...................................................... 28 agtt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCaca................................................... 26 aca 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GTGAGTTCCAGGTCAGCCAGtcta............................................... 24 tcta 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCG.......................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGctaa............................................................................ 23 ctaa 2.00 0.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGacaa................................................... 26 acaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAta.................................................. 27 ta 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGctgt............................................................................ 23 ctgt 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................AGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGT................................................................................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGTCCTGTC........................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGtta................................................ 29 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAta...................................................... 23 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCTACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGactg................................................... 28 actg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................AGACAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGC............................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCTCTTGAGTTCTAGGgggt.................................................................................... 20 gggt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCttt.................................................. 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAtttt................................................ 29 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GACAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGC............................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTGCAGCTTCTTCCTTCCTCC............................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGAGAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGTTGTCGGAGGACGTTTTCgtcc................................................................................................................................................................................................................ 25 gtcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GTGTGCTCTCGGCGGATCTCTTGAG............................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCtaat.................................................. 27 taat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCGCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGG............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTCGTCCGTGGACTACGGCTTGTGTG..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGccc............................................................................. 22 ccc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCac.................................................... 25 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TTCTGTCCTGTCTAGGTATGTGCtgt............................................................................................................................................................................................. 26 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................ACAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGG............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................TGTCTAGGTATGTGCAGCTTCTTCCTTa................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGAta................................................ 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCtat.................................................. 27 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGaccg................................................... 26 accg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGTgt........................................................ 26 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGGTtaaa.......................................................................... 25 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGCTT.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CGCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGGACG......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAtt.................................................. 27 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCcggc................................................. 28 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCcat.................................................. 27 cat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CGCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGGACGT........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGttca............................................................................ 23 ttca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGtag................................................ 29 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGT................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGTGTGCTCTCGGCGGATCTCTTGAG............................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAaaat.................................................... 25 aaat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GACAGAACGCTTCGTCCGTGGACT................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGGACTACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCG.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CAAATCTCGAGACAGAACGCTTCGTCCGT...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCGAGACAGAACGCTTCGTCCGTGGACT................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGTTCTAGGCCAGCCTGcgct............................................................................ 23 cgct 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGCTT.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGGACGT........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCTACAGAGTGAGTTCCAGGTCAttt..................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................................................................................................................................TACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCcgt.................................................. 27 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................CGCAAATCTCGAGACAGAACGCTTCGTC......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AGAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGGACTACGGCTTGTGTGTGCTCTCGG............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................ACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGAGt................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TCTCGAGACAGAACGCTTCGTCCGTGGAC.................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CGGATCTCTTGAGTTCTAGGCCAG.................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TTGAGTTCTAGGCCAGCCTGGTCTACAG........................................................................ 28 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGAGGTCGCAGAGCTGAGAGTTGTCGGAGGACGTTTTCTGTCCTGTCTAGGTATGTGCAGCTTCTTCCTTCCTCCCCCCGGCTCCCGCAAATCTCGAGACAGAACGCTTCGTCCGTGGACTACGGCTTGTGTGTGCTCTCGGCGGATCTCTTGAGTTCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGTCAGCCAGAGCTACACAGAGAAATTTTGTCTCGTAAAACAAACCAAACCAAACCAACCA
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......................................................................................87.........................................................................................178......................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtt................................................................... 27 tt 66.00 0.00 13.00 9.00 6.00 5.00 - 6.00 - 4.00 2.00 2.00 3.00 4.00 3.00 - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAat................................................................... 27 at 50.00 0.00 11.00 12.00 7.00 8.00 - 1.00 - 2.00 4.00 - 2.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAt................................................................... 27 t 28.00 0.00 12.00 5.00 2.00 3.00 - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAatt................................................................... 28 att 21.00 0.00 5.00 4.00 2.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtttt................................................................... 29 tttt 16.00 0.00 6.00 2.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAttt................................................................... 28 ttt 14.00 0.00 5.00 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAata................................................................... 28 ata 13.00 0.00 4.00 2.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtta................................................................... 28 tta 12.00 0.00 1.00 3.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtat................................................................... 28 tat 7.00 0.00 - 2.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaag................................................................... 28 aag 6.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaatt................................................................... 29 aatt 6.00 0.00 3.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAta................................................................... 28 ta 5.00 0.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAttaa................................................................... 29 ttaa 5.00 0.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtaaa................................................................... 29 taaa 5.00 0.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTtt................................................................. 29 tt 5.00 0.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAattt................................................................... 29 attt 5.00 0.00 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGtt.................................................................. 28 tt 4.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtt.................................................................... 26 tt 4.00 0.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaaag................................................................... 29 aaag 4.00 0.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGat.................................................................... 26 at 3.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaca................................................................... 28 aca 3.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTtaaa..................................................................... 27 taaa 3.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtatt.................................................................... 28 tatt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAgta............................................................. 31 gta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAatat................................................................... 29 atat 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtta.................................................................... 27 tta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgaga................................................................... 26 gaga 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaagt................................................................... 29 aagt 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAagta................................................................... 29 agta 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTtt..................................................................... 25 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGt.................................................................. 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtt................................................................... 28 tt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtaaa.................................................................... 28 taaa 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtatt................................................................... 29 tatt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................AGTTCCAGGTCAGCCAGAGCTACACAga.......................................... 28 ga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtata................................................................... 29 tata 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGata.................................................................... 27 ata 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtttt.................................................................... 28 tttt 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAttt................................................................... 29 ttt 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGaag.................................................................. 29 aag 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTttt..................................................................... 26 ttt 2.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGt.................................................................... 26 t 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtaag................................................................... 29 taag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGta.................................................................. 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCgta............................................................... 29 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAcaa................................................................... 29 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCAGCCAGAGCTACACAGAGAAAaa.................................... 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtag................................................................... 28 tag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgcgt................................................................... 27 gcgt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAatta................................................................... 29 atta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CAGCCAGAGCTACACAGAGAAATgtct................................... 27 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTt..................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGaata.................................................................... 28 aata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGatt.................................................................. 29 att 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGatt.................................................................... 27 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAaaaa............................................................. 35 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGttaa.................................................................... 29 ttaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTtta................................................................. 30 tta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAta................................................................... 29 ta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGagt.................................................................... 27 agt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAgaga............................................................. 32 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CAGCCAGAGCTACACAGAGAAAcg.................................... 24 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgtac................................................................... 26 gtac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGgta.................................................................. 26 gta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTtat..................................................................... 26 tat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GTCAGCCAGAGCTACACAGgtg......................................... 22 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAttaa................................................................... 30 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTtaat................................................................. 32 taat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTgcgt..................................................................... 25 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAagt................................................................... 28 agt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAatct................................................................... 29 atct 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGaag.................................................................... 27 aag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgga................................................................... 26 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtaaa................................................................... 30 taaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgagt................................................................... 26 gagt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAtt............................................................. 33 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTta..................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGga........................................................................ 25 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GGTCAGCCAGAGCTACACAGggga......................................... 24 ggga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAaaaa................................................................... 32 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGaaga.................................................................... 28 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGgta.................................................................... 24 gta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgtt................................................................... 26 gtt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGtaat.................................................................... 29 taat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGgatc.................................................................... 25 gatc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAataa................................................................... 29 ataa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTt................................................................. 29 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgttt................................................................... 30 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGgaaa.................................................................. 27 gaaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAtaa................................................................... 29 taa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGaaaa.................................................................. 30 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGgaa.................................................................... 28 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGat.................................................................. 28 at 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAgcag................................................................... 27 gcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTtt..................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AGGTCAGCCAGAGCTACACAGAatc........................................ 25 atc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGttt.................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGTGCAGCTTCTTCCT..................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGATCTCTTGAGTTCTAGGCCAGCCTG................................................................................ 27 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - -