(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(26)
TESTES

Sense strand
CCTCCCGGGCGTCCAGAGGCGGAAGTGAAAGGTGTCTACCGGGAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATGCAGTGTGCGGGCTGGGGCTGGGGAGCTGCTGGAGCCTTTGCGAGCGGCTTGCGAGTCTCTGCTAGACAGGGCGATGAATGGCTAAAGGCCATTGCAGAACTGCCCGAGGGAAGGCGAGCCTTCGATGTGGGATTACGGCGGTTCTGAGTTTAGACTCATCAAGCCCTCCACACTTCGTACAGCAA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.....................................ACCGGGAGCGTTGGTAGG................................................................................................................................................................................................... 18 2 6.00 6.00 5.00 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCTAGACAGGGCGATGAATGGCTAA.................................................................................................... 26 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - 1.50 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CGGGAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATGCAGTG.................................................................................................................................................................................... 31 2 3.50 3.50 - - - - - 3.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGCAGTGTGCGGGCTGG.......................................................................................................................................................................... 18 2 1.50 1.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAGCGCGGATGCAGTG.................................................................................................................................................................................... 18 2 1.50 1.50 - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCTAGACAGGGCGATGAATGGCTAAA................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
....................................TACCGGGAGCGTTGGTAG.................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAGCGCGGATGCAGgg.................................................................................................................................................................................... 18 gg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGTGCGGGCTGGcgga...................................................................................................................................................................... 17 cgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............CAGAGGCGGAAGTGAAAGGTG........................................................................................................................................................................................................................ 21 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGCAGTGTGCGGGCTGGG......................................................................................................................................................................... 19 2 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AGCGTTGGTAGGAGCGCGGATt......................................................................................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ACCGGGAGCGTTGGTAGGA.................................................................................................................................................................................................. 19 2 1.00 1.00 - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CGGGCTGGGGCTGGGGAGCTG............................................................................................................................................................. 21 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGCGAGTCTCTGCTAGACAGGGCGATt............................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTCGATGTGGGATTACGGCGGTTCTt....................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCATTGCAGAACTGCCCGAGGGcag........................................................................ 25 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................GCGGGCTGGGGCTGGGGA................................................................................................................................................................. 18 3 0.67 0.67 - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAGCGCGGATGCAGTGTG.................................................................................................................................................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CGCGGATGCAGTGTGCGGGCTGGGGC....................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCAGAGGCGGAAGTGAAAGGT......................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CGGGAGCGTTGGTAGGAGC................................................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.............................AGGTGTCTACCGGGAGCGTTGG....................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ACCGGGAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATGCAGT..................................................................................................................................................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GGTGTCTACCGGGAGCGTTGGTAGG................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GATGCAGTGTGCGGGCTGGGG........................................................................................................................................................................ 21 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CCGGGCGTCCAGAGGCGGAAGTGAA............................................................................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
.........................TGAAAGGTGTCTACCGGGAGCGTTGG....................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGCTAGACAGGGCGATGAATGGCTA..................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GTCCAGAGGCGGAAGTGAAAGGTG........................................................................................................................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTACCGGGAGCGTTGGTAGGAG................................................................................................................................................................................................. 23 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGAGCGCGGATGCAGTG.................................................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCGATGTGGGATTACGGCGGT........................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
.............................AGGTGTCTACCGGGAGCGTTGGTAGGA.................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
..............AGAGGCGGAAGTGAAAGGT......................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGACAGGGCGATGAATGGCTAAAGG................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
.............................................................................................................................................................TGCAGAACTGCCCGAGGGAAGGCGAGC.................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GCGGATGCAGTGTGCGGGCTGGG......................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGAGCGCGGATGCAGT..................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGGTAGGAGCGCGGATGCAGTGT................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.........................................GGAGCGTTGGTAGGA.................................................................................................................................................................................................. 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GCGTTGGTAGGAGCGCGGA........................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ACCGGGAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATGCAG...................................................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AGGGCGATGAATGGCTAAA................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................AGGTGTCTACCGGGAGCG........................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGATGCAGTGTGCGGGCTGGGGCTGGGGAG................................................................................................................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.................................GTCTACCGGGAGCGTTGGTAGGAGC................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
...................................................................GTGTGCGGGCTGGGGCTGGGGAGC............................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GAAGGCGAGCCTTCGATGTGGGATTACGGCGG............................................ 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
..............AGAGGCGGAAGTGAAAGGTGT....................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGGTAGGAGCGCGGATGCAG...................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................CTGGAGCCTTTGCGAGCG........................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CTTCGATGTGGGATTACG................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CGGTTCTGAGTTTAG................................ 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGCAGTGTGCGGGCTGGGGCTG..................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..............AGAGGCGGAAGTGAAAGGTGTCT..................................................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.......................................................................GCGGGCTGGGGCTGGGGAGCTGCTGGAGC...................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAAGGTGTCTACCGGGAGCGTTGGTAGG................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
.......................................................................................................TGCGAGCGGCTTGCGAGTCTCTGCT.......................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AGCGTTGGTAGGAGCGCGGATG......................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
...................................................TAGGAGCGCGGATGCAG...................................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATG......................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GTCTACCGGGAGCGTTGGTAGGA.................................................................................................................................................................................................. 23 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GAGTCTCTGCTAGACAGG................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTCGATGTGGGATTACGGC.............................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GGAGCGCGGATGCAGTG.................................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CGGGAGCGTTGGTAGGAG................................................................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
........................................................................CGGGCTGGGGCTGGGGAGC............................................................................................................................................................... 19 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CGGGCTGGGGCTGGGGAG................................................................................................................................................................ 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGCAGTGTGCGGGCT............................................................................................................................................................................ 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGTGCGGGCTGGGG........................................................................................................................................................................ 15 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCTCCCGGGCGTCCAGAGGCGGAAGTGAAAGGTGTCTACCGGGAGCGTTGGTAGGAGCGCGGATGCAGTGTGCGGGCTGGGGCTGGGGAGCTGCTGGAGCCTTTGCGAGCGGCTTGCGAGTCTCTGCTAGACAGGGCGATGAATGGCTAAAGGCCATTGCAGAACTGCCCGAGGGAAGGCGAGCCTTCGATGTGGGATTACGGCGGTTCTGAGTTTAGACTCATCAAGCCCTCCACACTTCGTACAGCAA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)