chr4:148492988 148493237 +
(6)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(35)
TESTES

Sense strand
AAAAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAAAGGGGAGGAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGCAGAGGCTCAGAGGCGCGGTGTCTCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTCTGAGCTGGGA
...............................................((...........(((((......((((......)))).....(((....))).)))))..............((.....)))).......................................................................................................................
..............................................47.......................................................................................136................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGC............................................................................................................................ 27 1 45.00 45.00 8.00 9.00 5.00 2.00 1.00 - 2.00 2.00 3.00 10.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCA...................................................................................................................... 27 1 42.00 42.00 15.00 11.00 5.00 2.00 1.00 4.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATC............................................................................................................................................................................ 27 1 34.00 34.00 17.00 10.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCA........................................................................................................................... 26 1 34.00 34.00 15.00 11.00 1.00 2.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTC................................................................................................................................................. 26 1 27.00 27.00 1.00 - - - 7.00 4.00 10.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................AGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGC................................................................................................................................................................................. 27 1 25.00 25.00 9.00 8.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCA........................................................................................................................... 28 1 22.00 22.00 10.00 7.00 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGT.................................................................................................................................................. 25 1 20.00 20.00 - - - - 10.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAG.......................................................................................................................... 27 1 18.00 18.00 8.00 3.00 2.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCC....................................................................................................................... 26 1 15.00 15.00 4.00 8.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATC............................................................................................................................................................................ 28 1 13.00 13.00 4.00 7.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AAAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAA............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 3.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCA................................................................................................................................................................................ 28 1 9.00 9.00 3.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCA............................ 27 1 9.00 9.00 3.00 - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAG..................................................................................................................... 28 1 9.00 9.00 3.00 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCA........................................................................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 4.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAA........................... 28 1 7.00 7.00 1.00 2.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATC............................... 28 1 7.00 7.00 - 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCA................................................................................................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 2.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGG.................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAG.......................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCA........................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAA............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGC.................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AAGGAAGACAAGACAGGCACATCATAGT....................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCAGGCCGGCCTATGTCTAAAGAGA......................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 1.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAG.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTC.......... 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGAC..................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCC........................................................................................................................ 29 1 4.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGAC..................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCA........................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACAT............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCT........... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAG............................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGt............................................................................................................................ 27 t 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGC......................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTA..................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGC............................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTC.......... 29 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACA.............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...............................................................................................................................................................................................TCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGA................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTa................................................................................................................................................. 26 a 2.00 20.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACA.............................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCt................................................................................................................................................................................ 27 t 2.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGC............ 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGC............ 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCC....................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCATA......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGTCTCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTC................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCC....................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAAA.......................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTAT.................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCt........................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 13.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGcc................................................................................................................................................................................. 28 cc 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAG...................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCAT.......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AAAGGAAGACAAGACAGGCACATCATA......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................AAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAG.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACA.................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAA....................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCT................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCCAAGGAGGATCCCAAAGCCCTGGaaa................ 28 aaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AGGAAGACAAGACAGGCACATCATAGT....................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGA................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTCCAGGCCGGCCTATGTCTAAAGAG.......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AGGAAGACAAGACAGGCACATCATAG........................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACA.................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATT............................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGA.............................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCC....................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GTGGTTCTCATTCTCGCTGCAGTCTG.............................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGG.................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGC................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCC....................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAt........................................................................................................................................................................................ 25 t 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCA........................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGG............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGA................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGACAAGACAGGCACATCATAGTGCGTTC................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAG................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAAA.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCAGGCCGGCCTATGTCTAAAGAGAAG....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGaa................................................................................................................................................................................ 27 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCT................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGAC..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TCTCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCA........................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATC............................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGt............................................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGC......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGt........................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGCCCTGGCTGTCGCTCTGAGCTGGt. 27 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GGATCCCAAAGCCCTGGCTGgcgc............ 24 gcgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................GGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGC................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGC................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAG................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATC............................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGAGGCTCAGAGGCGCGGTGTCTCTC................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................AGCGAGGCGCAGAGGCTCAGAGGCGta............................................................................................ 27 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTt............................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCC........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GGCGCAGAGGCTCAGAGGCGCGGTGTt....................................................................................... 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTAAA............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CAGTGGTTCTCATTCTCGCTGCAGTCT............................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTC................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGt........................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGAt..................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AAAGGAAGACAAGACAGGCACATCAT.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTAA.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTC................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAa.......................................................................................................................... 29 a 1.00 22.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TCTCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCC......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGA...................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAG................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CCTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCG............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATG................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGAT................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGC............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGCCaaa.................... 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTA............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACAa............................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCT...................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGCCC...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CGCGGTGTCTCTCAGTCTCTCTCAGTG..................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGCCTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGC................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGTCGCTCTGAGCTGGGAct 24 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGC............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCTCTCAGTGGTTCTCATTCTCGC....................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGt...................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCA...................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAG......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CTCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCA........................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAAA......................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGC........................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GGCCGGCCTATGTCTAAAGAGAAGAAAG................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGAC..................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGA.............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAAAGG....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGt............................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCATA......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATa............................................................................................................................................................................ 28 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGt.................................................................................................................... 29 t 1.00 9.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGcacg........................................................................................................................................................................................... 22 cacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.AAAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGA................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................AGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCA...................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................GAAGAAAGTGCGAGCAcccc....................................................................................................................... 20 cccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAt.......................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAaa............................................................................................................................................................................................................................. 27 aa 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGgagc......................................................................................................................... 28 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................CTCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATT............................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTA..................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAA.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GACAAGACAGGCACATCATAGTGCGTTC................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATTCT.......................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCa....................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGCCa...................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAG...................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGt............ 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTA............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCA................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CATCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCT...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCa................................................................................................................................................ 27 a 1.00 27.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAGGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTC.......... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCGCGGTGTCTCTCAGTCTCTCTC......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTAt.............................................................................................................................................. 29 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGTCGCTCTGAGCTGGGAcatt 26 catt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGa............................................................................................................................ 27 a 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTC.......... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGC........................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGAT................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAAAG........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGt............................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGG............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATTC........................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCA................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGC............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGA.................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGt......................................................................................................................... 28 t 1.00 18.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCA...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AGGAAAGGAAGACAAGACAGGCAC............................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGt................................................................................................................................................................................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAA.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAa.............................................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGA...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAG................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACAT............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTCT......... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGg............................................................................................................................ 27 g 1.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAGTGCGTTCCAGGCCGGCCT...................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGT.................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGC............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCC.............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACt.................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGgcc...................... 26 gcc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTCAGTGGTTCTCATTCTCGCTGCAGTC................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCAT.......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................AAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACA.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................CCGGCCTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTG................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAA........................................................................................................................................................................................ 25 3 0.67 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GGAAAGGAAGACAAGACA.................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGGAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGA........................................................................................................................................................................................... 26 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AAAGAAAGAAGGGGGTGG.................................................................................................................................................................................................................................... 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAAAAAAGAAAGAAGGGGGTGGGGGAAGGGAAAGGGGAGGAAGGAAAGGAAAGGAAAGGAAGACAAGACAGGCACATCATAGTGCGTTCCAGGCCGGCCTATGTCTAAAGAGAAGAAAGTGCGAGCAGCCCAGCGAGGCGCAGAGGCTCAGAGGCGCGGTGTCTCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCTCATTCTCGCTGCAGTCTGTCTCCAAGGAGGATCCCAAAGCCCTGGCTGTCGCTCTGAGCTGGGA
...............................................((...........(((((......((((......)))).....(((....))).)))))..............((.....)))).......................................................................................................................
..............................................47.......................................................................................136................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................................................................................................GGCGCGGTGTCTCTCAGTCTCTCTCA........................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GTCTCTCAGTCTCTCTCAGTGGTTCT................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CTCAGTGGTTCTCATTCTC......................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -