chr4:147991475 147991724 -
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(44)
TESTES

Sense strand
TTTCTCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGGTGTTCCATTTTTATCCGCTACTCTTTATTTCATGGAGTCGTATCAACGCTATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTTTTGAAACCTTGTGTGGGATTGATGGTGGTGCCGAGGCATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGCAGAGACTTGGTGGTGGAAAATGGA
.....................................................................................................((((((..((((((((..((........))((((((..........))))))...)))))))).......))))))((((....)))).............................................................
.....................................................................................................102.........................................................................................194......................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACC...................................................................................................................... 26 1 17.00 17.00 7.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................AACGCTATGAACGCAAGGC.................................................................................................................................... 19 1 13.00 13.00 - - 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTT.......................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 5.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACA........................................................................................................................................................................................................................ 27 2 8.50 8.50 4.50 1.50 - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAG.................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAAC...................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 26 2 5.50 5.50 1.50 1.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTG......................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGC........................ 25 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 30 2 4.50 4.50 - - 4.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGC..................................................................................................................................................................................................................... 30 2 4.50 4.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCT.................................................................................................................................................................................................................... 27 2 4.00 4.00 1.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGGTG................................................................................................................................................................................................. 27 2 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTG......................... 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACC...................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGA......................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGC........................ 30 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAAC....................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGT.......................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTG............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGC.............................. 31 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATGGAAC....................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTT........................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGCAGA..................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCA..................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................CATGGAGTCGTATCAACGCTATGAACGC......................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGG...................................................................................................................................................................................................................... 29 2 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCt..................................................................................................................... 27 t 2.00 17.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................ATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGA........................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGC............................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................. 29 2 2.00 2.00 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAG.................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTT.................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAG................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GAAAAGGAGAGCGCGTGCAGAGA................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCTG............................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAAC...................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATG........................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCA.......................................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.50 1.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGA................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCT.............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTTTTGAAA.............................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATGGAACCAGAAGGCTGTTT.......................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGA........................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTATGAACGCAAGGCTG.................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GCTACTCTTTATTTCATGGAG.............................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGCAAGGCTGTGATATGGAACC...................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATGGAACCAGAAGGCTG............................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAAa....................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTtatc...................................................................................................... 28 tatc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CCAGAAGGCTGTTTGAAC...................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATGGAACCAGAAGGCTGTTT.......................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCAgagg...................................................................................................................................................................................................................... 29 gagg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTATTTCATGGAGTCGTA......................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTG......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTT.......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGAGAGCGCGTGCAGAGA................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGC........................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGG.................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
............................TGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGGT.................................................................................................................................................................................................. 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGG...................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATGGAACCAGAAGGCTGTT........................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCT.................................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAACGCAAGGCTGTGATATGGAAac...................................................................................................................... 26 ac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAA........................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CTTGGTGGTGGAAAATGGA 19 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTT........................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGg.................................................................................................................................................................................................................. 29 g 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCTGT............................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ACCAGAAGGCTGTTTGAAC...................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGCAGA..................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAG................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTT.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATTCGTCATCACGCTGCACAGGC..................................................................................................................................................................................................................... 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGGCTGCGTCTTTGACG........................................................................................................................................................................................................ 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCT.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGC..................................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGt..................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGA.................................. 31 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGC........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TATCAACGCTATGAACGCAAGGCTGTG................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGG................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGC..................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGC........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTT.................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTATTTCATGGAGTCGTATCAACGC.................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGt................................ 27 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAA.................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACGCAAGGCTGTGATATGGAAC....................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGA................................ 28 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GAAAAGGAGAGCGCGTGCAGAGACTTG............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................ACAGGCTGCGTCTTTGAC......................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACT..................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCT.................................................................................................................................................................................................................... 31 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
.....................................................................................................................................................................GGATTGATGGTGGTGCCGAGGCATG............................................................ 25 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGcc............................................................................................................... 27 cc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CGAGAAAAGGAGAGCGCGT.......................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGt........................................................................................................ 28 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................ATGGAGTCGTATCAACGCTATGAACGCAAGGC.................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAAACCTTGTGTGGGATTGATGGTG......................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACCTTGTGTGGGATTGATGGTGGTGC..................................................................... 26 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGt..................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGA........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCGTATCAACGCTATGAACGCAAGG..................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTATCAACGCTATGAACGCAAGGCTGTGA............................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................ACTTGGTGGTGGAAAATGGA 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGAACTTTTGAAACCTTGTGTGGGATT................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGCGCGTGCAGAGACTTGGTGGTGGAA...... 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGC........................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................AGGCATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAA..................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GCTGTTTGAACTTTTGAAAC............................................................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGtt.................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAG.................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAAACCTTGTGTGGGATTGATGGT.......................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................ATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAG................................. 30 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GAGCGCGTGCAGAGACTTGGTGGTGG........ 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCTTGTGTGGGATTGATGG........................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACCTTGTGTGGGATTGATGGTGGTG...................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTTGACGGTGGGTGTTCCATTTTTATCCG.................................................................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAGG...................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GACTTGGTGGTGGAAAATG.. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GTGCCGAGGCATGAAAGGCTAGTATGAGCGA.......................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACt........................................................................................................................................................................................................................ 27 t 0.50 5.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TGATGGTGGTGCCGAGGCATGAAAGGCTA.................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGAATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.............AATTCGTCATCACGCTGCACAG....................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCT.................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGCGCGTGCAGAGACTTGGTGGTGGA....... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGG...................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGt...................................................................................................................................................................................................................... 29 t 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAG............................... 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CATCCAAGAATTCGTCATCACGCT............................................................................................................................................................................................................................. 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACA........................................................................................................................................................................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTG..................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTTGAAACCTTGTGTGGGATTGATG............................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
........CCAAGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGACTTGGTGGTGGAAAATGGA 27 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGC..................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGA................................ 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGGT.................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAAACCTTGTGTGGGATTGATGG........................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................. 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGG................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGC........................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAA....................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AGAAGGCTGTTTGAACTTTTGAAACCTTGTGTGGGA.................................................................................. 36 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGG.................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCAC......................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GTGCCGAGGCATGAAAGGCTAGTATGA.............................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACA........................................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GTCATCACGCTGCACAGG...................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTGTGTGGGATTGATGG........................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AGAAGGCTGTTTGAACT..................................................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ACCAGAAGGCTGTTTG......................................................................................................... 16 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTTCTCATCCAAGAATTCGTCATCACGCTGCACAGGCTGCGTCTTTGACGGTGGGTGTTCCATTTTTATCCGCTACTCTTTATTTCATGGAGTCGTATCAACGCTATGAACGCAAGGCTGTGATATGGAACCAGAAGGCTGTTTGAACTTTTGAAACCTTGTGTGGGATTGATGGTGGTGCCGAGGCATGAAAGGCTAGTATGAGCGAGAAAAGGAGAGCGCGTGCAGAGACTTGGTGGTGGAAAATGGA
.....................................................................................................((((((..((((((((..((........))((((((..........))))))...)))))))).......))))))((((....)))).............................................................
.....................................................................................................102.........................................................................................194......................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
.....................................................................................................................................AGGCTGTTTGAACTTTTgt.................................................................................................. 19 gt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGGCTGTTTGAACTTTgt................................................................................................... 18 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................AGGCTGTTTGAACTgatt..................................................................................................... 18 gatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -