| Gene: AK163132 | ID: uc008vtb.1_intron_2_0_chr4_147181293_r.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
(7) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(32) TESTES |
| GTTGTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGCAGGCGTGTGGAGCAGGGGTGCATTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCTGAAAACTCCCTTAAGCTGCAGTTGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACGG |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGa...... | 19 | a | 12.00 | 0.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAC.. | 26 | 4 | 10.00 | 10.00 | - | 1.00 | 3.50 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAA... | 25 | 4 | 8.50 | 8.50 | 5.00 | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................AGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACA............................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 7.00 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGG................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................AGCTGTTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGG................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 6.00 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGA............................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 4.50 | 4.50 | - | 1.00 | - | 0.50 | - | 2.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................AGGAGCTGTTGGACTGGGGAAtgg | 24 | tgg | 4.00 | 0.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TCCTAGGACATTGAGCAGCTGa........................................................................................................................................................................................................................ | 22 | a | 4.00 | 0.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAA.................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAAC................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACG. | 27 | 3 | 2.67 | 2.67 | 1.00 | - | 0.67 | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGAC.......... | 24 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGG............................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCttg........................................ | 27 | ttg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGa............................................................................................................................................................... | 27 | a | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTagg................................................................................................................................................................................. | 29 | agg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACT.................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGAC..................................................................................................................................................................................... | 24 | 3 | 1.67 | 1.67 | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACGG | 28 | 3 | 1.67 | 1.67 | 1.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAGAGGAGC.................. | 30 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAtg. | 27 | tg | 1.50 | 8.50 | - | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGG................................................................................................................................................................................. | 28 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................CTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGCAGt........................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACT.................................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAC.. | 25 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGG..... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................CCTTAAGCTGCAGTTGCCCCTCCTA.............................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGag............................................................................................................................................................... | 28 | ag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG....... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................GTTGGACTGGGGAACAGGCAGG...................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTG................................................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................CCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTaga................................................................................................................................................................................. | 27 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACa.................................................................................................................................................................. | 25 | a | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................TGAAAACTCCCTTAAGCTGCAGTTGCCCC................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACaaa................................................................................................................................................................ | 27 | aaa | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGG................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGG............................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAAC................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................CAGGAACTGGGCAGGCGTGTGGAGCAGG.............................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................AGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGaaa................................................................................................................................................................................ | 26 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCCTGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGa.......................................................................................................................................................................................... | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACT......... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACA............................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................TAAGCTGCAGTTGCCCCTCCTAGGACATT....................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAtctg........................................................................................................................................................................................... | 19 | tctg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGa....................................................................................................................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................AGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGA.... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAGC................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGa....................................................................................................................................................................................... | 23 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGGAGCAGGGGTGCATTTTCTGCCGa............................................................................................................................. | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGCAGGCGTGTGGtt.................................................................................................................................................. | 40 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAG................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGCA............................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................TTGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAGC................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGa................................................................................................................................................................ | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGC.............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TTGGACTGGGGAACAGGCAGG...................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAtgg | 28 | tgg | 1.00 | 8.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACGG | 25 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGA...................................................................................................................................................................................... | 24 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACG. | 24 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCTG.............................................................................................. | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................AGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACG. | 25 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................AGGACATTGAGCAGCTGG........................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 18 | 0.56 | 0.56 | - | 0.11 | - | - | - | 0.33 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAC............................................................................................................................................................................. | 27 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................CCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTG........ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................CACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG.................................................................................................................................................................................. | 32 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................AGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAC.. | 24 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................GTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGA.... | 25 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CAGAGGAGCTGTTGGACTGGGG..... | 22 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................TTCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTG........ | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCGCCATTCTCACAATTCAGTGTTTG....................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGG...... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAt............................................................................................................................................................................. | 26 | t | 0.50 | 8.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................AGAGGAGCTGTTGGACTGGGGA............................................................................................................................................................................... | 22 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAA... | 24 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGG................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGTCACCTTCCAAGTCAGAGGAGCTGT............... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAC............................................................................................................................................................................. | 23 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................CAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG....... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGA...................................................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAAa.. | 26 | a | 0.50 | 8.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................TTCCAAGTCAGAGGAGCTGTTG............. | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGG........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 16 | 0.44 | 0.44 | 0.19 | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTC................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 16 | 0.38 | 0.38 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTC................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 16 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | 0.12 | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGG...... | 22 | 11 | 0.36 | 0.36 | - | 0.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGA...................................................................................................................................................................................... | 23 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGAGCTGTTGGACTGGGGAACGG | 23 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................CCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGA...................................................................................................................................................................................... | 22 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG.................................................................................................................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TCTCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCT............................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTG................................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACGa | 28 | a | 0.33 | 2.67 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGt.................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 0.33 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCTGAA............................................................................................ | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................CCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG.................................................................................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCTGA............................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGAC..................................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................AGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGA............................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGC........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 16 | 0.31 | 0.31 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.19 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGG................................................................................................................................................................................................ | 21 | 16 | 0.31 | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCA......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 13 | 0.31 | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.15 | - | - | - | - | - | - | 0.15 | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGT.......................................................................................................................................................................................... | 27 | 14 | 0.29 | 0.29 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCAGT............................................................................................................ | 27 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCACC................................... | 29 | 16 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................CAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGG.................................................................................................................................................................................. | 25 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....GCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGC........................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 16 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................CAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTG................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGC........................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 16 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.12 | - | 0.06 | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................CAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACT.................................................................................................................................................................................... | 23 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCA................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 16 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - |
| ...............TAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTG................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 17 | 0.24 | 0.24 | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............CCTAGGACATTGAGCAGCTG......................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 18 | 0.22 | 0.22 | - | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TGTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGC........................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 14 | 0.21 | 0.21 | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTG........................................................................................................................................................................................... | 26 | 14 | 0.21 | 0.21 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGGAGCAGGGGTGCATTTTCTGCCGC............................................................................................................................. | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTC...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 15 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................AGGAGCTGTTGGACTGGG...... | 18 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TTGTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGC.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................GTGTTTGCGGAACCTGAAA........................................................................................... | 19 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................TTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCC............................... | 26 | 13 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCA......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 13 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTC........................................................................................................................................................................................................... | 25 | 13 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCT............................................................................................................................................................................................ | 25 | 14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTCTGCCGCCATTCTCACAATTCAG............................................................................................................. | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTCTGCCGCCATTCTCACAATTCAGT............................................................................................................ | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTa...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | a | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGT....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGG....................................................................................................................................................................................... | 22 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.06 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCA............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............CCTAGGACATTGAGCAGCTGGT....................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TAGGACATTGAGCAGCTGGTCC..................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGT.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - |
| ............TCCTAGGACATTGAGCAGCTGGT....................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTC...................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................CCTAGGACATTGAGCAGCTGGTC........................................... | 23 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGG............................................. | 24 | 18 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................TTTTCTGCCGCCATTCTC...................................................................................................................... | 18 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............CTAGGACATTGAGCAG............................................................................................................................................................................................................................ | 16 | 18 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CCTCCTAGGACATTGAGCAGC................................................ | 21 | 18 | 0.11 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGGACATTGAGCAGCTG.............................................. | 18 | 18 | 0.11 | 0.11 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCCTGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGC............................................................................................................................................................................................. | 27 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TGTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAG............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...GTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGC........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AGGAACTGGGCAGGC.......................................................................................................................................................... | 15 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGC............................................................................................................................................................................................. | 24 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGa....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | a | 0.06 | 0.44 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGC.............................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GCCTCCTAGGACATTGAGCA............................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 |
| GTTGTGCTGGCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACAGGCAGGAACTGGGCAGGCGTGTGGAGCAGGGGTGCATTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCAGTGTTTGCGGAACCTGAAAACTCCCTTAAGCTGCAGTTGCCCCTCCTAGGACATTGAGCAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAGAGGAGCTGTTGGACTGGGGAACGG |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................GCATTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 29 | 2 | 5.00 | 5.00 | 4.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 25 | 7 | 4.71 | 4.71 | 1.86 | 0.86 | 0.57 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | - | 0.14 | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................GCTGGTCCTGTCACCTTCCAat.............................. | 22 | at | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................TTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 26 | 7 | 1.57 | 1.57 | 0.29 | 0.43 | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................CATTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................GCTGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAGA....................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TTTTCTGCCGCCATTCTCACAATTac................................................................................................................ | 26 | ac | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GTCACCTTCCAAGTCAGA....................... | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAa......................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................GCCGCCATTCTCACAATTCAGTGTTTGC...................................................................................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGCTGGTCCTGTCACCTTCCAAGTCAt......................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GCCATTCTCACAATTCAGTGTTTGCGGA................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................CAGGGGTGCATTTTCTGCCGCCATTCTCA..................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 23 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | 0.29 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTCTGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 24 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GCCATTCTCACAATTCAG............................................................................................................. | 18 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GCCATTCTCACAATTCAGT............................................................................................................ | 19 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGGAGCTGTTGGACTGGG...... | 19 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CGCCATTCTCACAATTCAGT............................................................................................................ | 20 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TGCCGCCATTCTCACAATTCA.............................................................................................................. | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................GCTGGTCCTGTCACCTTCCAGGTCA.................................................................................................................................................................................................... | 25 | 17 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................CATTCTCACAATTCAG............................................................................................................. | 16 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................GTCACCTTCCAGGTCAGAGGAGCTGTT......................................................................................................................................................................................... | 27 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................GCTGGTCCTGTCACCTTCCAGGTCAGAGGA............................................................................................................................................................................................... | 30 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................GCTGGTCCTGTCACCTTCCAGGTCAGA.................................................................................................................................................................................................. | 27 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |