(7)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
TATAGAAATCATGAATGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGAAAATCTGTTGGTAATTGATGATGGGTTCAAGTGTCAGAGTTTATGTTTACAGACTAAAGCTTAGCCATTGTTGAAGGGAGTTGGTGTGCATGCTAGAGTTTTGGGCTAGGGACTGTTTGTGTAAGGCAGTGACAGCTCAGCAGCCTAGAGGCACTGTCATGGTGGGCATCTGTGATCTAGACGTCCTTCACATGATATATGCAATATATTCCAGATGTTTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAGATAAGT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................GGGACTGTTTGTGTAAGGCAGTGACAGCTCAG............................................................................................................................ 32 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CTAGAGTTTTGGGCTAGGG......................................................................................................................................................... 19 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCTT............... 27 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CTTAGCCATTGTTGAAGGG.......................................................................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............AATGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........ATGAATGTGGTCTCCAGACAGT................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AATGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGAA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCTAGAGTTTTGGGCTAGGGACTG..................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CCATTGTTGAAGGGAGTTGGTGTGCATGC........................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAG...... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........ATGAATGTGGTCTCCAGACA.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
....................................................................................................................................................................................................TCATGGTGGGCATCTGTGATCTAGACG................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGGCATCTGTGATCTAGAC.................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GAGTTTTGGGCTAGGGAgt...................................................................................................................................................... 19 gt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................ACTGTCATGGTGGGCATCTGT........................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ATGAAGAAAATCTGTTG.............................................................................................................................................................................................................................................................. 17 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 0.33 0.33 - - - - - - -
....................................................................................................................GGAGTTGGTGTGCATGCTAGAGTTT................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GAAAATCTGTTGGTAATTGATGATGG................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAGTGATGAAGAAAATCTGTTGcatt.......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCt.................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GTTGGTGTGCATGCTAGA....................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGAAAATCTGTTGGTAAT......................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAATGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTCCAGACAGTGATGAAGAAAATCTG................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................ATGGGTTCAAGTGTCAGAGT................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCC.................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAG...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGGGCTAGGGACTGTTTGTGTAAGGCAGTG..................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGAGATTACAGgatg........................... 17 gatg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGC................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTTGGGCTAGGGACTGTT................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GATTACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAG...... 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GTTTTGGGCTAGGGACTGT.................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................GATGAAGAAAATCTGTTGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGAAAATCTGTTGGTAATTGATGATGG................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AATCTGTTGGTAATTGATGATGGGT.............................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCT................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................GGGACTGTTTGTGTAAGGCAGTGAC................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CTAGGGACTGTTTGTGTAAGG.......................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCATGAATGTGGTCTCCAGACAGTGt.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAGAT.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAG...... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCT................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTG......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TAGGGACTGTTTGTGTAAG........................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GATGTTTTGAGAGATTACAGAAGAAGtt....................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGCCTGCTTCCCTTGCAGA..... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAGGCCTGCTTCCCT........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................GTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGAAAATC................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCCAGACAGTGATGAAGAAAATCTGTTGca............................................................................................................................................................................................................................................................ 30 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTGTTGAAGGGAGTTGGTG.................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGCTAGGGACTGTTTGTG............................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GATGAAGAAAATCTGTTGGTAATTGATGATGG................................................................................................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TACAGACTAAAGCTTAGCCATTGTTGAAGGGA......................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GACAGTGATGAAGAAAATCTGTTGatg........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGt........ 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ATCTGTTGGTAATTGATGATGGGTTCA........................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GATGGGTTCAAGTGTCAGAGTTT.............................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGC................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................ACAGACTAAAGCTTAGCCAT.................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................TCTGTTGGTAATTGATGATGG................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCT................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCTAGAGTTTTGGGCTAGG.......................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAGAAGAAGAGaagc................... 18 aagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............TGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGAAAATt................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TAGAGTTTTGGGCTAGGGACTGTTTGT................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CATTGTTGAAGGGAGTTGGTGTGCATGC........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......ATCATGAATGTGGTCTCCAGACAGTGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCC............ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAAGAAAATCTGTTGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 16 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - -

Antisense strand
TATAGAAATCATGAATGTGGTCTCCAGACAGTGATGAAGAAAATCTGTTGGTAATTGATGATGGGTTCAAGTGTCAGAGTTTATGTTTACAGACTAAAGCTTAGCCATTGTTGAAGGGAGTTGGTGTGCATGCTAGAGTTTTGGGCTAGGGACTGTTTGTGTAAGGCAGTGACAGCTCAGCAGCCTAGAGGCACTGTCATGGTGGGCATCTGTGATCTAGACGTCCTTCACATGATATATGCAATATATTCCAGATGTTTTGAGAGATTACAGAAGAAGAGGCCTGCTTCCCTTGCAGATAAGT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)