(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(36)
TESTES

Sense strand
CTTCTCCCGCGCTCTGCGGCCAGCCTGCCCGGTCTTCCGTGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCTTATCCCCGTTAAGGCTTCTTATATAAAACTTGGGTGTATGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGCCTCCGAGGTTACAAGTTTTGGTCTTTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAGGTGAG
.......................................................................................................(((.(((((((.(((((..((((((...))))))..)))))....)))))))..)))..........................................................................................
.................................................................................................98..................................................................166..................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
...........................................................................................................................................................................................TATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATG..................................... 26 1 22.00 22.00 8.00 5.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGT......................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 2.00 3.00 4.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGC.................................... 25 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGCCT........................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGTT........................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGAT...................................... 25 1 4.00 4.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACG....... 29 10 3.30 3.30 1.70 0.30 0.30 - 0.20 0.20 - - 0.10 0.10 0.30 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGG........................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTG........................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGAT...................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGG.......................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAAGGCTTCTTATATAAAACTTGGGTGT..................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGC.......................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGG......................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTGT................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGCC......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGA....................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGCCTC....................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTGTT.................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTG.................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGA....................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGG........................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCT................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGAC........ 28 13 1.54 1.54 - - 0.15 0.08 - 0.38 - - 0.15 0.08 0.15 - - - - - 0.31 0.08 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAAG............................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATT............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGCTGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATT............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................GAATGGGGTCTGACGGTTGCTGTTAAGT.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TATAAAACTTGGGTGTATGCGTTTT............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTATGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACG........................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAAGGAGt........................... 30 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTG.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGCTGAAGGGGATGCTAA................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CTGACGGTTGCTGTTAAGTTCCGGT........................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................ATGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGT......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAt................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGt.......... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGataa................................. 29 ataa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGTCTTTTTATCATTTTGTAGGCTGAA............................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGG......................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCT.......................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TCTGACGGTTGCTGTTAAGTTCCGGa........................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGA....................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGCGGCCAGCCTGCCCGGTCTTCCGTG................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGATTTGCCTCCGAGGTTACAAGTT......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGA....................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AATGGGGTCTGACGGTTGCTGTT.................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGT......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAAGGCTTCTTATATAAAACTTGGGTG...................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTGT................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGAT.............................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAA................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGCTGAAGGGGATGC.................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCTT......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGt.......... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCCGTGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCC........................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGCTGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGA............................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGCTGAAGGGGATGCTA.................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGTT........................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ACCAAGGTGAAGGACGAGG.... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCTTATC...................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGC.................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGAT...................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCT..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCTTATCCCCG.................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATG..................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTTATCATTTTGTAGGCTGA............................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAAG............................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGACGGTTGCTGTTAAGTTCCGGTTC...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TAAAACTTGGGTGTATGCGTTTTTA.......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATG..................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................GTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGTT........................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGATGCTAAAGGAGACAAgg...................... 20 gg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGA...... 30 10 0.90 0.90 0.70 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 0.10 - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAG..... 28 10 0.80 0.80 0.10 0.30 0.20 - 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAG..... 29 10 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................CCAAGGTGAAGGACGAG..... 17 11 0.45 0.45 - - - - - - - 0.18 - - 0.18 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACG....... 27 10 0.40 0.40 0.20 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGA...... 26 10 0.40 0.40 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGA...... 27 10 0.40 0.40 - 0.10 0.20 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTG.............. 25 14 0.36 0.36 - - - - - - 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - -
...................................................................................................................................................................................................................................ACCAAGGTGAAGGACGAG..... 18 10 0.30 0.30 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAG..... 26 10 0.30 0.30 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGAC........ 31 13 0.23 0.23 - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGA............. 26 14 0.21 0.21 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 -
.................................................................................................................................................................................................................................AAACCAAGGTGAAGGACGAG..... 20 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - -
..................................................................................................................................................................................................................................AACCAAGGTGAAGGACGAG..... 19 10 0.20 0.20 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAt..... 29 t 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGA...... 28 10 0.20 0.20 - - 0.10 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGAC........ 27 13 0.15 0.15 - 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGAAGGGGATGCTAAAGGAGACAAAACC.................... 28 13 0.15 0.15 - - 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGA......... 29 14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGt...... 28 t 0.10 0.40 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................................AGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAa..... 28 a 0.10 0.40 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................................AGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACG....... 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - -
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......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAt..... 31 t 0.10 0.90 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAG..... 27 10 0.10 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACG....... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................................AGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAtt.... 29 tt 0.10 0.40 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGA...... 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - -
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......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACt....... 29 t 0.08 1.54 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGGGGATGCTAAAGGAGACAAAACC.................... 27 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................................................................AAGGGGATGCTAAAGGAGACAAAACCA................... 27 13 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAGGTG.............. 22 15 0.07 0.07 - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................................................................................................................................................................................................................TAAAGGAGACAAAACCAAG................. 19 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06
......................................................................................................................................................................................................AGGCTGAAGGGGATGCTAAAGGAGAC.......................... 26 16 0.06 0.06 - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGGGGATGCTAAAGGAGACAAA....................... 24 17 0.06 0.06 - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTTCTCCCGCGCTCTGCGGCCAGCCTGCCCGGTCTTCCGTGCGTCTCGGACTTTAGTTGGGCCTTATCCCCGTTAAGGCTTCTTATATAAAACTTGGGTGTATGCGTTTTTAGAATGGGGTCTGACGGTTGCTGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATTTGCCTCCGAGGTTACAAGTTTTGGTCTTTTTATCATTTTGTAGGCTGAAGGGGATGCTAAAGGAGACAAAACCAAGGTGAAGGACGAGGTGAG
.......................................................................................................(((.(((((((.(((((..((((((...))))))..)))))....)))))))..)))..........................................................................................
.................................................................................................98..................................................................166..................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
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small RNA cloning by length. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
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18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
.................................................................................................................................................................TCCGAGGTTACAAGTTTTGGTCTTTTTA............................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GCTGTTAAGTTCCGGTTCTCTGAGATT............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -