(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(33)
TESTES

Sense strand
GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGGCTGCCAGGCTCTCGAGGGAGATGTGGGCTCAGAAGTGTCCTCCCTCACCAGGTCAGTCTTCCTCTCACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGACTGCTGTCCACCTTGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGCCAA
.........................................................((((.....((((((.((((....((....(((((((..((.((((......(((((....)))))..((((((.....((((........)))))))))).))))))...)))))))...)).)))).)))))).......))))...............................................
..................................................51..........................................................................................................................................................207.........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
....................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAAC.......................................................................................................................................................................... 28 4 69.75 69.75 20.25 21.00 - 2.25 11.25 7.50 - - - 3.75 3.00 - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGC... 28 1 41.00 41.00 7.00 3.00 7.00 10.00 - 1.00 4.00 5.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCA..... 28 1 27.00 27.00 - - 9.00 8.00 - - 2.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGG................................................................................................................................................................ 27 5 22.80 22.80 10.20 6.00 - - 3.00 3.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACT.......................................................................................................................................................................................... 26 5 18.00 18.00 7.20 7.80 - - 1.20 - - - - - 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60 -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGA........................................................................................................................................................................................................... 28 5 16.80 16.80 4.20 5.40 0.60 2.40 1.80 0.60 0.60 - 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAG......................................................................................................................................................................................................... 28 5 13.20 13.20 3.60 4.20 0.60 1.80 - 1.20 1.20 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAG....................................................................................................................................................................................... 26 5 13.20 13.20 3.60 5.40 - 1.20 1.80 - - - - 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCC...... 27 1 12.00 12.00 3.00 1.00 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTG.................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 4.00 2.00 - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGA........................................................................................................................................................................................................................ 26 4 7.50 7.50 1.50 3.00 - 0.75 0.75 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - -
...........................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAA.................................................................................................................................................................................... 27 5 6.60 6.60 1.20 0.60 1.20 1.80 0.60 - 0.60 - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TCACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGAC............................................. 29 1 6.00 6.00 - - 2.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAG............................................................................................................................................................. 27 5 5.60 5.60 0.80 0.80 0.80 0.80 1.60 - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAAC................................................................................................................................................................................................ 26 4 5.25 5.25 2.25 1.50 - - 0.75 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGCC.. 29 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACT..................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAA........................................................................................................................................................................... 27 4 4.50 4.50 0.75 - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - 0.75 - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAG.... 27 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGGC......................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGAC............................................. 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGTAaagg.............................................................................................................................................................................................................. 25 aagg 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGC... 30 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCA..... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGCCA. 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - -
.........................AGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAt...................................................................................................................................................................................................... 27 t 3.00 0.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGt............................................................................................................................................................... 28 t 2.40 22.80 1.20 0.60 - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGG............................................................................................................................................................ 29 5 2.40 2.40 0.60 - - - - 1.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGt................................................................................................................................................................ 27 t 2.40 13.20 0.60 0.60 - - 0.60 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAA.............................................................................................................................................................. 29 5 2.40 2.40 - - 0.60 0.60 - - 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGG.................................................................................................................................................................................. 28 5 2.40 2.40 - - 0.80 - - - 0.80 - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACA..................................................................................................................................................................................................................... 29 4 2.25 2.25 - - - - - 0.75 0.75 - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGACTGCTGTCCACCTTGTGGATTtt....................... 26 tt 2.00 0.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCC...... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAt................................................................................................................................................................................ 33 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGGC......................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGGCTt....................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACACTGGATCCGTGGGCTGC...................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TTGTGGATTCTCACTACTGCACAGACC....... 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTGG........................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGCTCACAGCTGACTGCTGTCCACC.................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGG................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACAC...................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTAAGGAAGGGTACACTGGATCCG.............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGGCTGCCAGGCTCTCGAGGGAGATGT.................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTA............................................................................................................................................................................................................... 27 5 1.80 1.80 1.20 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGA........................................................................................................................................................................................................... 26 5 1.80 1.80 0.60 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGG................................................................................................................................................................ 24 5 1.60 1.60 - 1.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGA............................................................................................................................................................................................................................. 27 4 1.50 1.50 - 0.75 - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGG.................................................................................................................................................................................. 20 6 1.33 1.33 - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAG................................................................................................................................................................................... 29 5 1.20 1.20 - - - - - - 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGt............................................................................................................................................................ 31 t 1.20 0.60 - - - - - 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGT................................................................................................................................................................................................................... 26 5 1.20 1.20 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................AAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGA............................................................................................................................................................... 27 5 1.20 1.20 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTCACTACTGCAgtt.......... 17 gtt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGGT.......................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACA....................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TTGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCA..... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTAAGGAAGGGTACACTGGATCCGT............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACA......................................................................................................................................................................... 32 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................AGGGTACACTGGATCCGTGGGCTGCCAGGCT................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAt.... 29 t 1.00 27.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGCCAGGCTCTCGAGGGAGATGTGG................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGGT.......................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TTGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCC...... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGC... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACTAAGGAAGGGTACACTGGATCC............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGCt.. 29 t 1.00 41.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTaa................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTG............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGG........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTGCTCACAGCTGACTGCTGTCCAC................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGGA.................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TCACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGA.............................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAAGGGTACACTGGATCCGT............................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGAC........ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TCGAGGGAGATGTGGGCTCAGAAGTGT.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGCTCACAGCTGACTGCTGTCCACCTT................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCA..... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................ACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGGA.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTCACTACTGCACAGACCCAGCCAA 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCt...... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTCACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGAC............................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTCACTACTGCAggag......... 18 ggag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGG................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTGCTCACAGCTGACTGgt......................................... 19 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CAGGCTCTCGAGGGAGATGTGGGCT............................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTCACTACTGCACAGACCCAGCCAAgttt 31 gttt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GACTGCTGTCCACCTTGTGGATTCTCA..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGt.......................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCACTACTGCACAGACC....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................CTGTACCTTCTGCTCACAGCTGACTGCTG........................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGG................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGG............................................................................................................................................................ 27 5 0.80 0.80 - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGt................................................................................................................................................................................. 29 t 0.80 2.40 - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGGAATAGAACAGTACTAAGG................................................................................................................................................................ 21 5 0.80 0.80 - - - - - - - - - - - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAAC...................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.75 0.75 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGA....................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.75 0.75 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAG............................................................................................................................................................................. 25 4 0.75 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACA......................................................................................................................................................................... 27 4 0.75 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGT................................................................................................................................................................................................................... 31 4 0.75 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................ATAGAACAGTACTAAGGA..................................................................................................................................................................................... 18 6 0.67 0.67 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACA......................................................................................................................................................................... 26 5 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACAGTACTAAGGAAGGAATAG......................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.60 0.60 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGTAC................................................................................................................................................................................................................. 22 5 0.60 0.60 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGG.................................................................................................................................................................................. 31 5 0.60 0.60 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGT................................................................................................................................................................................................................... 20 5 0.60 0.60 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAg.............................................................................................................................................................. 29 g 0.60 16.80 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAa................................................................................................................................................................................... 30 a 0.60 2.40 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGtt.......................................................................................................................................................................................................... 29 tt 0.60 22.80 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAa....................................................................................................................................................................................... 26 a 0.60 0.60 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAG......................................................................................................................................................................................................... 30 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACT.................................................................................................................................................................... 25 5 0.60 0.60 - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAt................................................................................................................................................................................... 30 t 0.60 2.40 - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGt................................................................................................................................................................................. 30 t 0.60 2.40 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AACAGTACTAAGGAAGGAATAGAAC.......................................................................................................................................................................... 25 5 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAA........................................................................................................................................................................................ 25 5 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CTAAGGAAGGAATAGAAC................................................................................................................................................................................................ 18 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGG...................................................................................................................................................................................... 30 5 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAAT............................................................................................................................................................................... 32 4 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGA....................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTCACTACTGCAC............ 15 13 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGAATAGAACAGTACTAAGGAAGGGTACACTGGATCCGTGGGCTGCCAGGCTCTCGAGGGAGATGTGGGCTCAGAAGTGTCCTCCCTCACCAGGTCAGTCTTCCTCTCACCCTGTACCTTCTGCTCACAGCTGACTGCTGTCCACCTTGTGGATTCTCACTACTGCACAGACCCAGCCAA
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..................................................51..........................................................................................................................................................207.........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
.......................................................................................................................................................CCTCACCAGGTCAGTcgg................................................................................. 18 cgg 5.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CCTCACCAGGTCAGTcggg................................................................................. 19 cggg 5.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -