(6)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
CTCCCGGTGAGGGAGTAGAGAACAACAGTGAGAAATCCATGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTCTCAAAGTCCACATTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTCCGGGAGAGCCCTGGAGCCCAGCTCTCCAGCATCTGCATCCCAGCCCTGCAGACAATATCGCATTCTGCTATTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAAAAAATTTAGCTGTCGGAGAGAAGCTTTTGCAACCCAAGGAACTGCTGA
..................................................................................(((((((...........((((((((((((.....)))))))....)))))..((((((((((.........)))))).......((.....))......))))..))))))).......................................................
.........................................................................74.......................................................................................................................195.....................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCC................................................................................................................................................ 28 1 27.00 27.00 9.00 6.00 - 5.00 - - 2.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................................................................TGCTATTCTTGCTAggac........................................................... 18 ggac 19.00 0.00 - - - - 12.00 - - - - - - - - 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGC................................................................................................................................................. 27 1 18.00 18.00 1.00 3.00 - - - 10.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCT............................................................................................................................................... 29 1 15.00 15.00 3.00 2.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTC.............................................................................................................................................. 30 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAAAAATTTAGCTGTCGGAGAGAAGC........................ 27 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ATGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCT.......................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACAGAACATTAAGACAGAGCCTCCGG........................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAAAAATTTAGCTGTCGGAGAGAAG......................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................CAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTCC............................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTCC............................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCT............................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACAGAG.................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGC................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................................................................................CTGTCGGAGAGAAGCTTTTG................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTC.............................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCC................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCC................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................TTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTCCGG........................................................................................................................................... 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTC.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GAAATGATAGGCTGTGTCTCTCAAAG................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ATTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCC................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................................ATGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTCTC....................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTAGAGAACAACAGTGAGAAATCCATGGAAGG............................................................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTC.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................GGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTCTCA...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AATTTAGCTGTCGGAGAGA........................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TATTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAAAAAAT........................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAGCTGTCGGAGAGAAGCTTTTGCAACC.............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CCATGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTC......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCC................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAAA............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CAAAGTCCACATTAACAGAACAGAACATT........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACATTAAGACAGAGCCTCCGGGAGAGC..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCAGCCCTGCAGACAATATC................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................TGGAAGGAAATGATAGGCTGT.............................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAAAATTTAGCTGTCGGAGAGAAGC........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCAGCCCTGCAGACAATATCGCATT.............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AATGATAGGCTGTGTCTC......................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACAGAACATTAAGACAGAGCCTCCGG........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGGAGTAGAGAACAACAGTGAGAAATC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TGCTATTCTTGCTAggtc........................................................... 18 ggtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............GAGTAGAGAACAACAGTGAGAAATCCAT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAACAGAACAGAACATTAAGACA..................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTC......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCCCGGTGAGGGAGTAGAGAACAACAGTGAGAAATCCATGGAAGGAAATGATAGGCTGTGTCTCTCAAAGTCCACATTAACAGAACAGAACATTAAGACAGAGCCTCCGGGAGAGCCCTGGAGCCCAGCTCTCCAGCATCTGCATCCCAGCCCTGCAGACAATATCGCATTCTGCTATTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAAAAAATTTAGCTGTCGGAGAGAAGCTTTTGCAACCCAAGGAACTGCTGA
..................................................................................(((((((...........((((((((((((.....)))))))....)))))..((((((((((.........)))))).......((.....))......))))..))))))).......................................................
.........................................................................74.......................................................................................................................195.....................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
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mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..............................................................................................................................................................................GCTATTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAA................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTCTTCCAGAAAAAATTTAGCTGTCG................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TGCTATTCTTGCTACTTGTTCTTCCAGAAA............................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -