(7)
OTHER.mut
(3)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(28)
TESTES

Sense strand
CTGGAGTTCCACCAGCAACCATGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACATGGTAATGTATCCTGTGGGACATAGTACAAAGGAGATTCTTAATTTCACAACTTGAGTATTTTATTTTTCCTCTCTCTTTCTCTCTTTTTAAAGTAGCTGACTGGACTTTCAGTTCCCCCATTGTGTAAATATATATAATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCAAACAGATATGGTTGCCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
................................................................................GAGATTCTTAATTTCACAACTTGAGTATTTTATTTTTCCTCTCTCTTTCTCT...................................................................................................................... 52 1 30.00 30.00 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGGCAATGTAGAACTcaca............................. 21 caca 4.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTGAGGACTACTTTGGCAATGTA...................................... 23 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GAGGACTACTTTGGCAATGTAGA.................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................ATGATGGGAAGCGACATG........................................................................................................................................................................................................ 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GTATCCTGTGGGACATAGTACAAAGGAGA...................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCAAACA.............. 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACTTTGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCA.................. 35 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTGTGTAAATATATATAATAC............................................................ 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CTGTGGGACATAGTACAAAGGAGATTCT.................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTGTAAATATATATAATACTGAGGACTAC.................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGGCAATGTAGAACTcac.............................. 20 cac 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACC.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................CATGGTAATGTATCCTGTG......................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ATAATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAAC.................................. 33 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATGGGAAGCGACATG........................................................................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCAAA................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AAGTAGCTGACTGGACTTTCA.......................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAAC.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AAGTAGCTGACTGGACTTTC........................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................GTATCCTGTGGGACATAGTACAAAGGAGATT.................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TACTGAGGACTACTTTGGCAATGT....................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTGGCAATGTAGAACTATGTGT........................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGGTTCCATGATGGGA................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACA.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AATGTAGAACTATGTGTGG......................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ACTGAGGACTACTTTGGCAATG........................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAAC..................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACt.......................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................................TCTCTTTTTAAAGTAGCTGACTGGACTT............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACC.................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TAATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGA.................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CTTTGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACC.................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCACCAGCAACCATGAGTGGTTCCATGAT..................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................TGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGAC........................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAA................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAACT................................. 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAATGTATCCTGTGGGACATAGTACAAAGGAGA...................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTCTTTTTAAAGTAGCTGACTGGACT.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............CAGCAACCATGAGTGGTTCCATGATG.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................GAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACATt........................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AAGCGACATGGTAATGTATCCTGTGGGA...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CTTTGGCAATGTAGAACTATGTGTGG......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................ATGTATCCTGTGGGAatgt.................................................................................................................................................................................. 19 atgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................GGGAAGCGACATGGTAAgaa................................................................................................................................................................................................. 20 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................AATATATATAATACTGAGGACT.................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CCTGTGGGACATAGTACAAAGG......................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGTGTGGTAACCCAAACAGAT........... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGGCAATGTAGAACTA................................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GGACATAGTACAAAGGAG....................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GGCAATGTAGAACTATGTGTGG......................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCAAACA.............. 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CACCAGCAACCATGAGTGGTTCCATc....................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGGAGTTCCACCAGCAACCATGAGTGGTTCCATGATGGGAAGCGACATGGTAATGTATCCTGTGGGACATAGTACAAAGGAGATTCTTAATTTCACAACTTGAGTATTTTATTTTTCCTCTCTCTTTCTCTCTTTTTAAAGTAGCTGACTGGACTTTCAGTTCCCCCATTGTGTAAATATATATAATACTGAGGACTACTTTGGCAATGTAGAACTATGTGTGGTAACCCAAACAGATATGGTTGCCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)