| Gene: Clspn | ID: uc008utl.1_intron_2_0_chr4_126237597_f.5p | SPECIES: mm9 |
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(2) PIWI.mut |
(36) TESTES |
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| ......TGGAGAAAATCAGGAGACTAAAAAAGAAG....................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................................................CTCTGTAGACCAGGTTGGCaa......................................................................................... | 21 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................TCGAACTCACAGAGACTTGCCTGCTT................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CTCGAACTCACAGAGACTTGCCTGCTTtt.............................................................. | 29 | tt | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGTTGGCCTaaat..................................................................................... | 28 | aaat | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................AAAAAAGAAGGAAACAAGATGTGAGGaa..................................................................................................................................................................................................... | 28 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGGAACTCACTCTGTAGACCAGGTTttt........................................................................................... | 28 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCGAttt................................................................................... | 30 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................TGTAGACCAGGTTGGCCTCGAACTagaa............................................................................... | 28 | agaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| GAACAATGGAGAAAATCAGGAGACTAAAAAAGAAGGAAACAAGATGTGAGGTATGCTGAAATTTTCTGACCTTTGTAACTGTTGTTATTGTTATTTTTGATCAGGGTCTCACCATGGAGCCTTCACTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCGAACTCACAGAGACTTGCCTGCTTCTGCCTCCCAAGTGCTAAGATTAAAGGTGTGTGCCACCATTGCCCGGCTGTTTCTTTCTTTCTT .......................................................................................................(((.....(((.(((..........))))))..........(((((.(((((.((.(((.........))).)).)))))..)))))..)))....................................................... ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) |
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| ...................................................................................................................................................CAGGTTGGCCTCGAACTCActt................................................................................. | 22 | ctt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CTTCTGCCTCCCAAGTGCTAAGAtgt............................................ | 26 | tgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................CACTGTCCTGGAACTCACTCTGTAcc....................................................................................................... | 26 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CTTCTGCCTCCCAAGTGCTAAggaa.............................................. | 25 | ggaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................................................GCCTTCACTGTCCTGGAACTCAC............................................................................................................. | 23 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 |
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