(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(38)
TESTES

Sense strand
GCCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGTGCCTGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTGGCTAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAACTGGCTGGCACCAGCTCCATCTGTGACACC
...................................................................((.((.((((.(((.((((.....((((.....)))).....((((((..........))))))......)))).))).)))))).))...............................................................................................
.....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
..........................................................TGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGC............................................................................................................................................ 52 1 44.00 44.00 44.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCC................................................................................................ 29 1 20.00 20.00 - 1.00 2.00 7.00 3.00 1.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... 26 1 19.00 19.00 - 5.00 2.00 - - - 2.00 - 2.00 1.00 - - - - 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGG............................................................................................................... 26 1 13.00 13.00 - 3.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... 29 1 13.00 13.00 - 2.00 2.00 2.00 5.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGT.............................................................................................. 31 1 13.00 13.00 - - - 5.00 1.00 5.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. 28 1 11.00 11.00 - 4.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCG............................................................................................... 30 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGG............................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCC.................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ 22 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGA............................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCT.................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCt................................................................................................... 30 t 3.00 13.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGt.............................................................................................................. 27 t 3.00 13.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCt................................................................................................ 30 t 2.00 0.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGt.............................................................................................................. 30 t 2.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCa................................................................................................... 26 a 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGT..................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAATGAATGTCTCCCCCCAAAC............................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGC................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGC................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGAa......................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................TATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGT...................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTT....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................AAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATT............................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGC............................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGA.......................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................GCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAG........................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCT....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................CATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGA............................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................TGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGAC.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGC......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAAC............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCC.................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATA................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAG........................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAaa.......................................................................................................... 31 aa 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAA............................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCtt.............................................................................................. 31 tt 1.00 20.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGT......................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGC................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................TTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAA..................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTT........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCa.................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGA.......................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGA............................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGT................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCt............................................................................................... 30 t 1.00 20.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTG............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCa................................................................................................ 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTC...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGcc.................................................................................................... 25 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGT.................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTt................................................................................................. 28 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCG................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGTGCCTGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTGGCTAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAACTGGCTGGCACCAGCTCCATCTGTGACACC
...................................................................((.((.((((.(((.((((.....((((.....)))).....((((((..........))))))......)))).))).)))))).))...............................................................................................
.....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
..........................CAGACCCAGTGCCTacgt.............................................................................................................................................................................................................. 18 acgt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -