| Gene: 2310005N01Rik | ID: uc008urs.1_intron_4_0_chr4_124780276_f.3p | SPECIES: mm9 | 
![]()  | 
    
    ![]()  | 
  
| 
  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (8)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (6)  PIWI.ip  | 
  
  
  (2)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (38)  TESTES  | 
  
  
| GCCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGTGCCTGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTGGCTAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAACTGGCTGGCACCAGCTCCATCTGTGACACC ...................................................................((.((.((((.(((.((((.....((((.....)))).....((((((..........))))))......)))).))).)))))).))............................................................................................... .....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................TGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGC............................................................................................................................................ | 52 | 1 | 44.00 | 44.00 | 44.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCC................................................................................................ | 29 | 1 | 20.00 | 20.00 | - | 1.00 | 2.00 | 7.00 | 3.00 | 1.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... | 26 | 1 | 19.00 | 19.00 | - | 5.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGG............................................................................................................... | 26 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... | 29 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGT.............................................................................................. | 31 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | - | - | 5.00 | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. | 28 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | 4.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCG............................................................................................... | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGG............................................................................................................... | 29 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................TGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCC.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGA............................................................................................................. | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCT.................................................................................................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................CATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCt................................................................................................... | 30 | t | 3.00 | 13.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGt.............................................................................................................. | 27 | t | 3.00 | 13.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCt................................................................................................ | 30 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGt.............................................................................................................. | 30 | t | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCa................................................................................................... | 26 | a | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGT..................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................GAATGAATGTCTCCCCCCAAAC............................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCC................................................................................................... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTC.................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .CCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGC................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................CTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGC................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................GTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGAa......................................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................TATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGT...................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................TGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTT....................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ............................................................................AAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATT............................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAGAC......................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................TCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGC............................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGA.......................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................GCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................ATTAGTAGAACAGCGGGAAG........................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................CGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCT....................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................CATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACC........................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................TAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGA............................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGAC.............................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................ATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGC......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................TTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAAC............................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCC.................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATA................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TAGAACAGCGGGAAGACCTG...................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................TCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAA............................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAG........................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAaa.......................................................................................................... | 31 | aa | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................TTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAA............................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCtt.............................................................................................. | 31 | tt | 1.00 | 20.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................TGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................TGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGT......................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................GCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGC................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTC................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAA..................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................TGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTT........................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................TAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCa.................................................................................................................................... | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ......................................................................................................................TCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGA.......................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................CTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGG.............................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCT....................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................TGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGA............................................................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................GACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGT................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCt............................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 20.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................TGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTG............................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................GTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCa................................................................................................ | 27 | a | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTC...................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGcc.................................................................................................... | 25 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........TGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGT.................................................................................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTt................................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................ATCATTAGTAGAACAGCG................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| GCCTGACTGTGGCCATCTGCCTCTGCCCCCCAGACCCAGTGCCTGTGACTGGCTAGTCTGACCTAACTGTAGTGACAAGTCCTCCCTATAAGACTTTTTGGGTCATTCGCTGCTGTCGTCATCATTAGTAGAACAGCGGGAAGACCTGTCCTCCGTCCCAGTCCCTGCGGGTGGCTAACTGTGCATTTCTCCCTTCTTAGAATGAATGTCTCCCCCCAAACTGGCTGGCACCAGCTCCATCTGTGACACC ...................................................................((.((.((((.(((.((((.....((((.....)))).....((((((..........))))))......)))).))).)))))).))............................................................................................... .....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................CAGACCCAGTGCCTacgt.............................................................................................................................................................................................................. | 18 | acgt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |