(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(38)
TESTES

Sense strand
CCGCTAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCATAGGCTAGGCGCTGGAGGCCCTGGTTGGCTCTACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCACATTACTGAGATGGACCACATTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATATCTTGTAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGTACCTGAAGAGAAAGTACCTCCTCTCCTCCATCCACTGGGGAGACTTGG
.......................................................................................................................(((((.(((.......(((......(((.((....)))))..((((...........)))).))).....))).)))))....................................................
.......................................................................................................................120.............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
..........TGATATCGCTAAGCACTGCCATAGGCTA.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 38.00 38.00 11.00 9.00 7.00 4.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGA................................................................................................... 27 1 11.00 11.00 4.00 - - 1.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
..........TGATATCGCTAAGCACTGCCATAGGC...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATA................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAG.................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCATA......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGAT.................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCA........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATATC............................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................TTTCTAATCACATTACTGAGATGGACCA................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCATAG........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CATTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCAT..................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCA.................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATAT................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGA.................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........TGATATCGCTAAGCACTGCCATAGG....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................................................................TAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCTT............................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATGACCTAGTGACACAGATATCTTGTA.......................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................TGACCTAGTGACACAGATATCTTGTAAGT....................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACC............................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCACATT.............................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGACCTAGTGACACAGATATCTTGTA.......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TATCTTGTAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGC...................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCcta......................................................................................................................................................................................................................... 29 cta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CATTACTGAGATGGACCACATTCAACA....................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGT................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGTAC.............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGATATCGCTAAGCACTGCCATAGGCTAGt.................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCTACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATC................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACC............................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAACTTCTGGGAAGGTACttga.......................................... 22 ttga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAACTTCTGGGAAGGTACCTGAAGA....................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATGACCTAGTGACACAGATATCTTG............................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TAATCACATTACTGAGATGGACCACA.............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGT........................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CCCATAAGAGCATATGAC................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAG.................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTC.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGG..................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGTGAC........................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCTAATCACATTACTGAGATGGACCACATT............................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GCATATGACCTAGTGACACAGATATCT.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGACCTAGTGACACAGAT.................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................TACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCACA................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATGACCTAGTGACACAGAT.................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGT................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAA................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGTGACACAGATATCTTGTAAGTTCCTTTT................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCTGGGAAGGTACCTGAAGAGAAAGT................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGTG.......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCTTA.............................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCT................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACC............................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CTGGGAAGGTACCTGAAGAGAAAGTA................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCTAATCACATTACTGAGATGGACCACA.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAGAGAAAGTACCTCCTCTCCTC.................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATG.................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................TACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCACAT............................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GTAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGT........................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATGACCTAGTGACACAGATATC............................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGG...................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TTTTTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTC......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ACATTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATA.................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................TGACACAGATATCTTGTAAGTTCCTTTTT............................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCTGGGAAGGTACCTGAAGA....................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGt................................................................................................... 27 t 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGT................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATGACCTAGTGACACAGATATCTTGT........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGGACCACATTCAACAGT..................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................TCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATA.................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................CTGCCATAGGCTAGGCGCTG............................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGTAGTCCCATAAGAGCATATGACCT.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAGAGAAAGTACCTCCTCTCCTCC................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCAT.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TCTTGTAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGC...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CCTTAACTTCTGGGAAGGTACCTGAAG........................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGTAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGT................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACcga................................................................................................... 27 cga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATGACCTAGTGACACAGATATCTTGTAAG........................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCTT............................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACCTA............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCTGCCTTGATTTCTAATCACATa.............................................................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGG................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGT................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATATt............................................................................................... 31 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGA.................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGAC................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TTTTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAA................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATGACCTAGTGACACAGAT.................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................TGGTTGGCTCTACTCTCCTGCCTTGATT.......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ACCTAGTGACACAGA................................................................................................... 15 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCGCTAACCCTGATATCGCTAAGCACTGCCATAGGCTAGGCGCTGGAGGCCCTGGTTGGCTCTACTCTCCTGCCTTGATTTCTAATCACATTACTGAGATGGACCACATTCAACAGTAGTCCCATAAGAGCATATGACCTAGTGACACAGATATCTTGTAAGTTCCTTTTTCTTCTGAGCAGTCCTTAACTTCTGGGAAGGTACCTGAAGAGAAAGTACCTCCTCTCCTCCATCCACTGGGGAGACTTGG
.......................................................................................................................(((((.(((.......(((......(((.((....)))))..((((...........)))).))).....))).)))))....................................................
.......................................................................................................................120.............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................................................................................................................TTCTGGGAAGGTACCTag............................................ 18 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -