(10)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(39)
TESTES

Sense strand
AAGCAGCTGGAGGCTGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAAGAGGCTCTGTTGTCCCCCTTTGTTGATGGACAGATCTTAATGCCGCATGGCATCCCAGCCTCAGTCAGGGGGTCCTACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGGAGTAATCATGCTGGAGCTAAGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGACTACATTGTAAGACCATGCATGTCTTTAAAACAAAACAAAA
............................................................................................................................((...((((((..(((((...(((.((.((.((....)).))))...)))..)))))...))))))...)).......................................................
............................................................................................................................125........................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGC................................................................................................................................................................................................................. 27 1 82.00 82.00 1.00 22.00 13.00 2.00 17.00 2.00 5.00 6.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAAG................................................................................................................................................................................................... 27 1 19.00 19.00 3.00 1.00 - 3.00 - - - - 10.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTG............................................................................................................................................................................................................... 26 1 14.00 14.00 - 1.00 - 1.00 - 8.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAAGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGC.................................................. 27 1 12.00 12.00 - 4.00 1.00 - 2.00 - 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAAGA.................................................................................................................................................................................................. 28 1 12.00 12.00 1.00 - - 2.00 - 6.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCgctc......................................... 21 gctc 11.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - 1.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCT................................................................................................................................................................................................................ 28 1 9.00 9.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGG.............................................................................................. 27 1 9.00 9.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTa....................................................................................................................................................................................................... 28 a 8.00 6.00 3.00 - - 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAG............................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgga.................................................................................................................................................................................................... 26 gga 6.00 0.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTA................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCT........................................................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................TGTTGATGGACAGATCTTAATGCCGCA..................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGCTGGAGCTAAGTTGAATGTCTGTG............................................................ 26 1 5.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGC......................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGGAG............................................................................................ 29 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................TTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGC......................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGG.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgaag................................................................................................................................................................................................... 27 gaag 4.00 0.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGaaa............................................................................................................................................................................................................... 29 aaa 3.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGC......................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAA.................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGGAGT........................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 -
..........................................................................TGTTGATGGACAGATCTTAATGCCGCAT.................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGTTGATGGACAGATCTTAATGCCGC...................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGGAGGCTGGTGACGTTGTTCTGG........................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGACTACcg................................... 27 cg 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGg...................................................................................................................................................................................................... 29 g 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAATCATGCTGGAGCTAAGTTGAATG.................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGG.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGC......................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCC................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgaa.................................................................................................................................................................................................... 26 gaa 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGa................................................................................................................................................................................................................. 27 a 2.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAG............................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......TGGAGGCTGGTGACGTTGTTCTGGACAAG...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GTTGTTCTGGACAAGatc................................................................................................................................................................................................................... 18 atc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGGA............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATCGACAAAAGCAAGTCAGGAGTAATCATG.................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTA..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGggt.................................................................................................................................................................................................... 29 ggt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt...................................... 24 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CTGTGAGTTCGAGGCCAGCCTGctta....................................... 26 ctta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCa........................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGACTACt.................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGAtaaa..................................... 25 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGC............................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgta.................................................................................................................................................................................................... 26 gta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGggag................................................................................................................................................................................................... 31 ggag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGctaa...................................... 24 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAAGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCC................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAAGAG................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGC................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCTGTGAGTTCGAGGCCAGCCTGcta........................................ 26 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGg...................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAAGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGg.................................................. 27 g 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTGGACTACATTGTAAGACCATGCATGTC................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................ACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAG............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGGACTACATTGTAAGACCATGCATGTCTTTt............. 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGAtc....................................... 23 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCCAGC.............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTat...................................................................................................................................................................................................... 29 at 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTga.................................................................................................................................................................................................... 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTG............................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgaa.................................................................................................................................................................................................... 29 gaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................ATGGACAGATCTTAATGCCGCATGGCATCCC............................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGA.............................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTTGTTGATGGACAGATCTTAATGCC........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGACAGATCTTAATGCCGCATGGCATCC............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCa................................................................................................................................................................................................................ 28 a 1.00 82.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTag...................................................................................................................................................................................................... 27 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCA................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTa....................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGC................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGATGGACAGATCTTAATGCCGC...................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGC......................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AGTTCGAGGCCAGCCTGGACTACAcat................................. 27 cat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGgag.................................................................................................................................................................................................... 26 gag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................AGCAAGTCAGGAGTAATCATGCTGGA............................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCCAG............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAa............................................................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTGGACTACATTGTAAGACCATGCATGTCTTT.............. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCCAGCCT............................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCT.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGTTGAATGTCTGTGAGTT........................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTCTGTGAGTTCGAGGCCAGCCTG........................................... 25 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAGCAGCTGGAGGCTGGTGACGTTGTTCTGGACAAGCTAGCTGAGCGGCTGTAAGAGGCTCTGTTGTCCCCCTTTGTTGATGGACAGATCTTAATGCCGCATGGCATCCCAGCCTCAGTCAGGGGGTCCTACAGAAATCGACAAAAGCAAGTCAGGAGTAATCATGCTGGAGCTAAGTTGAATGTCTGTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGACTACATTGTAAGACCATGCATGTCTTTAAAACAAAACAAAA
............................................................................................................................((...((((((..(((((...(((.((.((.((....)).))))...)))..)))))...))))))...)).......................................................
............................................................................................................................125........................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.............................................................................................................................................................................................TCGAGGCCAGCCTGGACTACAttaa.................................... 25 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -