chr4:123493314 123493563 +
(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(45)
TESTES

Sense strand
GTGAGTTGAGCTTCACCTGTGTGACTCACCCCACCCAGGGTAAATCACATTTTTGGTCAGTGGATAATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAGGACTTGGTGCTGAGCACAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTAAGCCACCAAGGCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTACA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAt....................................... 20 t 6.00 0.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATTAGACGTTCAGGACAGCGTGC................................................................................................................................................................. 25 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAGt...................................... 21 t 5.00 0.00 - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGa............. 26 a 4.00 0.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CGACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATaa.......................... 35 aa 4.00 0.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGTGGATAATTAGACGTTCAGGACAGC..................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAt................ 26 t 4.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................TAATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCA................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGt...................................... 20 t 4.00 0.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTa........... 28 a 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAacc..................................... 22 acc 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTcta.... 25 cta 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAGG............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGaa.................... 27 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GGTCAGTGGATAATTAGACGTTCAGG.......................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCca................ 26 ca 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAAa............................ 26 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGa............. 27 a 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAAa.................................. 24 a 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGTCAGTGGATAATTAGACGTTCAGG.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCAAAGCTTTATTcttt... 21 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAca............... 27 ca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCagt.................. 28 agt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATa....... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGta............................. 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATaaa..... 27 aaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTAAGC................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATta.......................... 31 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAG.............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCgt................ 21 gt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CGCGACCGGCCAGGAcga............................................. 18 cga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAtt............... 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTta..... 24 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaat...... 26 aat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaa....... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTta. 31 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAtct 30 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTatat........ 26 atat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTGGTGCTGAGCACAGAACTCAGAGCGTC.............................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GCCAGGAAGAACGCAGCAAACaa................................ 23 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTca..... 25 ca 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GCCAGGAAGAACGCAGCAAAaa................................. 22 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTACAaa 29 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGATAATTAGACGTTCAGGACAGCGTG.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTcttc...... 26 cttc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTActt...... 26 ctt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTaa.......... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAaca............ 30 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................CTTCTGCGGCAAAGCTTTATcct..... 23 cct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGAACGCAGCAAACCGGAtt............................ 21 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTa........................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAt................ 21 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTACctc 28 ctc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGATAATTAGACGTTCAGGACAGCGTGC................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCca................ 27 ca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCcta.. 29 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACtgtt.............................. 27 tgtt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGGAAGAACGCAGCAAACCGcaat............................ 26 caat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTActg...... 26 ctg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTa......................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCGCGACCGGCCAGGAAGAAaaa......................................... 23 aaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGCAAGGACTTGGTGCTGAGCACAGAACT....................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAAaga................................ 32 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCct... 28 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAGgaaa................................... 29 gaaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTCGCGACCGGCCAGGAAGAACGtta....................................... 26 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAGGACTT......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAAGAACGCAGCAAACCGGAAgt........................... 23 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGAAGAACGCAGCAAACCGGAAa............................ 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCagt.............................. 29 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAga............... 27 ga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAaa 26 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGaaa... 24 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTaa.. 25 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTacc.... 26 acc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAAGGACTTGGTGCTGAGCACAGAAC........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGATAATTAGACGTTCAGGACAGCGT................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGAGCTTCACCTGTGTGACTCACCCa.......................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGGCC.................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGat................. 25 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAGTGGATAATTAGACGTTCAGGACAGC..................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAaa 29 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGAAGAACGCAGCAAACCGGt.............................. 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GACCGGCCAGGAAGAAtc.......................................... 18 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGtt........................................ 18 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAg................ 18 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CTTTCATCCCTCTTACACGCGTTCGCGACC........................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTata. 25 ata 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAGGAC........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTtct 27 tct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GAACTCAGAGCGTCATGTGTACTAAGCC................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATag...... 26 ag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GGTAAATCACATTTTTGGTCAGTGG........................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAcc...................................... 21 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ACCGGAATCTTCTGCGGCAAAacta........... 25 acta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTcttt... 24 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCGCGACCGGCCAGGAAGAAaa.......................................... 22 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCa.......................... 33 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTTTTGGTCAGTGGATAATTAGACGTTC............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTA.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTtt. 26 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAtt 32 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTACACGCGTTCGCGACCGGCCcgt................................................. 25 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCA................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CAAAGCTTTATTGCTag.. 17 ag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACCGGAATCTTCTGCcgc.................. 24 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAa. 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTGAGTTGAGCTTCACCTGTGTGACTCACCCCACCCAGGGTAAATCACATTTTTGGTCAGTGGATAATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCAAGGACTTGGTGCTGAGCACAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTAAGCCACCAAGGCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTACA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctct...................... 29 ctct 26.00 0.00 - 3.00 - - - - 11.00 - - - - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 -
....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAa......... 29 a 16.00 0.00 - - 2.00 4.00 - 1.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctt...................... 28 ctt 9.00 0.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCA................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AAGGCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCA................................................................................ 29 1 7.00 7.00 - 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGcttt...................... 29 cttt 6.00 0.00 - 1.00 - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGC.................................................................. 29 1 5.00 5.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCt.................................................................. 29 t 5.00 0.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTA....................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCt.................................................................. 30 t 4.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaa......... 27 aa 4.00 0.00 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctca...................... 29 ctca 4.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAAaaa............................. 21 aaa 3.00 0.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTTCCTTCTGATCTTTCA................................................................................ 18 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGC.................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TCATCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGG...................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCGTT............................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaa......... 26 aa 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctct...................... 26 ctct 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAca......... 27 ca 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCc........................ 25 c 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCtgc........................... 28 tgc 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaaa......... 26 aaa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAa............................................... 25 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAa......... 27 a 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACA..................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GCCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTA....................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCa........................ 26 a 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAcc........................................ 25 cc 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAca........................................ 25 ca 2.00 0.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAcgc............................................... 25 cgc 2.00 0.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGattt...................... 27 attt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAACCGGAATCTTCTGCGGCAAActt............... 26 ctt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGGAAGAACGCAGCAAACCGGAAtt............................. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ACCGGCCAGGAAGAACGCAGCAAaga.................................... 26 aga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CTTACACGCGTTCGCGACCGGCCAgc................................................... 26 gc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAa................. 28 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAagcc................. 24 agcc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACAt..................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGatt...................... 27 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACGCCTTCCTTCTGATCTTTCATCC............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TCTGCGGCAAAGCTTTAct......... 19 ct 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAGAAa............................................ 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTCTGCGGCAAAGCTTTAcat......... 21 cat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAccta............................................... 26 ccta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCGTTa............................................................... 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAa................. 31 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTACACGCGTTCGCGACCGGCCAca................................................... 25 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCctca........................ 27 ctca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGa...................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCAAAGCTTTATTGCTTt... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAaa............... 25 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCcgt........................... 28 cgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAcctc......... 28 cctc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAgttt.. 30 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CAAACCGGAATCTTCTGCGGCAtcgc................. 26 tcgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CTGATCTTTCATCCCTCTTACACGC.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCTTCTGCGGCAAAGCTTTAagc......... 23 agc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctaa...................... 29 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAATCt........................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AAGGCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCAt................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACGCCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTA....................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCATC.............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAaa............... 28 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GCACAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTA.................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAgc............................................... 26 gc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAcg............................................... 28 cg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GCGTCATGTGTACTAAGCCA............................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAcctt......... 28 cctt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAa................................................ 24 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CAAACCGGAATCTTCTGCGGCAttcc................. 26 ttcc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaa......... 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACGCAGCAAACCGGAATCTTCTaa....................... 24 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTa.......................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TACACGCGTTCGCGACCGGCCAcgac................................................... 26 cgac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAactc......... 25 actc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CGGCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGc................................ 26 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAa................ 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGG...................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CACGCGTTCGCGACCGGCCAGGAAaa............................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGcac...................... 28 cac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AATCTTCTGCGGCAAAGCttc............. 21 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGTCAGTGGATAATTAGACGTTCAGGA......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AAGGCCTACGCCTTCCTTCTGATCTTTCAa................................................................................ 30 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGacct...................... 27 acct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATa........ 30 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaa......... 23 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCAGGGTAAATCACATTTTTGGTCAGTGGA.......................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCta.................................................................. 30 ta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGttt.............. 28 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGCAccca..................................... 25 ccca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAc......... 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAgcgt......... 27 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAa................. 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATctct............................ 23 ctct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGt...................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAaga......... 31 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CCTTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTAC...................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACCGGAATCTTCTGCGGCAAAGCTTTAa......... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCGcc.................... 26 cc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCGACCGGCCAGGAAGAACGCAcct........................................ 25 cct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CGCAGCAAACCGGAATCTTCTctct....................... 25 ctct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTA.................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGAAGAACGCAGCAAACCGGAcggc.............................. 25 cggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATCTTTCATCCCTCTTACACGC.................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCGTT............................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGCctt..................... 29 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AATCTTCTGCGGCAAAGCTTTATTGaa...... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGCTTTATTGCTTACAgccg 20 gccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAAcgc................ 27 cgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGCActta..................................... 25 ctta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATTAGACGTTCAGGACAGCGTGCA................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GACTTGGTGCTGAGCACAGAACTCAGA................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTAa....................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CTGCGGCAAAGCTTTATTGCTTAt.. 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGctt................................ 18 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GCCAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAa.............................. 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTCCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTA....................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................GCGGCAAAGCTTTATTGCTTAc.. 22 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ACGCGTTCGCGACCGGCCAGta.................................................. 22 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GCAGCAAACCGGAATCTTCTGcttt...................... 25 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAtt................. 26 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCctt........................... 23 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..........................................................................................................................................................CCTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGt................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGCACAGAACTCAGAGCGTCATGTGTACTA.................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GCGTTCGCGACCGGCCAGGAcggc................................................ 24 cggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CATCCCTCTTACACGCGTTCGCGACCGG...................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAgac........................................ 26 gac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CGCGACCGGCCAGGAAGAACGCAggg........................................ 26 ggg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCGGCCAGGAAGAACGCAGCAccgc..................................... 25 ccgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACA..................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTTCTGATCTTTCATCCCTCTTACACGCa.................................................................. 29 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GCGTTCGCGACCGGCCAGGAAccgt............................................... 25 ccgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGctta...................... 29 ctta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CAGGAAGAACGCAGCAAACCGGAtcc.............................. 26 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AACCGGAATCTTCTGCGGCAAAgtgt............... 26 gtgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGatct...................... 29 atct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CGGAATCTTCTGCGGCAAAGca.............. 22 ca 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCAAACCGGAATCTTCTGCGGCAaga................. 26 aga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGAACGCAGCAAACCGGAATCTTCTGa...................... 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CCTCTTACACGCGTTCGCGACCGGCCA................................................... 27 13 0.23 0.23 - - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -