| Gene: Ptprf | ID: uc008ujq.1_intron_1_0_chr4_117883110_r | SPECIES: mm9 |
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(11) OTHER.mut |
(2) OVARY |
(3) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(35) TESTES |
| AAGACAAAGGAGCAGTTTGGCCAGGATGGGCCCATCACGGTGCACTGCAGGTTGGGACGGCCCCCGTGGAGGGATATGGGAGGGGGGACGGTGGTCCCGAAGGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGGAGCAGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTGCTGGTGTGGGCCGCACCGGTGTGTTCATCACCCTGAGCATTGTCCTGG ......................................................................................................(((((((((..((..(((((...(((((.....))))).)))))..))))))))).)).................................................... ..............................................................................................95.................................................................162................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) |
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| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGT................................................. | 24 | 1 | 186.00 | 186.00 | 20.00 | 31.00 | 17.00 | 21.00 | 16.00 | - | 21.00 | 12.00 | 18.00 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | 5.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 23 | 1 | 81.00 | 81.00 | - | 12.00 | 10.00 | 7.00 | 6.00 | 29.00 | 1.00 | - | - | 6.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................ACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 28 | 1 | 71.00 | 71.00 | - | 13.00 | 11.00 | 11.00 | 8.00 | 4.00 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 4.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 29 | 1 | 60.00 | 60.00 | 34.00 | 7.00 | 5.00 | 2.00 | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .........................................................................................................................................CCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 25 | 1 | 47.00 | 47.00 | - | - | 12.00 | 2.00 | 8.00 | - | 1.00 | 9.00 | - | - | - | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGa................................................. | 24 | a | 45.00 | 81.00 | 15.00 | 3.00 | 2.00 | 7.00 | 4.00 | - | 9.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 24 | 1 | 21.00 | 21.00 | - | 2.00 | 5.00 | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGC.................................................... | 21 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | - | 3.00 | 8.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................AAGGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGG.................................................................................... | 29 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCA................................................... | 22 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | 2.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTat............................................... | 26 | at | 9.00 | 186.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAG..................................................... | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGA........................................................................................ | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTag............................................... | 26 | ag | 6.00 | 186.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGA...................................................... | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTGACACAGCCATTCTCTGAGC.................................................... | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGc................................................. | 24 | c | 4.00 | 81.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGG..................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTGACACAGCCATTCTCTGAG..................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGAA....................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGGA................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GAAGGGAGCAGGACatag........................................................................ | 18 | atag | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................AGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 31 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGG.................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAag................................................. | 24 | ag | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................GGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGA........................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CAAAGGAGCAGTTTGGCCAGGATGGGt..................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .................................................................................................................................GCAGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGaaa............................................... | 26 | aaa | 1.00 | 81.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GTTTGGCCAGGATGGGCCCAT................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................AAGGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGA........................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTtt............................................... | 26 | tt | 1.00 | 186.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGaat............................................... | 26 | aat | 1.00 | 81.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................AGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGGA................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................ACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAt.................................................. | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................AAGGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAG...................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................GGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGG..................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTGACACAGCCATTCTCT........................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTaa............................................... | 26 | aa | 1.00 | 186.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GGGAGCAGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 37 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAct.................................................... | 21 | ct | 1.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGa.................................................... | 21 | a | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAt.................................................. | 23 | t | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CCTGACACAGCCATTCTCTGAGCcg.................................................. | 25 | cg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .AGACAAAGGAGCAGTTTGGCCAGGATt........................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................GGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAA....................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................ACGGTGCACTGCAGGTTGGGACGGt....................................................................................................................................................... | 25 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGC.................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAG...................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAGa................................................. | 30 | a | 1.00 | 60.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................AGCAGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAG.................................................. | 34 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TGACACAGCCATTCTCTGAGCAtt................................................. | 24 | tt | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GGAAGTTGATTGTGTG......................................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| AAGACAAAGGAGCAGTTTGGCCAGGATGGGCCCATCACGGTGCACTGCAGGTTGGGACGGCCCCCGTGGAGGGATATGGGAGGGGGGACGGTGGTCCCGAAGGCCAGGGAAGTTGATTGTGTGAAGGGAGCAGGACTCCTGACACAGCCATTCTCTGAGCAGTGCTGGTGTGGGCCGCACCGGTGTGTTCATCACCCTGAGCATTGTCCTGG ......................................................................................................(((((((((..((..(((((...(((((.....))))).)))))..))))))))).)).................................................... ..............................................................................................95.................................................................162................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........CAGTTTGGCCAGGATaact......................................................................................................................................................................................... | 19 | aact | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGTCCCGAAGGCCAggag.......................................................................................................... | 18 | ggag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |