| Gene: LOC100042180 | ID: uc008uic.1_intron_1_0_chr4_116827034_r | SPECIES: mm9 |
![]() |
![]() |
|
(13) OTHER.mut |
(5) OVARY |
(10) PIWI.ip |
(5) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(57) TESTES |
| ACGAGTCCCACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTGGTGCGTTGTCTTCCTGTAAGGGGTTGATTGGCTGGGGGTGGGATGGGTGCTGCCTTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGGCAAGCATGGCGACTTGGGGGGGGGGGGTTCAAGGAGGCTTGTGACTTTCCTGGTGACAAATCAATTCATATTCTTTTCATTCAGACTCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA ....................................................................................................(((((((((...........(((....)))...((.(((((((..............)))))))))..))))))))).................................................................................................................................... ...................................................................................................100............................................................................178................................................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014237(GSM319961) 10 dpp MILI-KO total. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 52 | 1 | 3262.00 | 3262.00 | 2431.00 | - | 831.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 29 | 1 | 752.00 | 752.00 | - | 204.00 | - | 95.00 | 71.00 | 60.00 | 15.00 | 39.00 | - | 122.00 | 13.00 | 32.00 | 40.00 | 25.00 | 3.00 | 9.00 | 3.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 5.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 626.00 | 626.00 | - | 76.00 | - | 55.00 | 45.00 | 62.00 | 22.00 | 43.00 | 2.00 | 118.00 | 10.00 | 16.00 | 34.00 | 33.00 | 39.00 | 25.00 | 12.00 | - | 5.00 | 3.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 11.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 32 | 1 | 545.00 | 545.00 | - | 123.00 | - | 72.00 | 105.00 | 108.00 | 58.00 | 19.00 | 15.00 | 8.00 | 9.00 | 8.00 | 9.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 31 | 1 | 497.00 | 497.00 | - | 166.00 | - | 8.00 | 75.00 | 15.00 | 23.00 | 32.00 | 63.00 | 1.00 | 45.00 | 59.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 52 | 1 | 493.00 | 493.00 | 341.00 | - | 152.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 30 | 1 | 477.00 | 477.00 | - | 156.00 | - | 24.00 | 57.00 | 31.00 | 38.00 | 31.00 | 23.00 | 2.00 | 42.00 | 43.00 | 18.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 20 | 1 | 224.00 | 224.00 | - | 4.00 | - | 39.00 | 27.00 | 20.00 | 5.00 | 35.00 | 2.00 | 13.00 | 16.00 | 13.00 | 7.00 | 18.00 | - | - | 1.00 | 5.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 22 | 1 | 183.00 | 183.00 | - | - | - | 42.00 | 8.00 | 25.00 | - | 17.00 | 3.00 | 32.00 | 5.00 | 3.00 | 18.00 | 20.00 | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 33 | 1 | 147.00 | 147.00 | - | 47.00 | - | 3.00 | 28.00 | - | 10.00 | 18.00 | 12.00 | - | 21.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 135.00 | 135.00 | - | - | - | 25.00 | 3.00 | 15.00 | 5.00 | - | 2.00 | 30.00 | - | 4.00 | 13.00 | 10.00 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 30 | 1 | 133.00 | 133.00 | - | 51.00 | - | 11.00 | - | 6.00 | 21.00 | 10.00 | 11.00 | 6.00 | 8.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 32 | 1 | 117.00 | 117.00 | - | 55.00 | - | 2.00 | - | 3.00 | 13.00 | 7.00 | 28.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 29 | 1 | 112.00 | 112.00 | - | 33.00 | - | 15.00 | - | 8.00 | 21.00 | 2.00 | 8.00 | 8.00 | 3.00 | - | 6.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 34 | 1 | 106.00 | 106.00 | - | 30.00 | - | - | 43.00 | - | 2.00 | 13.00 | 4.00 | - | 9.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTG......................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 102.00 | 102.00 | - | 3.00 | - | 17.00 | 7.00 | 8.00 | - | - | - | 11.00 | - | 1.00 | 3.00 | 10.00 | - | - | 13.00 | - | 15.00 | 2.00 | - | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 31 | 1 | 94.00 | 94.00 | - | 41.00 | - | - | - | 2.00 | 8.00 | 8.00 | 21.00 | 1.00 | 8.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 33 | 1 | 83.00 | 83.00 | - | 23.00 | - | 14.00 | - | 15.00 | 9.00 | 3.00 | 7.00 | 2.00 | 6.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 80.00 | 80.00 | - | 9.00 | - | 5.00 | 13.00 | 2.00 | 6.00 | 4.00 | - | 6.00 | 2.00 | 5.00 | 1.00 | - | 9.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 21 | 1 | 69.00 | 69.00 | - | 12.00 | - | 6.00 | - | 1.00 | 11.00 | 4.00 | 20.00 | 1.00 | 6.00 | - | 4.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 31 | 1 | 48.00 | 48.00 | - | 11.00 | - | 9.00 | - | 7.00 | - | 2.00 | 4.00 | 1.00 | 4.00 | - | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 34 | 1 | 47.00 | 47.00 | - | 17.00 | - | - | 10.00 | - | 1.00 | 4.00 | 8.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 45.00 | 45.00 | - | - | - | 7.00 | - | 2.00 | 3.00 | - | - | 9.00 | - | - | 9.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 44.00 | 44.00 | - | 15.00 | - | 1.00 | - | - | 8.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 21 | 1 | 44.00 | 44.00 | - | 7.00 | - | 8.00 | - | 1.00 | 2.00 | 3.00 | - | 3.00 | 2.00 | 7.00 | 2.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 23 | 1 | 41.00 | 41.00 | - | - | - | 6.00 | - | 9.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | 4.00 | - | 2.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 39.00 | 39.00 | - | - | - | 8.00 | 7.00 | 1.00 | 1.00 | 13.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 38.00 | 38.00 | - | - | - | 1.00 | 10.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 32 | 1 | 37.00 | 37.00 | - | 4.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 17.00 | - | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 23 | 1 | 36.00 | 36.00 | - | - | - | 7.00 | 4.00 | 1.00 | - | 7.00 | 4.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGC.............................................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 35.00 | 35.00 | - | - | - | - | 8.00 | 4.00 | 8.00 | - | - | - | - | 8.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 30 | 1 | 34.00 | 34.00 | - | 2.00 | - | 6.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 5.00 | 3.00 | 2.00 | - | 3.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 31 | 1 | 33.00 | 33.00 | - | - | - | 6.00 | 7.00 | 8.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 33 | 1 | 32.00 | 32.00 | - | 9.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 3.00 | 3.00 | 7.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 22 | 1 | 30.00 | 30.00 | - | 6.00 | - | 5.00 | - | 1.00 | 9.00 | 1.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 32 | a | 27.00 | 48.00 | - | 3.00 | - | 11.00 | 1.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 27.00 | 27.00 | - | - | - | 3.00 | - | 3.00 | 11.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 23 | 1 | 27.00 | 27.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 5.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 31 | a | 24.00 | 34.00 | - | 3.00 | - | 11.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 23.00 | 23.00 | - | - | - | 2.00 | 8.00 | 2.00 | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 32 | 1 | 23.00 | 23.00 | - | - | - | 5.00 | - | 9.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCT............................................................................................................................................................................. | 32 | 1 | 23.00 | 23.00 | - | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 14.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 22 | 1 | 21.00 | 21.00 | - | - | - | 4.00 | - | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 6.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 24 | 1 | 19.00 | 19.00 | - | - | - | 3.00 | - | 3.00 | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 24 | 1 | 18.00 | 18.00 | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 24 | 1 | 18.00 | 18.00 | - | - | - | - | 5.00 | 2.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGT........................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | 6.00 | - | 1.00 | - | - | 5.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 23 | a | 17.00 | 21.00 | - | - | - | 3.00 | - | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 33 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 4.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | 5.00 | - | - | - | 1.00 | 7.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCC...................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCA..................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................AACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 18 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 25 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 34 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | 6.00 | 5.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 34 | 1 | 14.00 | 14.00 | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 29 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTG......................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 12.00 | 12.00 | - | - | - | 0.50 | - | 3.00 | 0.50 | - | - | 2.00 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACT.......................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCA..................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTC....................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGC.............................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 19 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 34 | a | 9.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 35 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 33 | a | 9.00 | 37.00 | - | - | - | 4.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 25 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTa....................................................................................................................................................................................... | 22 | a | 8.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGt......................................................................................................................................... | 32 | t | 8.00 | 497.00 | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTAC........................................................................................................................................................................... | 34 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | 6.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 28 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGT................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGT................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 35 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTa.................................................................................................................................................... | 29 | a | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | 5.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAAt......................................................................................................................................................... | 23 | t | 7.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAAC................ | 29 | 15 | 6.60 | 6.60 | - | - | - | 0.27 | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 0.20 | - | 0.20 | - | 0.53 | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 0.07 | 0.07 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 1.13 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTG............................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCT............................................................................................................................................................................. | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 35 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGG...................................................................................................................................... | 32 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTaaa..................................................................................................................................................................................... | 24 | aaa | 5.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................AGTTCTGCTACTGAAGGA.................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 25 | a | 5.00 | 19.00 | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 35 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGC............................................................................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAAt......................................................................................................................................................... | 24 | t | 5.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTA............................................................................................................................................................................ | 33 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 30 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTaa...................................................................................................................................................................................... | 23 | aa | 4.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAA.......................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAAta........................................................................................................................................................ | 25 | ta | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 36 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGT........................................................................................................................................................................................ | 20 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................AACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAAta........................................................................................................................................................ | 24 | ta | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATAC........................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 39 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGAT............................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................GATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTAC........................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................AACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 35 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTAC........................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CTTCTTGTGATGAAAATACTG......................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 36 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 31 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATG............................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGA.................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 27 | a | 3.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTG............................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCT............................................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTT.................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 15 | 2.87 | 2.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.07 | - | - | 0.20 | 0.20 | 0.13 | - | - | - | 0.73 | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | 0.13 | 0.33 | 0.27 | 0.07 | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATA............................................................................................................................................................................................ | 17 | 3 | 2.33 | 2.33 | - | - | - | 1.67 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................ACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 19 | a | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 37 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 24 | a | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................GAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 34 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGGCAAGCATG.............................................................................................................................. | 32 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGG..................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 32 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTCTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 22 | a | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGa........................................................................................................................................................................................ | 20 | a | 2.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGcag.......................................................................................................................................... | 28 | cag | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 16 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 35 | a | 2.00 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................TGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 37 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACT.......................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAa.................................................................................................................................................. | 30 | a | 2.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTT.................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGATG............................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCtgg......... | 29 | tgg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAgg....................................................................................................................................... | 23 | gg | 2.00 | 69.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................ACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTgtag.................................................................................................................................................. | 17 | gtag | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGG..................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AAATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCaa..................................................................................................................................................................................... | 24 | aa | 2.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 36 | a | 2.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAA.......................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTG................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTa................................................................................................................................................................................. | 28 | a | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................ACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GAACACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGC............................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATG............................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGT................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................ACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 20 | a | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCa...................................................................................................................................................................................... | 22 | a | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAg........................................................................................................................................ | 31 | g | 2.00 | 133.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTa....................................................................................................................................................................................... | 21 | a | 1.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAG............................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................ACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 17 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................CTTGTGATGAAAATACTGT........................................................................................................................................................................................ | 19 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 16 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAA................. | 28 | 19 | 1.16 | 1.16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | 0.05 | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | 0.68 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.16 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAaa................................................................................................................................................. | 32 | aa | 1.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAcg.......................................................................................................................................... | 29 | cg | 1.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTctg.............................................................................................................................................. | 26 | ctg | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGa..................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................TCAGACTCCTGAGGAGGA.................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAtaa........................................................................................................................................ | 29 | taa | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTtcag.......................................................................................................................................... | 31 | tcag | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGc........................................................................................................................................................................................ | 21 | c | 1.00 | 102.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACa...................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 29 | a | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGGCAAGa................................................................................................................................. | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTGc.................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TTGTGATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTaag..................................................................................................................................................................................... | 24 | aag | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGa................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 135.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTCCCACTATGCACTGCCCCTGta......................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGg......................................................................................................................................... | 31 | g | 1.00 | 477.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................GTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAcca........................................................................................................................................................ | 23 | cca | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCT................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGA................................................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGa................................................................................................................................................. | 23 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAa....................................................................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACAa....................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 39.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAtg.......................................................................................................................................... | 28 | tg | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGa...................................................................................................................................... | 24 | a | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAc....................................................................................................................................... | 26 | c | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................ACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTcaag.......................................................................................................................................... | 29 | caag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................GTTCTGCTACTGAAGGAATGAG............................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAgg.......................................................................................................................................... | 32 | gg | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGGGt.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTGaa................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAA.......................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACgctt..................................................................................................................................................... | 22 | gctt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 38 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CTGCCCCTGGGCCGCAAGcagg.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | cagg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTgaaa.................................................................................................................................................................................... | 25 | gaaa | 1.00 | 17.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAG.................................................................................................................................................. | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................GTTCTGCTACTGAAGGAATG................................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAt.......................................................................................................................................... | 20 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAcg.......................................................................................................................................... | 28 | cg | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGT................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGG...................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACTGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGA................................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGAT............................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCaa............................................................................................................................................................................ | 33 | aa | 1.00 | 35.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CTTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................CTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAAa......................................................................................................................................................... | 19 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGA................................................................................................................................................................ | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATG................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTTAGc................................................................................................................................................. | 23 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTac.............................................................................................................................................................................. | 31 | ac | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGA.............................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGC............................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTt............................................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTaaa.................................................................................................................................................. | 30 | aaa | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAtg.......................................................................................................................................... | 29 | tg | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGt......................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 626.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................GATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTA............................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAt......................... | 24 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAGATGAAtac....................................................................................................................................................... | 23 | tac | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGAAa.......................................................................................................................................... | 22 | a | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................GAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAA.......................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTCTGCTACTGAAGGAATGAGATG............................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGG...................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 36 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................AGATGAACACTTTAGTGCTGAA........................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAcg.......................................................................................................................................... | 20 | cg | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTAC........................................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 10 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | 0.20 | - | - | 0.10 | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTA............................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAaa...................................................................................................................................... | 33 | aa | 1.00 | 48.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTtaag.......................................................................................................................................... | 31 | taag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGgag.......................................................................................................................................... | 22 | gag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AAGGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGaaaa..................................................................................................................................................................................... | 24 | aaaa | 1.00 | 102.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GAACACTTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAcaa........................................................................................................................................ | 30 | caa | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................ACACTTTAGTGCTGAAGAAGG...................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGAT............................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATG................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGC.............................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAA....................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAc.......................................................................................................................................... | 32 | c | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCcgct............................................................................................................................................................................. | 29 | cgct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................AGTTCTGCTACTGAAGGAATGA................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................AGTGCTGAAGAAGGCAAGCATGG............................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCC...................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................TGATGAAAATACTGTCCAGTT.................................................................................................................................................................................. | 21 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTG............................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTA................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTC....................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAt.......................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTaaaa.................................................................................................................................................................................... | 25 | aaaa | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................AATACTGTCCAGTTCTGCTA............................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTT..................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TACTGTCCAGTTCTGCTACT.......................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTC................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CTTCTTGTGATGAAAATAC........................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACACTTT.................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACT...................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ACTGAAGGAATGAGATGAA.......................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATGAGATGtaca........................................................................................................................................................ | 25 | taca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTtaag.......................................................................................................................................... | 28 | taag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................AACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAG.................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................CCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGGa..................................................................................................................................... | 31 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CTGCTACTGAAGGAATGAGATGAAt......................................................................................................................................................... | 25 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAACACTTTAG.................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTaaga.................................................................................................................................................................................... | 25 | aaga | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................AGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................TGTCCAGTTCTGCTACTGA........................................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAAta........................................................................................................................................................ | 27 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAaaag....................................................................................................................................... | 31 | aaag | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAt....................................................................................................................................... | 32 | t | 1.00 | 48.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTGacta............................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | acta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGAAGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGA............................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGcaa....................................................................................................................................... | 32 | caa | 1.00 | 752.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCT................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCt........... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GTGATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GCTACTGAAGGAATGAG............................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTG............................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGa.............................................................................................................................................................................. | 30 | a | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTa.................................................................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................TTGGCTGGGGGTGGGATGG..................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCca.................................................................................................................................................................................... | 25 | ca | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAA....................................................................................................................................................................... | 38 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTCTGCTACTGAAGGAATGA................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGactc................................................................................................................................... | 27 | actc | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 11 | 0.91 | 0.91 | - | 0.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.36 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 15 | 6 | 0.83 | 0.83 | - | - | - | 0.17 | - | 0.33 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA | 28 | 15 | 0.80 | 0.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.47 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 16 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | 0.06 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | 0.19 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGA....... | 28 | 16 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | 0.19 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATA............................................................................................................................................................................................ | 16 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAACA........................................................................................................................................................ | 16 | 9 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAAT............................................................................................................................................................................................. | 16 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 11 | 0.64 | 0.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTC. | 28 | 15 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | 0.07 | 0.33 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTaa...................................................................................................................................................................................... | 22 | aa | 0.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATGAACACTTTAGTGC............................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................GATGAAAATACTGTCCAG.................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TTTAGTGCTGAAGAAG....................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATACcg......................................................................................................................................................................................... | 20 | cg | 0.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................CATATTCTTTTCATTCAG.................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATACTGTaga..................................................................................................................................................................................... | 23 | aga | 0.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................GGAATGAGATGAACAC....................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACG............... | 30 | 15 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAAC................ | 27 | 15 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................AGTTCTGCTACTGAAG...................................................................................................................................................................... | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAATAgtg......................................................................................................................................................................................... | 20 | gtg | 0.33 | 2.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................ACTTTAGTGCTGAAG.......................................................................................................................................... | 15 | 9 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.22 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTC. | 29 | 15 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGCTACTGAAGGAATG................................................................................................................................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAAT............................................................................................................................................................................................. | 15 | 15 | 0.27 | 0.27 | - | - | - | 0.07 | - | 0.13 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTCTTGTGATGAAAA.............................................................................................................................................................................................. | 15 | 19 | 0.26 | 0.26 | - | - | - | 0.16 | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCTTGTGATGAAAATAC........................................................................................................................................................................................... | 17 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CTGGGCCGCAAGAAGGGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 16 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 17 | 0.24 | 0.24 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................ACTTTAGTGCTGAAGA......................................................................................................................................... | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGATGA........................................................................................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGAT............. | 32 | 15 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 30 | t | 0.20 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 29 | t | 0.18 | 0.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................TGTGATGAAAATACTG......................................................................................................................................................................................... | 16 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCCACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCA.................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAA.................... | 28 | 19 | 0.16 | 0.16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCC......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGA.............. | 31 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACG............... | 27 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAAC................ | 28 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAAC................ | 26 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAA...... | 29 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATT.. | 29 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGt....... | 29 | t | 0.12 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACAAAAAACGATCAAAGA....... | 21 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACAAAAAACGATCAAAG........ | 19 | 16 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTCCCACTATGCACTGCCCCTGGGCCG...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TACTGAAGGAATGAG............................................................................................................................................................... | 15 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACA...................... | 26 | 19 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCTGCTACTGAAGGA.................................................................................................................................................................... | 15 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TTTAGTGCTGAAGAA........................................................................................................................................ | 15 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................AGGAATGAGATGAAC......................................................................................................................................................... | 15 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTCCCACTATGCACTGCCCCTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGCCGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ATGCACTGCCCCTGGGCCGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ATGCACTGCCCCTGGGCCGCA.................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACt............... | 30 | t | 0.07 | 6.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CCCCTGGGCCGCAAGAAGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................AACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA | 26 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTta.................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | ta | 0.07 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTG................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTC. | 27 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | t | 0.07 | 2.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............CACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................CCCTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGA.............. | 28 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA | 29 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACG............... | 28 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAAAAACGATCAAAGAAAAT... | 21 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAA.... | 29 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGA....... | 30 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATT.. | 27 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGct............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | ct | 0.06 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAAT... | 29 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAG........ | 27 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGA....... | 26 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAA.... | 31 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................GGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCA........... | 28 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGA....... | 29 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATT.. | 30 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAAT... | 26 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAA..... | 29 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAG........ | 28 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAA.......... | 26 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............CACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAA..... | 26 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAA...... | 30 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCTGGGCCGCAAGAAGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................CTGAAGGAATGAGAT............................................................................................................................................................. | 15 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTTTAAACAAAAAAC................ | 17 | 18 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAA................. | 29 | 18 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAA.................. | 30 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAA................... | 29 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TATGCACTGCCCCTGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAA................... | 27 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAA................... | 28 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ACGAGTCCCACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGGGCCAAGCTGGTGCGTTGTCTTCCTGTAAGGGGTTGATTGGCTGGGGGTGGGATGGGTGCTGCCTTCTTGTGATGAAAATACTGTCCAGTTCTGCTACTGAAGGAATGAGATGAACACTTTAGTGCTGAAGAAGGCAAGCATGGCGACTTGGGGGGGGGGGGTTCAAGGAGGCTTGTGACTTTCCTGGTGACAAATCAATTCATATTCTTTTCATTCAGACTCCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA ....................................................................................................(((((((((...........(((....)))...((.(((((((..............)))))))))..))))))))).................................................................................................................................... ...................................................................................................100............................................................................178................................................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014237(GSM319961) 10 dpp MILI-KO total. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......CACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCAAc................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | c | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................ACTTTCCTGGTGACAAATCAATTCATA................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA | 27 | 15 | 0.13 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCCACTATGCACTGCCCCTGGGCCGCAA................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACAAAAAACGATCAAAGAAAATTCA | 28 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTTAAACAAAAAACGATCAAAGAAAA.... | 28 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAGATTTTAAACAAAAAACGATCAAA......... | 29 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAAACAAAAAACGATCAAA......... | 21 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAACAAAAAACGATCAA.......... | 19 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGAGGAGGAAGAGATTTTAAACAAA.................... | 27 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |