| Gene: Uqcrh | ID: uc008ufw.1_intron_1_0_chr4_115742525_r.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(10) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(38) TESTES |
| GCTAATTTAATTTTCTTTCCCTTTTGTAGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGTAAGAGCGGCCTCCAGTTTGGAACTACCTTACTAGAATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCCAGGGTATTTTAAGGAATCTGTGACAACTTGGGGAAAATGCTGGGACAAGCCTTTAATACCTCCTGTGCAGTAGTAGGTTGTGTGGGAGTGTGAGCCTTAGAAAGCTATGTCTTTTTAGGTCTGGGGCTTCTTTG ...........................................................................................(((((((...(((((((....(((((((........((....)).......)))))))..)))))..))...)))))))..(((((((..(((((.......)))))..)))).))).......................................... .................................................................................82.............................................................................................................................209....................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttat............................................. | 17 | ttat | 96.00 | 0.00 | 46.00 | 34.00 | - | - | - | - | 10.00 | - | - | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGtta.............................................. | 16 | tta | 64.00 | 0.00 | 26.00 | 24.00 | - | - | - | - | 10.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtta.............................................. | 18 | tta | 51.67 | 23.00 | 3.33 | 4.33 | 5.33 | 16.67 | 9.00 | 6.33 | 1.00 | 4.00 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttat............................................. | 18 | ttat | 43.00 | 0.00 | 10.00 | 8.00 | - | - | 18.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGtttt............................................. | 17 | tttt | 29.00 | 0.00 | 14.00 | 13.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtta.............................................. | 17 | tta | 27.00 | 0.00 | 16.00 | 6.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttat............................................. | 20 | ttat | 26.50 | 21.50 | 5.00 | 11.00 | - | 3.50 | 2.00 | - | 0.50 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGG................................................. | 15 | 3 | 23.00 | 23.00 | 4.00 | 4.33 | 0.33 | 4.33 | - | 0.33 | 1.00 | - | 0.33 | - | 6.67 | 0.33 | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttaa............................................. | 17 | ttaa | 22.00 | 0.00 | 10.00 | 8.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGG................................................. | 16 | 2 | 21.50 | 21.50 | 4.50 | 7.00 | - | 8.00 | - | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttat............................................. | 19 | ttat | 20.00 | 23.00 | 3.33 | 2.33 | 1.00 | 5.67 | 2.33 | 1.67 | 1.00 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttaa............................................. | 19 | ttaa | 15.33 | 23.00 | 1.67 | 1.00 | 1.67 | 1.67 | 3.33 | 4.00 | 0.33 | 0.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtttt............................................. | 20 | tttt | 14.50 | 21.50 | 3.00 | 6.50 | - | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtttt............................................. | 18 | tttt | 12.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 4.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGt................................................ | 21 | t | 11.00 | 4.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTatgg................................................. | 20 | atgg | 11.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | 1.00 | - | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtaa.............................................. | 19 | taa | 10.50 | 21.50 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttta............................................. | 18 | ttta | 10.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtaa.............................................. | 18 | taa | 9.33 | 23.00 | 0.67 | 1.33 | 0.33 | 3.33 | 2.00 | 0.33 | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGta............................................... | 18 | ta | 8.00 | 21.50 | 2.00 | - | - | 4.00 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGtta.............................................. | 23 | tta | 8.00 | 4.00 | - | - | 4.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTatag................................................. | 20 | atag | 6.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttag............................................. | 17 | ttag | 6.00 | 0.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttta............................................. | 17 | ttta | 6.00 | 0.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttag............................................. | 18 | ttag | 6.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................GGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGacc.................................................................................................................................................................................................... | 26 | acc | 5.00 | 0.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGta............................................... | 17 | ta | 4.67 | 23.00 | - | 0.67 | - | 2.00 | - | 1.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtat.............................................. | 18 | tat | 4.67 | 23.00 | 0.33 | - | - | 3.00 | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGttaa............................................. | 24 | ttaa | 4.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................AATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAAC......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGtaa.............................................. | 23 | taa | 4.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGG................................................. | 20 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGac..................................................................................................................................................................................................... | 26 | ac | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGa...................................................................................................................................................................................................... | 25 | a | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TACTAGAATTGGAAGGCTGAGCTGTA................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttta............................................. | 19 | ttta | 3.67 | 23.00 | 0.67 | 0.67 | 0.33 | - | 0.67 | 0.33 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttta............................................. | 20 | ttta | 3.00 | 21.50 | - | - | 2.00 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTata.................................................. | 19 | ata | 3.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGaccc................................................................................................................................................................................................... | 27 | accc | 3.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttac............................................. | 17 | ttac | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtaa.............................................. | 17 | taa | 3.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttg.............................................. | 17 | ttg | 3.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttag............................................. | 19 | ttag | 2.33 | 23.00 | 0.33 | 0.33 | - | - | 1.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGtttt.............................................. | 18 | tttt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................GAATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAA........................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttg.............................................. | 18 | ttg | 2.00 | 23.00 | 0.67 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTagtt............................................... | 22 | agtt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGttta.............................................. | 18 | ttta | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................AGCTGTATTGAAACTCCAGGGaccc.............................................................................................................................. | 25 | accc | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................AGTAGTAGGTTGTGTGGtt............................................... | 19 | tt | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................GAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCC...................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGT...................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGaaa............................................... | 16 | aaa | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGttt.............................................. | 23 | ttt | 2.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtat.............................................. | 19 | tat | 2.00 | 21.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtaat............................................. | 18 | taat | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................GAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCCAG.................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtat.............................................. | 17 | tat | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................AAGAACTAGTGGTAAGAGCGGCCTCCA........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGtatt............................................. | 17 | tatt | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTagtt............................................... | 18 | agtt | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTG.................................................. | 15 | 5 | 1.60 | 1.60 | 0.20 | 0.60 | 0.20 | - | - | - | 0.20 | - | - | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtag.............................................. | 19 | tag | 1.50 | 21.50 | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttag............................................. | 20 | ttag | 1.50 | 21.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtaaa............................................. | 19 | taaa | 1.33 | 23.00 | - | - | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGa................................................ | 16 | a | 1.33 | 23.00 | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................AGCTGTATTGAAACTCCAGGGac................................................................................................................................ | 23 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGa...................................................................................................................................................................................................... | 24 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTGGAACTACCTTACTAGAATTGGAAG........................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttac............................................. | 18 | ttac | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGGCTGAGCTGTATTGAAACTCC...................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................AATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCttt.................................................................................................................................... | 32 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTat................................................... | 18 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................GAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCCAGG................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttga............................................. | 19 | ttga | 1.00 | 23.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................AAGAAGAGGAAGAACTAGTGG....................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................GAAGAGGAAGAACTAGTGGacc.................................................................................................................................................................................................... | 22 | acc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................GAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCCA..................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................GAATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAAC......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGttta............................................. | 24 | ttta | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TACTAGAATTGGAAGGCTGAGCTGT................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGaa..................................................................................................................................................................................................... | 26 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGttat............................................. | 24 | ttat | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................AGTAGTAGGTTGTGTGGGAt.............................................. | 20 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCC...................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGtaaa............................................. | 17 | taaa | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTagt................................................ | 16 | agt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGtaga............................................. | 17 | taga | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGTAA.................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGtcca............................................. | 18 | tcca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................GAGGAAGAACTAGTGGacc.................................................................................................................................................................................................... | 19 | acc | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGaccc................................................................................................................................................................................................... | 28 | accc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGa................................................. | 20 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGacca................................................................................................................................................................................................... | 27 | acca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTGTGGta............................................... | 22 | ta | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGat............................................... | 18 | at | 1.00 | 21.50 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................AAGCTATGTCTTTTTAat............... | 18 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttga............................................. | 20 | ttga | 1.00 | 21.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGaa............................................... | 17 | aa | 1.00 | 23.00 | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................GAAGAGGAAGAACTAGTGGTAAGAGCGG.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttga............................................. | 17 | ttga | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGttaa.............................................. | 18 | ttaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TGAGCTGTATTGAAACTCCAGGGaccc.............................................................................................................................. | 27 | accc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTagtt............................................... | 17 | agtt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtag.............................................. | 18 | tag | 1.00 | 23.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGttg.............................................. | 16 | ttg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGaa............................................... | 18 | aa | 1.00 | 21.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGaca.................................................................................................................................................................................................... | 26 | aca | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................GTAGGTTGTGTGGaag.............................................. | 16 | aag | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................AGTAGTAGGTTGTGTGGttt.............................................. | 20 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtaaa............................................. | 20 | taaa | 1.00 | 21.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................AATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAA.......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGCAGTAGTAGGTTGTaaa.................................................. | 19 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................GAGCTGTATTGAAACTCCAG.................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................GAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGaccc................................................................................................................................................................................................... | 26 | accc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttgt............................................. | 20 | ttgt | 1.00 | 21.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................ATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAACT........................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................AGTAGGTTGTGTGGttgt............................................. | 18 | ttgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTGGAACTACCTTACTAGAATTGGAAGGC......................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TACTAGAATTGGAAGGCTGAGCTGTAT............................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................GGAAGAACTAGTGGacc.................................................................................................................................................................................................... | 17 | acc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................GAGGAAGAACTAGTGGTAAGAGCGG.............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGttt............................................... | 18 | ttt | 0.80 | 1.60 | - | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGtttt.............................................. | 19 | tttt | 0.80 | 1.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGtac.............................................. | 18 | tac | 0.67 | 23.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGcta.............................................. | 19 | cta | 0.50 | 21.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtac.............................................. | 19 | tac | 0.50 | 21.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtatt............................................. | 20 | tatt | 0.50 | 21.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttg.............................................. | 19 | ttg | 0.50 | 21.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtagt............................................. | 20 | tagt | 0.50 | 21.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttct............................................. | 20 | ttct | 0.50 | 21.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtc............................................... | 18 | tc | 0.50 | 21.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGttc.............................................. | 19 | ttc | 0.50 | 21.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGGtgaa............................................. | 20 | tgaa | 0.50 | 21.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TAGTAGGTTGTGTGGttac............................................. | 19 | ttac | 0.33 | 23.00 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGttaa.............................................. | 19 | ttaa | 0.20 | 1.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGttta.............................................. | 19 | ttta | 0.20 | 1.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTGTGTGatt............................................... | 18 | att | 0.20 | 1.60 | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GCTAATTTAATTTTCTTTCCCTTTTGTAGGAAGAAGAGGAAGAACTAGTGGTAAGAGCGGCCTCCAGTTTGGAACTACCTTACTAGAATTGGAAGGCTGAGCTGTATTGAAACTCCAGGGTATTTTAAGGAATCTGTGACAACTTGGGGAAAATGCTGGGACAAGCCTTTAATACCTCCTGTGCAGTAGTAGGTTGTGTGGGAGTGTGAGCCTTAGAAAGCTATGTCTTTTTAGGTCTGGGGCTTCTTTG ...........................................................................................(((((((...(((((((....(((((((........((....)).......)))))))..)))))..))...)))))))..(((((((..(((((.......)))))..)))).))).......................................... .................................................................................82.............................................................................................................................209....................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) |
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