(1)
OTHER.ip
(5)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
GGTCCCGAGGAGTCAAGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGATTTTCCCGGTGGGTCTCACGTCGAGCTCTGATTGGATAAGCCCTTTCCAGGCCTCCTAGTGCTGGGGCCAAGGCCTTGCTCGTGGAAGGGTTGGGATTCTCTGACACACAACACTGGTTTCTGAAGCAGCTTCTGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTTGTTGTGGGCCTTAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAGTG
...........................................................................................................................(((..((((........))))..)))......((((.(((((..(((((....))..)))..))))).)))).......................................................
.......................................................................................................................120.............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
...............................................................................................................................................................................TGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGG................................................. 26 1 17.00 17.00 7.00 4.00 - 1.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGGTTTCTGAAGCAGCTTCTG......................................................................... 21 1 7.00 7.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTG.......... 26 1 6.00 6.00 - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................................................................................................................ATTCTCTGACACACAACACTGGTTTCTG..................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGT................................................ 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAGT. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGGTTTCTGAAGCAGCTTCTGTATTGCGCC................................................................ 30 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACACAACACTGGTTTCTGAAGCAGCT............................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGC......... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTT............................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGA... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGATT.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTT............................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AGCGTAGGCAGGCTGATTTTCCCGaa...................................................................................................................................................................................................... 26 aa 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAGTG 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGAAGGGTTGGGATTCTCTGACA...................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CAGCGTAGGCAGGCTGATTTT............................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGGAGATGGTTGTTGTGGGCCTTAGA................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGA.................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GGAAGGGTTGGGATTCTCTGACACAC................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGA................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CGGGGTCTGGAGATGGTT............................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTTGT............................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGTGGGCCTTAGAGTAATTCTTAG..................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAATTCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAG.. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGAT................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GGGGTCTGGAGATGGTTGTTGTGGGCCT.................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTAGAGTAATTCTTAGGATTGGagc............ 25 agc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGTTGTTGTGGGCCTTAGAGTAATT.......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................TAGGCAGGCTGATTTTCCC......................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGGTTTCTGAAGCAGCTTCTGTATTGC................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGA................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................GAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGA................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AACACTGGTTTCTGAAGCAGCT............................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGG.... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCCAAGGCCTTGCTCGTGGAAGGGct.................................................................................................................... 26 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TGAAGCAGCTTCTGTATTGCGCCGGG............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GGAAGGGTTGGGATTCTCTGACACACA.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGTCAAGAGACCAAcagc.............................................................................................................................................................................................................................. 18 cagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTa............................................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAAGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGt................................................. 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGA... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGAGTAATTCTTAGGATTGGGG............. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................................................................................TTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTTG.............................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGGCCAAGGCCTTGCTCGTGGAAGGGTTGG.................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGACACACAACACTGGTTTCTGAAGCA................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...............................................................................................................................................................................TGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGAT................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGC......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGCGTAGGCAGGCTGATTT............................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCT........... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CCAAACAGCGTAGGCAGGC................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGg......... 27 g 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGa................................................ 25 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGATT.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGAT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..TCCCGAGGAGTCAAGAGACCAAACAGCGT........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGGATTCTCTGACAtaca.................................................................................................. 18 taca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCTTAGGATTGGGGCTGCC........ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGC............ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGCCGC...... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAG.. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGT................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTTGTa............................................ 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGATT.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGACACACAACACTGGTTTCTGAAGCAGC.............................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGTCCCGAGGAGTCAAGAGACCAAACAGCGTAGGCAGGCTGATTTTCCCGGTGGGTCTCACGTCGAGCTCTGATTGGATAAGCCCTTTCCAGGCCTCCTAGTGCTGGGGCCAAGGCCTTGCTCGTGGAAGGGTTGGGATTCTCTGACACACAACACTGGTTTCTGAAGCAGCTTCTGTATTGCGCCGGGGTCTGGAGATGGTTGTTGTGGGCCTTAGAGTAATTCTTAGGATTGGGGCTGCCGCGGAGTG
...........................................................................................................................(((..((((........))))..)))......((((.(((((..(((((....))..)))..))))).)))).......................................................
.......................................................................................................................120.............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.............................................................................................................................GGAAGGGTTGGGATTCTCTGACACACAA................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -