| Gene: BC042782 | ID: uc008tsr.1_intron_3_0_chr4_94820327_f.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(6) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(4) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(24) TESTES |
| GTGTGTGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCACTTCTTGAGAACCCTGCCTCATGTTCACAACAGACACACTTTCTGTTATGCTTCGCCCCTATCCTGGCAGTTTTATAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAGAGTCCCTCCCTTCTTGGTCCGTTGGACCA ...........................................................................................................................................(((((...(((..(((........))))))...)))))...........((((....)))).................................................. ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACA................................................... | 26 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | - | - | 8.00 | - | - | - | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGG................................................. | 28 | 1 | 12.00 | 12.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGC............................... | 27 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGA................................. | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCA.............................. | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 1.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAGt............................ | 30 | t | 6.00 | 2.00 | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGA................................................ | 29 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGA................................. | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGA.............................................. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGC............................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATA............................................ | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAG................................ | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCC..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TGTTATGCTTCGCCCCTATCCTGGCAGT................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCT.................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAGC............................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCA.............................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTC...................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAG................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TTGCCCTGTAATAAGTGGGTCACAGAGGC.............................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAATAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTT........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGA................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAGAGTC......................... | 31 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAG................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAG............................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTA....................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................AGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGG................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAGA............................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGG.................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................CAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCACTT..................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................TGCCCTGTAATAAGTGGGTCACAGAGGC.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTC.................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................AACTGTTCTGACAGGAGATACTCTACA..................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............GCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGa.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................TAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTA....................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATAC........................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCactg................................................................................................................................................................................................................... | 28 | actg | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TACAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCAC....................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGA.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCT........................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTAC...................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTTGCCAGTGACGCGTGCCata........................................................................................................................................................................................................................... | 22 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTAACTGTTCTGACAGGAGATAC........................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCA.............................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................TATAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACc................................................... | 28 | c | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................TAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTAC...................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGAT............................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................ACAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCAC....................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAG................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTC......................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAG............................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGT.................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATACT.......................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TTCTCATACAGTAACCAGGAAATACTAAG............................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TCTGACAGGAGATACTCTACAGGG.................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGC....................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................TTGTAACTGTTCTGACAGGAGATA............................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCC...................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TACAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCACTT..................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................GACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGA.............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GCCCCTATCCTGGCAGTTTTAT............................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TGCCTCATGTTCACAACAGACACACTTT.............................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGCCAGTGACGCGTGCCCTATTtccc..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tccc | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAG............................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGAC.................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGTAATAAGTGGGTCACAGAGGCTatt.......................................................................................................................................................................................... | 27 | att | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TGGCAGTTTTATAGATGACCTTGTAACT............................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGACCTTGTAACTGTTCTGACAGG................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGC............................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................AGATACTCTACAGGGAGCAGAGTCCCTC..................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGA................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGG................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGc................................................ | 29 | c | 1.00 | 12.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................CAGAGTCCCTCCCTTCTTGGTCCGTT...... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAATAAGTGGGTCACAGAGGCTTCT.......................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GTGTGTGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAATACTAAGTTCACTTCTTGAGAACCCTGCCTCATGTTCACAACAGACACACTTTCTGTTATGCTTCGCCCCTATCCTGGCAGTTTTATAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTACAGGGAGCAGAGTCCCTCCCTTCTTGGTCCGTTGGACCA ...........................................................................................................................................(((((...(((..(((........))))))...)))))...........((((....)))).................................................. ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................GCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAA.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 10.00 | 10.00 | 2.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................GTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAA................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ..........................................................GCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAA................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCCTA........................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| .....................................................CAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TTCTCATACAGTAACCAGGAAATACTA.............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................AACAGACACACTTTCTGTTATGCTTCGC................................................................................................ | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGTGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCCTA........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................ACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCCTA........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................CCCTATCCTGGCAGTTTTATAGATGACCTa................................................................... | 30 | a | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................AGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................AGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................GACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATA.............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................GACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATAA............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................AGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAG....................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................AGAGTCCCTCCCTTCTTGGTCCGTTGGA... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAA................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............AGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAA................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................AGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TATCCTGGCAGTTTTATAGATGACCTTGTA............................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................AATAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTC...................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGAGA.............................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CGTGCCCTATTGCCCTGTAATAAGTGG......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GCCCCTATCCTGGCAGTTTTATAGATGAC..................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGA................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................AAGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCA................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................TAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTA....................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................CCTCATGTTCACAACAGACACACTT............................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................GTGCCCTATTGCCCTGTAATAAGTGGGTC...................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................GGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GCCCCTATCCTGGCAGTTTTATAGATG....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATA.............................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GTTCACAACAGACACACTTTCTGTTAct........................................................................................................ | 28 | ct | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................GGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAA.................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TAAGTGGGTCACAGAGGCTTCTT......................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................GGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TGCCTCATGTTCACAACAGACACACTT............................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................ACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATAt.............................................................................................................................................................................................................. | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAA.................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................TCTCATACAGTAACCAGGAAATACTA.............................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................GAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................CAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................AACCCTGCCTCATGTTCACAACAGA...................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ............................................AGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCA................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTGTTATGCTTCGCCCCTATCCTGGCA................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TCATACAGTAACCAGGAAATACTA.............................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TTTCTCATACAGTAACCAGGAAATACTA.............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATGTTCACAACAGACACACTTTCTGTTA........................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................CTTGAGAACCCTGCCTCATGTTCACAAC......................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................TGTTCACAACAGACACACTTTCTGTTAa........................................................................................................ | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TCTCATACAGTAACCAGGAAATACTAc.............................................................................................................................................................. | 27 | c | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAATA................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................CTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAaa.................................................................................................................................................................... | 29 | aa | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................TTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAA.................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................AGTGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCATA................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................CACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTA............................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................CGCGTGCCCTATTGCCCTGTAAccac................................................................................................................................................................................................................ | 26 | ccac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GTCACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTA............................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................ATAGATGACCTTGTAACTGTTCTGACAGGA................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................CACAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACC......................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTAACTGTTCTGACAGGAGATACTCTACA..................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TGTTCACAACAGACACACTTTCTGTTA........................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................CACTTCTTGAGAACCCTGCCTCATGT................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TCTTGAGAACCCTGCCTCATGTTCACAAC......................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................GCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............GCCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTG................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................ATGCTTCGCCCCTATCCTGGCAGTTTTA............................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................CTGTTCTGACAGGAGATACTCTAat....................................... | 25 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............AGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTA................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................CCCTGCCTCATGTTCACAACAGA...................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ....................................................CAGAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCa......................................................................................................................................................................... | 29 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................CACTTCTTGAGAACCCTGCCTCATGTc................................................................................................................................ | 27 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CGCGTGCCCTATTGCCCTGTAA................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................CACACTTTCTGTTATGCTTCGCcctc................................................................................................ | 26 | cctc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................AACCCTGCCTCATGTTCACAACAGACA.................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ....................................................................................................TCTTGAGAACCCTGCCTCATGTTCA............................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GCGTGCCCTATTGCCCTGTAA................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATA.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................CTCATACAGTAACCAGGAAATACTAt.............................................................................................................................................................. | 26 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................GAGTCCCTCCCTTCTTGGTCCGTTGGA... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGGGTCACAGAGGCTTCTTTTCTCATA................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................CTTCTTTTCTCATACAGTAACCAGGAAATa.................................................................................................................................................................. | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................ACGCGTGCCCTATTGCCCTGTAATA.............................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................GAGGCTTCTTTTCTCATACAGTAACCA........................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............CCAGTGACGCGTGCCCTATTGCCCTGt................................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TGCCTCATGTTCACAACAGACACAC................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GTGTGTCTTTGCCAGTGACGCGTGCCC............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |