chr4:86502714 86503274 -
(10)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(41)
TESTES

Sense strand
GGCCTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCGTCCCCGGCCAGGGCCGAGTGAGGCCGCCCGAGCCCGAGCGTGCGGCACGGCCTCGGTCCCAGGCTCGCATAAGTCCCGCACTAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGGGAGGGAACTCGTTTTGGCGGCCCTGGGACGCTCTGGGAGAGCGGATGGCGGGCGATTGCAGCGCCGCCGCGGTGGACGTAGCGCCATAGCGGCGCCCGGCTCCGGGCCCGGCACGCGCGGTCCCGAAGCCCCGCTCGCGGCTGGCAGCCTTGCGGCTCTCGAGCCCTCGCCACTCTGCTAGCGGAGGTCTTGAGGGTCGCCCGGCGTCCTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGCGCTTTGCCGGGCGTGGGATCCGAGCCTCGGACGCCCTGCGTTGTCGGCCCGGCTTGGGTCCCTAAGGTTCTCTCTTGTCCCCCTTTAAAACTGTAGCTGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.....)))((((..((((((((((((((((((((...)))))..)))...)))))))))))).((((.....))))))))..................................................................
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................412................................................................................................511................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..........................GCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 9.00 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAGCGTGCGGCACGGCCTCGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 34 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCT...................... 27 8 2.38 2.38 0.75 - - 0.25 - 0.62 - - - - 0.12 0.12 0.38 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTCAAGATGAAGGTAGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGTGTCAAGATGAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGGGAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AGGGAACTCGTTTTGGCGGCC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 35 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAGCGGAGGTCTTGAGGGTCGC....................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCCCCTTTAAAACTGTAGCTGAACATC......................................... 31 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTG..................... 28 8 1.88 1.88 - - - - - 0.12 - - - 1.00 0.12 0.38 - 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTG..................... 26 8 1.12 1.12 - - - - - - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ACTAAGTGGAGAAGGATCCGAGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCCCCTTTAAAACTGTAGCTGAACATC......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAGCGGAGGTCTTGAGGGTCG........................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTAAGGTTCTCTCTTGTCCCCCTTTA........................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGATGCGGCGCTTTG............................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGGGAGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTCAAGATGAAGGTAGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGGGACGCTCTGGGAGAGCGGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................CCCTGGGACGCTCTGGGAGAGCGGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ACTAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CACTAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCGGCACGGCCTCGGTCCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGt. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGct 24 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAACTGTAGCTGAACATCTCCTTCCC................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGttg 25 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 37 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGCGt................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGgg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGCTTTGCCGGag...................................................................................................................................... 15 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGCGC................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAAGTCCCGCACTAAGTGGAGAAGGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGGGAGAGCGGATGGCGGGtta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGAGAGCGGATGGCGGGCGATTGCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCc.................. 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTg................... 28 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGTCAAGATGAAGGTAGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCGGCACGGCCTCGGTCCCAGt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 37 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AAGGTAGGCGTCCCCGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAGCGGATGGCGGGCGATTGCAGCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCGGATGGCGGGCGATTGCAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GCCGCCCGAGCCCGAGCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCtgg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGCGC................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GCAGCGCCGCCGCGGTGGACG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGGGACGCTCTGGGAGAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGC.................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 34 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCCTCGCCACTCTGCTAGCGGA...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 10 0.90 0.90 0.90 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGTCAGAAGCTCATCGAG..... 22 10 0.90 0.90 - - - - - - - - - 0.90 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 32 6 0.83 0.83 - - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 6 0.67 0.67 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 9 0.67 0.67 - - - - 0.22 - - - - 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAACATCTCCTTCCCCGCC............................. 21 9 0.67 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCTCGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 8 0.62 0.62 - - - - - 0.12 - - - - - - - 0.12 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCTCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 8 0.62 0.62 - - 0.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGC....................... 26 8 0.62 0.62 - - - 0.25 - 0.12 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGG........................ 25 8 0.62 0.62 - 0.12 - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 5 0.60 0.60 - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 9 0.56 0.56 - - - - - - 0.22 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 28 8 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGG.... 23 10 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.40 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTCCCAGGCGCTCGGCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 6 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTCGTGACGCCTCCCAGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 6 0.33 0.33 - - - - - 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 6 0.33 0.33 - - 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGT... 24 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 22 10 0.30 0.30 - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 25 10 0.30 0.30 - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CGCTCGGCTGTGTCAAGATGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAG.............. 28 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGA................ 25 8 0.25 0.25 - - - - - - 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CGGTCCCAGGCTCGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTC........... 26 8 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGCTCATCGAGGTGGA 18 12 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCT...................... 29 8 0.25 0.25 - - - 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 9 0.22 0.22 - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGT... 25 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
...CTCTTTTTCGTGACGCCTCCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGG. 27 10 0.20 0.20 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 28 10 0.20 0.20 - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAG..... 24 10 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCGGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGG.... 24 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GTGACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGAat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 at 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GGCGCTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGCGCTCGGCTGTGTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 32 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTCGTGACGCCTCCCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - -
...............ACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACGCCTCCCAGGCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -
..............GACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GTGACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 33 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTTTTCGTGACGCCTCCCAGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGCGCTCGGCTGTGTCAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGa.................... 29 a 0.12 1.88 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGg.................... 29 g 0.12 1.88 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTC........... 27 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCT............ 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAG.............. 24 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGA................ 27 8 0.12 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTC................... 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCT...................... 30 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGCCACCGGCTGTCAGAA............... 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGA................ 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACCGGCTGTCAGA................ 18 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGA................ 35 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGC............. 25 8 0.12 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCTCGGCTGTGTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAACATCTCCTTCCCCGCC............................. 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCACCGGCTGTCAGAAGC............. 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCGGCTGTGTCAAGATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCGGCTGTGTCAAGATGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACCGGCTGTCAGAAGCT............ 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGTGTCAAGATGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 23 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACCGGCTGTCAGAAGCTCATC........ 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 24 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAG..... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGTCAGAAGC............. 17 11 0.09 0.09 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGG. 25 11 0.09 0.09 - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 26 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 23 12 0.08 0.08 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 24 12 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGAtaac 27 taac 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGAtta 26 tta 0.08 0.08 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGCCTCTTTTTCGTGACGCCTCCCAGGCGCTCGGCTGTGTCAAGATGAAGGTAGGCGTCCCCGGCCAGGGCCGAGTGAGGCCGCCCGAGCCCGAGCGTGCGGCACGGCCTCGGTCCCAGGCTCGCATAAGTCCCGCACTAAGTGGAGAAGGATCCGAGGCGGGAGGGAACTCGTTTTGGCGGCCCTGGGACGCTCTGGGAGAGCGGATGGCGGGCGATTGCAGCGCCGCCGCGGTGGACGTAGCGCCATAGCGGCGCCCGGCTCCGGGCCCGGCACGCGCGGTCCCGAAGCCCCGCTCGCGGCTGGCAGCCTTGCGGCTCTCGAGCCCTCGCCACTCTGCTAGCGGAGGTCTTGAGGGTCGCCCGGCGTCCTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTAAAATGTCCCGTGGATGCGGCGCTTTGCCGGGCGTGGGATCCGAGCCTCGGACGCCCTGCGTTGTCGGCCCGGCTTGGGTCCCTAAGGTTCTCTCTTGTCCCCCTTTAAAACTGTAGCTGAACATCTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.....)))((((..((((((((((((((((((((...)))))..)))...)))))))))))).((((.....))))))))..................................................................
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................412................................................................................................511................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTA...................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 3.00 2.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACTCTGCTAGCGGAGGTCTTGA.............................................................................................................................................................................................................. 25 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CAGCGCCGCCGCGGggtc....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ggtc 6.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 26 8 4.38 4.38 3.25 - - - - - 0.38 0.12 - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTA...................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGTCCTCAGCATCCCACAGAGCTC........................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 29 8 1.75 1.75 1.38 - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 28 8 1.75 1.75 - - 0.38 - - 0.12 - - - 1.00 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 27 8 1.12 1.12 0.38 - - - - - - 0.12 - - - - 0.12 - 0.12 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 29 10 1.10 1.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - 0.60 - 0.10 - - - - - - - 0.10
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTCGCCCGGCGTCCTCAGCATCCCA................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATt......... 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGT....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCACAGAGCTCCTGTAAAATGTC............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAGATGAAGGTAGGCcaac......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 caac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTAaa...................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACCGGCTGTCAGAAGCTCAtggg.......... 26 tggg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCGGCTGTGTCAAGATtgtg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGCTAGCGGAGGTCTTGAaggc.............................................................................................................................................................................................................. 25 aggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGAt 28 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GCGCCGCCGCGGTGacgg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 acgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCTCGCCACTCTGCTAGCGGAG..................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGACGCCCTGCGTTGTCGGC.................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCCCCTTTAAAACTGTAGCTGA.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAt.................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTAA..................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAGCGTGCGGCACGGCCTCGGTCCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................ACGGCCTCGGTCCCAGGCTCGCATA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCAGCATCCCACAGAGCTCCTGTAA..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 25 8 0.50 0.50 - 0.12 - - 0.25 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CGGCGCCCGGCTCCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCAT......... 28 8 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGA...... 26 9 0.22 0.22 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 28 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGT... 26 10 0.20 0.20 - - 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 28 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACCGGCTGTCAGAAGCTCA.......... 24 8 0.12 0.12 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCCCCGCCACCGGCTGTCAGAAGC............. 28 8 0.12 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 30 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCAGAAGCTCATCGAGGTGGA 26 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -