(1)
OTHER.ip
(12)
OTHER.mut
(4)
OVARY
(3)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(37)
TESTES

Sense strand
AGAGTGATACGCAACTTGGGCAGAAGTACTGCTCCAGTTGTCACTGGACCTCCCCAGAGTAAACTGCCTTTTGATGACCAGGGCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTTCTTATTCAGATCCATGAAGTTAGTGGATGCCTCCCTCCACATAACTGAGATTTGCTGTCTTTTTTCTTTCAGCCCTGTGCCTTTTCCCTTACAGTGTGCCGCGTCCTCAGATACAAACAGTT
.......................................................................................................((((.(((...(((((((..((((((...((((......))))(((((((((........))))).)))).))))))..)))))))...)))))))...................................................
.................................................................................................98....................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
...............................................................................................AATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 32 1 14.00 14.00 2.00 - - - 8.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 25 1 12.00 12.00 - - - - - 1.00 - - 6.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGA................................................................................................................................ 21 1 12.00 12.00 - 3.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGC................................................................................................................................... 18 1 10.00 10.00 - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 35 1 10.00 10.00 8.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGGG.................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 2.00 - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGC...................................................................................................................................................................... 22 1 10.00 10.00 - 5.00 - - - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CGCAACTTGGGCAGAAGT............................................................................................................................................................................................................................... 18 1 9.00 9.00 - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGA................................................................................................................................ 22 1 9.00 9.00 - 5.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 3.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGC................................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 2.00 - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........................................................................................................ACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 21 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGAC............................................................................................................................... 22 1 6.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAAT............................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGAaa.............................................................................................................................. 22 aa 5.00 3.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGACt.............................................................................................................................. 23 t 5.00 6.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGACA.............................................................................................................................. 23 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGGACAGA........................................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGATACGG...................................................................................................................................... 31 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGG.................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGATACGCAACTTGGGCAGA.................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGAC............................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACG....................................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTGAGTGAAATCGTCATGGA............................................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGG....................................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACA.............................................................................................................................. 33 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 34 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGA................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 33 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGAat.............................................................................................................................. 22 at 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGG........................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCGTCATGGACAGATACGGGGCAG................................................................................................................................. 24 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGAC............................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGTGAAATCGTCATGGACA............................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATA......................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CGAATTGAGTGAAAT........................................................................................................................................................ 15 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGATAC........................................................................................................................................ 32 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GAATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGA........................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AATTGAGTGAAATCGTCATGGACA............................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 15 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGCt..................................................................................................................................................................... 23 t 2.00 10.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTGAGTGAAATCGTCATGGACAGAT.......................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTCATGGACAGATACGGGGCAGAC............................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTGGACCTCCCCAGAGTAAACTGCC...................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGTGAAATCGTCATGGACAG............................................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGA........................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGAtt.............................................................................................................................. 22 tt 2.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAG................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAGTGAAATCGTCATGGACAG............................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCGAATTGAGTGAAATCGTCATGG................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGTAAACTGCCTTTTGATG.............................................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................ATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAGTGAAATCGTCATGGACAGATACGG...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAG............................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGA........................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGG...................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGAt............................................................................................................................... 23 t 1.00 9.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAG................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGt................................................................................................................................ 22 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGTGAAATCGTCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CTGCCTTTTGATGACCAGGGC...................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........ACGCAACTTGGGCAGAAGa............................................................................................................................................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGTGAAATCGTCATGGAa.............................................................................................................................................. 18 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GGCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGA............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TGAGATTTGCTGTCTTTTTTCTTTCAG.................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATAC........................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGGA............................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AACTGCCTTTTGATGACCAGGG....................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGttt.................................................................................................................................................................... 24 ttt 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAA............................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCGTCATGGACAGATACGGGGCcgac............................................................................................................................... 26 cgac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGAat.............................................................................................................................. 23 at 1.00 12.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGACAA............................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GGGCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGACA............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAAT............................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGA................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ACCAGGGCGAATTGAGTGAA.......................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGTGAAATCGTCATGGACAGATA......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTGGACCTCCCCAGAGTAAACTG........................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGA............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CGAATTGAGTGAAATCGTCATGGACA............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGATACG....................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGG...................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTCATGGACAGATACGGGGCAGACAA............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTGCCGCGTCCTCAGATACAA...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................GACAGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGACAA............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CTGAGATTTGCTGTCTTTTTTCTTTCAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGaa..................................................................................................................................................................... 23 aa 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTGATGACCAGGGCGAATTGA............................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATGGACAGATACGGGGCAGACAt............................................................................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................AACTGCCTTTTGATGACCAGGGCGA.................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................TGAGTGAAATCGTCATGGACAGATA......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAGACA.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGATACGCAACTTGGGCAGAAGTACT............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGGACAG............................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AGATACGGGGCAGACAATT........................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCAACTTGGGCAGAAGTA.............................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................GATGACCAGGGCGAATTGAG.............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGACCTCCCCAGAGTAAACT......................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGGACA............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAG......................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAGTGAAATCGTCATGG................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGAC.............................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CATGGACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAGTGAAATCGTCATGG................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATCGTCATGGACAGATACGGG..................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AGTTGTCACTGGACCTCCCCAGA................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................ATTGAGTGAAATCGTCATGGA............................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAGTGAAATCGTCATGGACAGAT.......................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AGTTGTCACTGGACCTCCCCAG................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GGACAGATACGGGGCAG................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCATGGACAGATACGGGGCAG................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................ACAGATACGGGGCAGACAATTT.......................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AACTGCCTTTTGATGACCAGGttt..................................................................................................................................................................... 24 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGCGA.................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACTGCCTTTTGATGACCAGGGa...................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CCCAGAGTAAACTGCCTTTTGA................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGAC............................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGGGCGAATTGAGTGAA.......................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGAGTGATACGCAACTTGGGCAGAAGTACTGCTCCAGTTGTCACTGGACCTCCCCAGAGTAAACTGCCTTTTGATGACCAGGGCGAATTGAGTGAAATCGTCATGGACAGATACGGGGCAGACAATTTCTTATTCAGATCCATGAAGTTAGTGGATGCCTCCCTCCACATAACTGAGATTTGCTGTCTTTTTTCTTTCAGCCCTGTGCCTTTTCCCTTACAGTGTGCCGCGTCCTCAGATACAAACAGTT
.......................................................................................................((((.(((...(((((((..((((((...((((......))))(((((((((........))))).)))).))))))..)))))))...)))))))...................................................
.................................................................................................98....................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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mjTestesKO8()
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mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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SRR069809(GSM610965)
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small RNA cloning by length. (testes)
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ovary_rep3. (ovary)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
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SRR029041(GSM433293)
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ovary_rep4. (ovary)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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10 dpp total. (testes)
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mouse ovaries [09-002]. (ovary)
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GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
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small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)