chr4:42452110 42452359 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(52)
TESTES

Sense strand
GACCAGAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGGTATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAATTTTTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGATTCCCCATTGCCTTCCTGGTTTGAGGGGG
.................................................................................................................((.((((...((((.((((....((((...((((...)))).....))))..)))).))))....)))).))(((....))).......................................................
................................................................................................................113....................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 30 10 3.80 3.80 0.90 0.10 - - 0.10 - 0.10 0.20 0.20 - - - 0.20 - - 0.70 - 0.20 - - 0.40 - - - 0.20 - 0.10 - 0.20 - - - - - 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGC....................................................................................................................................................................................................................... 28 10 2.80 2.80 - 0.40 0.10 0.80 0.10 - 0.10 - - - 0.10 0.40 - - - 0.10 0.30 - - - - - - - - - - 0.10 - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - -
.........................AGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGcgt..................................................................................................................................................................................................... 28 cgt 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGt...................................................... 26 t 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGt...................................................... 30 t 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGT..................................................... 27 9 1.89 1.89 - - 0.33 0.22 - - - - - - - 0.33 - - - - 0.11 - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - 0.11 0.22 - - 0.11 - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGC........................................................................................................ 29 10 1.30 1.30 0.40 0.10 - - - - - - 0.20 - - - 0.10 - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACAC.......................................................................................................................................................................................................................... 26 10 1.20 1.20 - - 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - 0.20 - 0.10 - - 0.40 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGG...................................................... 26 9 1.11 1.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - 0.11 - - 0.56 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - -
..............................................TAAGGTATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGt.............................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGC................................................. 31 9 1.00 1.00 0.44 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAAa...................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTtt.................................................................................................... 18 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGc.................................................................................................................................................................................................................. 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGCAAGATTTTTCAgagc.................................. 18 gagc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTtttt....................................................................................................................................................................................................... 27 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GGAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGt...................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACA......................................................................................................................................................................................................................... 26 10 1.00 1.00 - - 0.10 0.30 - - - - - - - 0.20 - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAATGt.................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGc....................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGAGAACACAGCCTAGAGCAGGt............................................................................................................................................................................................................ 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGcgt..................................................................................................................................................................................................... 32 cgt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTtgga......................................................................... 24 tgga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCT..................................................................................................................................................................................................................... 25 10 1.00 1.00 - 0.10 0.10 - - 0.10 - - - 0.20 - - - - 0.10 - 0.10 - 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAATGAAaa................................................................. 32 aa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TACAGACACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGt............................................................................................................................. 32 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAa......................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGacta.................................................................................................................................................................................................................... 26 acta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACA........................................................................................................................................................................................................................... 25 10 0.90 0.90 - - 0.10 0.40 - - - - - - - 0.20 - 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGC....................................................................................................................................................................................................................... 29 10 0.70 0.70 - - - 0.30 - - 0.10 - - - - - 0.10 - - 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAATT........................................................................................................................................................................ 29 9 0.67 0.67 0.11 0.11 - - - - - - 0.22 - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTA........................................................................................................................................................................... 26 9 0.56 0.56 - 0.22 0.22 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGA............................................. 26 9 0.56 0.56 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAA........................................................................ 25 9 0.56 0.56 - 0.11 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTC....................................................................................................................... 28 10 0.50 0.50 - - - 0.10 - - - - - 0.20 - - - 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAG........................................................................................................................................................................................................................ 27 10 0.50 0.50 - - - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - 0.20 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTA.................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.10 - 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTA................................................... 29 9 0.44 0.44 0.11 - - - - - - 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGC................................................. 29 9 0.44 0.44 0.11 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGG...................................................... 27 9 0.44 0.44 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACAC.......................................................................................................................................................................................................................... 25 10 0.40 0.40 - 0.10 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACA......................................................................................................................................................................................................................... 27 10 0.40 0.40 - - 0.10 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACA........................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - -
........GGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGC....................................................................................................................................................................................................................... 27 10 0.40 0.40 - - 0.10 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTT.................................................... 26 9 0.33 0.33 - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTG............................... 26 9 0.33 0.33 - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAG.................................................. 30 9 0.33 0.33 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGG...................................................... 28 9 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGt................................................. 31 t 0.33 0.33 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTA.................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.30 0.30 - - - - 0.10 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAG.............................................................................................................................................................................................................. 27 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGt........................................................................................................ 29 t 0.30 0.30 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 20 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - - 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAG......................................................................................................... 28 10 0.30 0.30 0.10 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGAC............................................................................................................................ 21 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAAC............................................................................................................................................................................................................................ 25 10 0.30 0.30 - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTT......................................... 26 9 0.22 0.22 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAAT......................................................................................................................................................................... 28 9 0.22 0.22 0.11 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGAC............................................................................................................................ 27 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGT..................................................... 29 9 0.22 0.22 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGAT............................ 29 9 0.22 0.22 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TCATGTACAGACACCTAGAGTGGAAC........................................................................................................................................ 26 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGA......................................................................... 24 9 0.22 0.22 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTT.................................................... 30 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACCAGAAGGAATAGGCCAGCAGCGAG............................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAG................................................................................................................................................................................................................... 27 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAG........................................................................................................................................................................................................................ 28 10 0.20 0.20 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGC........................................................................................................ 27 10 0.20 0.20 - - - - 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCC...................................................................................................................................................................................................................... 30 10 0.20 0.20 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTA.............................................................................................................. 23 10 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTA.................................................................................................................... 29 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGt............................................................................................................................................................................................................. 28 t 0.20 0.30 - 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACA........................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.20 0.20 - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCT..................................................................................................................................................................................................................... 29 10 0.20 0.20 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACCT............................................................................................................... 31 10 0.20 0.20 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGt....................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.20 0.50 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCC...................................................................................................................................................................................................................... 28 10 0.20 0.20 - - - 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGAAGCCTGAGGCTAACTTTGG........................................................................................ 22 10 0.20 0.20 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGcgt..................................................................................................................................................................................................... 30 cgt 0.20 0.10 - 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGA........................................................................................................... 26 10 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGa........................................................................................................ 29 a 0.20 0.30 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGAAGCCTGAGGCTAACTTTGGGG...................................................................................... 24 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCC...................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.20 0.20 - 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAG................................................................................................................................................................................................................. 29 10 0.20 0.20 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAA............................................................................................................................................................................................................................. 24 10 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGA.................................................................................................................................................................................................................. 25 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTA................................................... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGATT........................... 30 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGC................................................. 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTGGAAC........................................................................................................................................ 31 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................ACACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGAC............................................................................................................................ 28 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTA................................................... 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAAT...................................................................... 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAAT...................................................................... 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTTTTCATCGGGTGGATTCCCCt...................... 23 t 0.11 0.11 - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTTCATGTACAGACACCTAGAGTGGAACAA...................................................................................................................................... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGT................................ 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGAT............................ 25 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTT........................................ 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTt............................... 31 t 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTT.................................................... 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................AGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGT..................................................... 30 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACC......................................................................................................................... 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTGG........................................................................................................................................... 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGT............................................................................................................................................. 27 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTG............................................................................................................................................ 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACC......................................................................................................................... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TACAGACACCTAGAGTGGAACAATTGTGAA............................................................................................................................... 30 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATCGG.................................. 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTT......................................... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ATTTTTCATCGGGTGGATT........................... 19 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGC................................................. 26 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAt........................................................................ 25 t 0.11 0.22 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCAT..................................... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGGAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTA............................................................ 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGC......................................................... 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................ACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGAC............................................................................................................................ 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAATTTTTTTTTCATGTACAGACACCTA................................................................................................................................................. 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTTTTCATCGGGTGGATTCCCC....................... 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGGGTGGAGCTGTCGGAAATGAATGC................................................................ 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATT........................................... 24 9 0.11 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCga............................................... 31 ga 0.11 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAATTTTT..................................................................................................................................................................... 32 9 0.11 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGATT........................... 26 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAG.................................................. 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTC....................................... 28 9 0.11 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TTTTTTTTTCATGTACAGACACCTAGAG.............................................................................................................................................. 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTGt.............................. 27 t 0.11 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATC.................................... 31 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGA................................................................................................................................................................................................................................ 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGCGAGAACACAGCCTAGAGCAG.............................................................................................................................................................................................................. 23 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................ACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACC................................................................................................................ 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCt....................................................................................................... 30 t 0.10 1.30 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACta........................................................................................................................................................................................................................ 27 ta 0.10 0.40 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGGTAT.................................................................................................................................................................................................... 32 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTT........................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACCAGAAGGAATAGGCCAGCA.................................................................................................................................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GAAGCCTGAGGCTAACTTTG......................................................................................... 20 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAG........................................................................................................................................................................................................ 27 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAGGTATGGAAATGTCTTAGCTCAG.................................................................................................................................................................................. 26 10 0.10 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGG............................................................................................................................................................................................................. 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACAa.......................................................................................................................................................................................................................... 26 a 0.10 0.90 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACC................................................................................................................ 30 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAG.............................................................................................................................................................................................................. 28 10 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACA......................................................................................................................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAG............................................................................................................................................................................................................................... 20 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGA.................................................................................................................................................................................................................. 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGA.............................................................................................................................................................................................................................. 22 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTT.......................................................................................... 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAAC............................................................................................................................................................................................................................ 24 10 0.10 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAtt....................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 0.10 1.00 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGACA........................................................................................................................... 22 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTCT...................................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTTAAACCTATGAAGCCTGAGGC................................................................................................. 24 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGC.............................................................................................................................................................................. 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGC........................................................................................................ 30 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCT............................................................................................................................................................................ 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCC............................................................................................................................................................................. 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACtt........................................................................................................................................................................................................................ 29 tt 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGACAa.......................................................................................................................... 23 a 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTG......................................................................................... 30 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GTGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACC................................................................................................................ 31 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCCTG..................................................................................................... 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACC......................................................................................................................... 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GGCCAGCAGCGAGAACACAGCCT..................................................................................................................................................................................................................... 23 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................ATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGG............................................................................................................................................................................... 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCC...................................................................................................................................................................................................................... 29 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10
.........................................................................................................GAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTC....................................................................................................................... 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTGG........................................................................................ 30 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGC.................................................................................................................................................................................................................................. 19 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAG........................................................................................................................................................................................................ 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTC....................................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - -
...................................................................................................................................TTAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTT.......................................................................................... 29 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGC................................................................................................. 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAAATGTCTTAGCTCAGTG................................................................................................................................................................................ 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGt........................................................................................................... 26 t 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GGCCAGCAGCGAGAACACAGC....................................................................................................................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGt................................................................................................................................................................................................................ 30 t 0.10 0.20 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 29 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACAa.......................................................................................................................................................................................................................... 25 a 0.10 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGG............................................................................................................................................................................................................. 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCa....................................................................................................... 30 a 0.10 1.30 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CAGAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACA........................................................................................................................................................................................................................... 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CAGAAGGAATAGGCCAGCAGCGAG............................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTGAAGACACCTCTTAAACCTA.............................................................................................................. 22 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATG............................................................................................................ 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATAGGCCAGCAGCGAGAACAC.......................................................................................................................................................................................................................... 22 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - -
........GGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCa..................................................................................................................................................................................................................... 29 a 0.10 0.20 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 31 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTG......................................................................................... 29 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - -
..............................................................................................................................ACCTCTTAAACCTATGAAGCC....................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAA............................................................................................................................................................................................................................. 23 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AGGCCAGCAGCGAGAACA........................................................................................................................................................................................................................... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCCTGt.................................................................................................... 32 t 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCtt..................................................................................................................................................................................................................... 30 tt 0.10 2.80 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACC................................................................................................................ 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TATGAAGCCTGAGGCTAACTTTGGGGT..................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGA.............................................................................................................................................................................................................................. 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - -
....................................................................................................................................TAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTGGGG...................................................................................... 32 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACAC.......................................................................................................................................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGa............................................................................................................................................................................................................ 26 a 0.10 0.10 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGAACAATTGTGAAGACACCTCTT..................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTt.................................................................................................................... 26 t 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AGAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTA.................................................................................................................... 30 10 0.10 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCCT...................................................................................................... 30 10 0.10 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAAC................................................................................................................. 29 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAt........................................................................................................................................................................................................................ 27 t 0.10 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAGGTATGGAAATGTCTTAGCTCA................................................................................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAA.......................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GACCAGAAGGAATAGGCCAGCAGCGAGAACACAGCCTAGAGCAGGCTAAGGTATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAATTTTTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTGGAACAATTGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGCCTGAGGCTAACTTTGGGGTGGAGCTGTCGGAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCAAGATTTTTCATCGGGTGGATTCCCCATTGCCTTCCTGGTTTGAGGGGG
.................................................................................................................((.((((...((((.((((....((((...((((...)))).....))))..)))).))))....)))).))(((....))).......................................................
................................................................................................................113....................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...................................................................................................................................................................................................................TCGGGTGGATTCCCCATTGCCTTa............... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTTTTTTTTCATGTACAGACACCTAaa................................................................................................................................................. 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CTTAAACCTATGAAGCcgg........................................................................................................ 19 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GTCTTAGCTCAGTGGCCTAATTTTTTTTTCA............................................................................................................................................................... 31 9 0.11 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTTTTCATGTACAGACACCTAGAGTGGA.......................................................................................................................................... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GATTCCCCATTGCCTTCCTGGTTTGA..... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CCTAATTTTTTTTTCATGTACAGACACC................................................................................................................................................... 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGGAAATGTCTTAGCTCAGTGGCCTAA.......................................................................................................................................................................... 29 9 0.11 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAAATGAATGCAGTAAGCTGGTTAGCA................................................ 27 9 0.11 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTTCATCGGGTGGATTCCC........................ 19 9 0.11 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AATTTTTTTTTCATGTACAGACA..................................................................................................................................................... 23 9 0.11 0.11 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CGGGTGGATTCCCCATTGCCTT............... 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - -
..................................................................................................................AATTGTGAAGACACCTCTTAAACCTA.............................................................................................................. 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 -
...............................................................................................................................CCTCTTAAACCTATGAAGC........................................................................................................ 19 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AATTGTGAAGACACCTCTTAAACCTATGAAGC........................................................................................................ 32 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -