(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
AGCCCGGCCTGCCGCAGCTACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCACGTAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGCGGCGGTTGGTTGCCCGCTCTCTGGCTTTCATGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGAGCACGGCGACACCGAGAACCTGCGGGTGACGGGAAACCTGCTCCGTTACCCGGAGACCCGCCCGACCCCTCCTGACCTCGCGCATCACCGAGCCTGCACCTGTGGGGAGAGCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTC.......................................................................................................................................................................................................... 30 1 21.00 21.00 - 4.00 10.00 - - - - 2.00 1.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGG............................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCT........................................................................................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGC........................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGC............................................................................................................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................AAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGaa.......................................................................................................................................................................... 28 aa 4.00 5.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGCGG......................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GACCTCGCGCAacgg.......................... 15 acgg 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCATGCCGGACTCTCTCCCTGCCGT....................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAACC.............................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCTGACCTCGCGCATCACCGAGCCT................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................TCTGCTCGGCTCACGTAAGTGCGGGC............................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGCGt......................................................................................................................................................................... 26 t 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGa............................................................................................................................................................................. 26 a 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGA.................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCGGACTCTCTCCCTGCCGa....................................................................................................................... 22 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGG................................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACG................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAACCT............................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAAC............................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................................AAGTGCGGGCTACACAGGCGGGA............................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAG.............................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGAC.................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGCCGCAGCTACCTCAGCACCCGCAGC...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.............................................................................................................TGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGcg................................................................................................................. 28 cg 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACCTCGCGCATCACCGAGCCTGCAC............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGt............................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCTGACCTCGCGCATCACCGAGCC.................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACCTCGCGCATCACCGAGCCTGC................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................ATGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGAG................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTTGCCCGCTCTgtgc................................................................................................................................................... 16 gtgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTGCGGGCTACACAGGC................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAG.............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAACCTGC........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGGCCTGCCGCAGCTACCTCAGCACCCGC......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACCTCGCGCATCACCGAGCCTGCA................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCT................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCAC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGGCCTGCCGCAGCTACCTCAGa............................................................................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................CGAGCACGGCGACACCGAGAACCTGC........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGCGACACCGAGAACCTGCGGGTGACG................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCACGga..................................................................................................................................................................................................... 31 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................CAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCAC........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCTGACCTCGCGCATCACCGAGCCT................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAAt............................................................................................... 25 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGACGAGCACGGCGACACCGAGAA................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCTGACCTCGCGCATCACCGAGC..................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTt.......................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCcca......................................................................................................................................................................................................... 27 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................................................TAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGac........................................................................................................................................................................... 28 ac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CAGCTACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTC............................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGA............................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTCATGCCGGACTCTCTCCCTG........................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CAGCTACCTCAGCACCCGCAGCTCTG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCACCGAGCCTGCACCTGTGGG........ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGAGC................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGCCCGGCCTGCCGCAGCTACCTCAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCACGTAAGTGCGGGCTACACAGGCGGGAGGGCGGCGGTTGGTTGCCCGCTCTCTGGCTTTCATGCCGGACTCTCTCCCTGCCGTGACGAGCACGGCGACACCGAGAACCTGCGGGTGACGGGAAACCTGCTCCGTTACCCGGAGACCCGCCCGACCCCTCCTGACCTCGCGCATCACCGAGCCTGCACCTGTGGGGAGAGCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
.............................CCGCAGCTCTGCTCGGCTCACGT...................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGCACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ACCCGCAGCTCTGCTCGGCTCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCAGCTACCTCAGCAtcc.............................................................................................................................................................................................................................. 18 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CCTGTGGGGAGAGCACgt 18 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCACCGAGCCTGCACCTGTGGGGAGA.... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCTGCTCGGCTCACGTAAGTGCGGGCTA.......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CCCGCCCGACCCCTCCctg.......................................... 19 ctg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTGCCGCAGCTACCTCAGCACCCGC......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -