(7)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(28)
TESTES

Sense strand
GGACGCTGGGAGGAGAGCCCCTGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGGCAATGCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGAGAGATCGGCCAGGAGACTGACGGCGGGGCAATACCTAGGGGGGTGGGAGGGGGAAGCAGACAGGAGAGCACTCAAAATAAAAGGCTCTTTACAGATTTTTTTATTTTGTATAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAATGAACATGTCAGTGTTG
......................................................(((((..(((.......((((....))))))).......(((..(((....))).)))..))))).....................................................................................................................................
..................................................51...........................................................................128..........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGC............................................................................................................................................................................................................ 27 1 36.00 36.00 - - 10.00 - 1.00 7.00 5.00 - 2.00 3.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAACACGTAGCGACTCCGAAGATC......................... 26 1 18.00 18.00 7.00 - - - 8.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................TGCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGG........................................................................................................................................................................... 27 1 16.00 16.00 1.00 4.00 4.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGC.......................................................................................................................................................................... 25 1 11.00 11.00 2.00 - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - -
............................................................ACCCTGGATGTAGCTGAGA............................................................................................................................................................................. 19 1 10.00 10.00 - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGGC........................................................................................................................................................................................................ 26 1 9.00 9.00 - 5.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGG....................................................................................................................................................................... 28 1 9.00 9.00 - - 2.00 - - 3.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGC.............................................................................................................................................................................................................. 25 1 8.00 8.00 - - 2.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................TGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGA................................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 4.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGAG.................................................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 2.00 - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGG........................................................................................................................................................................... 24 1 7.00 7.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGA........................... 26 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................TGCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGC.......................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGG............................................................................................................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 1.00 - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................ACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGG....................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGC.......................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCA........................................................................................................................................................................................................... 23 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCT......................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCG............................................................................................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGATC......................... 28 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TATTTTGTATAGAGAACACGTAGCGAC................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAACCCTGGATGTAGCTGAGA............................................................................................................................................................................. 21 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCG............................................................................................................................................................................................................. 22 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAG............................ 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAAT................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAG.......................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGAGA................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCA........................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAATG............... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAACACGTAGCGACTCCGAAGATC......................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGGGAGGAGAGCCCCTGAGCTAGGAGC........................................................................................................................................................................................................................... 27 2 2.50 2.50 - 1.00 - 0.50 - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGC...................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGCAATGCTCAACCCTGGATGTAGCTG................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGGCTGGGAGAGAGATCGG........................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAACACGTAGCGACTCCGA.............................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GTATAGAGAACACGTAGCGACTC................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTATAGAGAACACGTAGCGACTCCGAA............................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAACCCTGGATGTAGCTGAGAGG........................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGt............................................................................................................................................................................................................ 27 t 2.00 5.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAG................................................................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GTAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAAT................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCCC.................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AGAGATCGGCCAGGAGACTGACGGC........................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAGCTGGGAGCAGAGGCG............................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAGAGGCTGGGAGAGAGATCGGC.......................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTGAGAGGCTGGGAGAGA................................................................................................................................................................. 18 3 1.67 1.67 - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGCGACTCCGAAGATCAGCCC.................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACTGACGGCGGGGCAATACCTAGG............................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCC..................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGA................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTG........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TATTTTGTATAGAGAACACGTAGCGACT.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGA................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GGAGAGAGATCGGCCAGGAGACTGAa.............................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAACACGTAGCGACTCCGAAGA........................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TAGAGAACACGTAGCGACTCCGAA............................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TTATTTTGTATAGAGAACACGTAGCGAC................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................ATGCTCAACCCTGGATGTAG................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGAT.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................GAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGG............................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......TGGGAGGAGAGCCCCTGAGCTAGGAGa........................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGa......................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAG.................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TTATTTTGTATAGAGAACACGTAGCG..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTaa....................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCA........................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAG.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................CAACCCTGGATGTAGCTGA............................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGtc........................................................................................................................................................................................................... 28 tc 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGtc.......................................................................................................................................................................... 25 tc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................ACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTG........................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGAGGCGCAGGCAATGCTCAACCCTG.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................AGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGa............................................................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AACCCTGGATGTAGCTGA............................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CTGGATGTAGCTGAGAGG........................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................CCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGG....................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGag........................................................................................................................................................................................................ 26 ag 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGC...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................ACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCCCC................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTG................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGACGGCGGGGCAATACCTAGGGGG......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGt....................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................ATCGGCCAGGAGACTGACG............................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAG....................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GGAGAGAGATCGGCCAGGAGACTGAC.............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................GGAGAGAGATCGGCCAGGAGACTGACG............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGA............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................ACGTAGCGACTCCGAAGATCAGC...................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGG............................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAG.................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAa.......................................................................................................................................................................................................... 24 a 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGCAATGCTCAACCCTGGATGTAGCTG................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCt............................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 8.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TAGCTGAGAGGCTGGGAGAGAGATCGGt.......................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGAGAGATCGGCCAGGAGACTGACGGC........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGGa........................................................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAG.................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GACTGACGGCGGGGCAATACCTAG............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAA................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTATAGAGAACACGTAGCGACTCCGt.............................. 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCCC.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGGCAtt..................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGa............................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAGAGGCTGGGAGAGAGATCGGCCA........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGC............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAGAGATCGGCCAGGAGACTGACGG............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCaa........................................................................................................................................................................ 27 aa 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTGAGAGGCTGGGAGAGAGA............................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
......TGGGAGGAGAGCCCCTGAGCTAGGA............................................................................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGGAGAGCCCCTGAGC.................................................................................................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGATCAGCCCCAATGAACATGTCAGTGT.. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GAGAGAGATCGGCCAGGA..................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
..........................TAGGAGCTGGGAGCAGA................................................................................................................................................................................................................. 17 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTTTACAGATTTTTTT............................................................. 17 11 0.09 0.09 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGACGCTGGGAGGAGAGCCCCTGAGCTAGGAGCTGGGAGCAGAGGCGCAGGCAATGCTCAACCCTGGATGTAGCTGAGAGGCTGGGAGAGAGATCGGCCAGGAGACTGACGGCGGGGCAATACCTAGGGGGGTGGGAGGGGGAAGCAGACAGGAGAGCACTCAAAATAAAAGGCTCTTTACAGATTTTTTTATTTTGTATAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAATGAACATGTCAGTGTTG
......................................................(((((..(((.......((((....))))))).......(((..(((....))).)))..))))).....................................................................................................................................
..................................................51...........................................................................128..........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
...........................................................................................................................................................AGCACTCAAAATAAAAGGCTCTTTACA...................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GGCTCTTTACAGATTTTTTTATTTTGTA..................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCGAAGATCAGCCCCAATGAACATGTCA...... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CTCCGAAGATCAGCCCCAATGAACATGTC....... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGCGACTCCGAAGATCAGCCCCAATGA.............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCGAAGATCAGCCCCAATGAACAT.......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTATAGAGAACACGTAGCGACTCCGAAGA........................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GCGACTCCGAAGATCAGCCCCAATGAACA........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -