| Gene: Hiat1 | ID: uc008rco.1_intron_7_0_chr3_116348399_r.3p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(6) OTHER.mut |
(2) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(30) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) |
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| .............................TACATTTTCGCAGTAACTGGCCTAGGACT................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................TACAGATGTGATCATTTATGCATTGTC..................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TACATTTTCGCAGTAACTGGCCTAGGAC................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................TGCATTGTCCTGGAAAGCTCCTGGCTGAA................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................................................................................................................................................................................................................................GGGGTTTTTGCAGTAACC.... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAAGTGATGGTGCGTGTACTAACCAG............................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TTGTCCTGGAAAGCTCCTGGCTGAAATGA............................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TGCATTGTCCTGGAAAGCTCCTGGCTG................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................TATACATTTTCGCAGTAACTGGCCTAGGACT................................................................................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TGAAATGAGTTGTTCGTACTGTAACTAAT........................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TAGGACTTACAGATGTGATCATTTATt............................................................................................................................................................................ | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CTTTGCTGTTATCTCT............................ | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 |
| GAGCTGCTAGGGAGGGTCATTTCTAGCTATACATTTTCGCAGTAACTGGCCTAGGACTTACAGATGTGATCATTTATGCATTGTCCTGGAAAGCTCCTGGCTGAAATGAGTTGTTCGTACTGTAACTAATAGGCAGGGGAAGCATTTTAAGTGATGGTGCGTGTACTAACCAGGTTTTCTTGCTTGCCTTTCATTCTTAGGTGGTACTTTGCTGTTATCTCTGTTTCTGGGGTTTTTGCAGTAACCTTCT ................................................(((((....(((((((((.(((.((((((.....(((..(((....))).)))....)))))).)))))).))))))....))))).................................................................................................................... ..............................................47..........................................................................................139............................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) |
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