(10)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(31)
TESTES

Sense strand
TGACTGGGAAATCGTTGGCATTAGAATTAGAAGCAAACCAGCTAGCTAGTGCCTGCATGTATTTTGCTCCCAGTAAAATCAAGGCTTTTTACAATGAGTAGGCTCTGACACATACGCAGGAGGCACTCATGGTTCCTGTGGGGCTGAATTGCTGATGATTTAAAAGGCTTTGGTATTTTGTTTGGCTTTCTGCCCTTCAGGTTTATACAACCTCCTACCCGAGTTTACAGCAGGAGAAGGTGCTCAAGTT
...................................................................................................(((((..((((....((((((((.((....)).))))))))..((..((..(((............)))))..))....)))).)))))..............................................................
.........................................................................................90..................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
..............................................................................................TGAGTAGGCTCTGACACATACGCAGG.................................................................................................................................. 26 1 12.00 12.00 - - - - - 4.00 4.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................TGAGTAGGCTCTGACACATACGCAGGA................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TAAAAGGCTTTGGTATTTTGTTTGGC................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TACAATGAGTAGGCTCTGACACATACGCAG................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................................TGGTTCCTGTGGGGCTGAATTGCTGA............................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CTTTCTGCCCTTCAGaggt.............................................. 19 aggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TACCCGAGTTTACAGCAGGAGAAGGTGCTC..... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................ACAATGAGTAGGCTCTGACACATACGC..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGCATTAGAATTAGAAGCAAACCAGC................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TACAACCTCCTACCCGAGTTTACAGCA.................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TAGCTAGTGCCTGCATGTATTTTGCTCC.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................AGTAGGCTCTGACACATACGCAGGAG................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TTCCTGTGGGGCTGAATTGCTGATGATT.......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTAAAAGGCTTTGGTATTTTGTTTGGC................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TACCCGAGTTTACAGCAGGAGAAGGTG........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCTGCCCTTCAGGTTTATACAACCTCCTACC............................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................TGACACATACGCAGGAGGCACTCATGGT..................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCAAGGCTTTTTACAATGAGTAGGCTCTGA.............................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCCTACCCGAGTTTACAGCAGGAGAAGGTGt....... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAGTAGGCTCTGACACATACGCAGGAGG............................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTGACACATACGCAGGAGGCcata.......................................................................................................................... 25 cata 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GCAGGAGAAGGTGCTCA.... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................ACAGCAGGAGAAGGTGCTCA.... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGTTTATACAACCTCCTACCCGAGTTTA....................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGACTGGGAAATCGTTGGCATTAGAATTAGAAGCAAACCAGCTAGCTAGTGCCTGCATGTATTTTGCTCCCAGTAAAATCAAGGCTTTTTACAATGAGTAGGCTCTGACACATACGCAGGAGGCACTCATGGTTCCTGTGGGGCTGAATTGCTGATGATTTAAAAGGCTTTGGTATTTTGTTTGGCTTTCTGCCCTTCAGGTTTATACAACCTCCTACCCGAGTTTACAGCAGGAGAAGGTGCTCAAGTT
...................................................................................................(((((..((((....((((((((.((....)).))))))))..((..((..(((............)))))..))....)))).)))))..............................................................
.........................................................................................90..................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
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.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgtta............................... 20 gtta 16.00 0.00 5.00 4.00 - 2.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCga............................... 18 ga 7.00 0.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACCggtt............................... 19 ggtt 5.20 0.00 0.20 0.60 - 1.20 2.80 - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTgttt.................................. 17 gttt 4.00 0.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCgtta................................... 16 gtta 3.00 0.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgtag............................... 20 gtag 3.00 0.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCggt............................... 19 ggt 3.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACgtta................................ 19 gtta 2.60 0.00 1.20 1.00 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCCGAgt............................ 21 gt 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgtaa............................... 20 gtaa 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTAgtaa................................. 18 gtaa 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgtca............................... 20 gtca 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgttc............................... 20 gttc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTATACAACCTCCTACCtttt............................... 21 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACC............................... 15 5 1.00 1.00 - - 0.20 0.60 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTgtta.................................. 17 gtta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCgtag................................... 16 gtag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgct............................... 19 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgc............................... 18 gc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTTATACAACCTCCTAC................................ 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTAggtt................................. 17 ggtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTATACAACCTCCTACCa............................... 19 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTTATACAACCTCCTACC............................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACCCGAggtg............................ 22 ggtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTAgtcg................................. 18 gtcg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTAgttc................................. 18 gttc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCCGActt............................ 22 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTAgtat................................. 18 gtat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCgta............................... 19 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCCgt.............................. 19 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACCCGAgtt............................ 22 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTATACAACCTCCTA................................. 15 4 0.75 0.75 - - - - 0.25 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACCggt............................... 18 ggt 0.60 0.00 - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTATACAACCTCCTAttt................................. 18 ttt 0.25 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25
..........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACCtt............................... 17 tt 0.20 0.00 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACttta................................ 19 ttta 0.20 0.00 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACggt................................ 18 ggt 0.20 0.00 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ATACAACCTCCTACCtgt............................... 18 tgt 0.20 0.00 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACgta................................ 18 gta 0.20 0.00 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTAC................................ 15 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACgaa................................ 18 gaa 0.20 0.00 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TATACAACCTCCTACgtaa................................ 19 gtaa 0.20 0.00 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -